一种系统生物学建模语言的研制
| 摘 要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 1 绪论 | 第8-19页 |
| ·系统生物学发展概况 | 第8-9页 |
| ·系统生物学相关软件应用的现状 | 第9-15页 |
| ·问题的提出 | 第15-17页 |
| ·主要研究内容 | 第17-19页 |
| 2 B语言设计的技术路线 | 第19-29页 |
| ·SBML中的模型结构 | 第19-22页 |
| ·高级语言编译解释技术 | 第22-26页 |
| ·设计模式 | 第26-27页 |
| ·编译器自动生成工具 | 第27-28页 |
| ·开发环境 | 第28页 |
| ·小结 | 第28-29页 |
| 3 B语言及其解释器的设计与实现 | 第29-42页 |
| ·B语言需求分析 | 第29-34页 |
| ·B语言解释器的系统设计 | 第34-35页 |
| ·JavaCC的使用方法 | 第35-36页 |
| ·用JavaCC开发B语言解释器的过程 | 第36-41页 |
| ·小结 | 第41-42页 |
| 4 仿真环境的构建与应用 | 第42-51页 |
| ·解释器对数学模型的转换 | 第42-43页 |
| ·数值算法库的应用 | 第43-44页 |
| ·基于JNI的算法参数接口 | 第44-46页 |
| ·仿真结果的可视化 | 第46-47页 |
| ·应用举例 | 第47-50页 |
| ·小结 | 第50-51页 |
| 5 总结 | 第51-52页 |
| 致 谢 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 附录 1 攻读学位期间发表论文目录 | 第56-57页 |
| 附录 2 技术资料文档及程序 | 第57-59页 |
| 附录 3 B语言EBNF | 第59-61页 |
