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水稻抗白叶枯Xa4基因及其等位基因的克隆以及相关基因家族的分析

摘要第1-8页
1 文献综述-植物抗病基因研究进展第8-32页
   ·植物病原物和其致病相关基因第8-9页
   ·寄主植物的抗病机制第9-10页
   ·植物和病原微生物相互作用的遗传基础第10-11页
   ·植物抗病基因的克隆第11-14页
     ·图位克隆法第11-13页
     ·转座子标签法第13页
     ·同源序列法第13-14页
   ·已克隆的植物抗病基因及其结构特点第14-17页
   ·NBS-LRR类抗病蛋白质的结构和功能特点第17-20页
     ·LRR的结构和功能第17-18页
     ·NBS结构和功能第18页
     ·TIR结构和功能第18-19页
     ·CC结构和功能第19页
     ·启动抗病反应所需要的其它的基因第19-20页
   ·植物受体激酶结构和功能第20-25页
     ·植物受体激酶的结构特点第21-23页
     ·体内植物受体激酶模型第23-24页
     ·PLK的信号转导第24页
     ·Xa21研究进展第24-25页
   ·抗病基因家族及其演化第25-27页
   ·抗病基因编码产物和无毒基因产物的相互作用第27-30页
     ·和无毒基因产物或间接产物作用的LRR结构域第27-29页
     ·R蛋白和激发子的相互作用第29-30页
   ·水稻抗白叶枯基因Xa4第30-32页
2 研究目的和意义第32-33页
3 材料和方法第33-37页
   ·定位群体和接种鉴定第33页
   ·DNA的提取和杂交第33页
   ·Xa4区段物理图谱的构建第33页
   ·Xa4基因的精细定位第33-34页
   ·总RNA的抽提第34页
   ·RT-PCR(Reverse transcription-PCR)分析第34页
   ·Race(Rapid amplification of cDNA end)分析第34-35页
   ·BAC克隆的Shotgun测序第35-36页
     ·BAC克隆Shotgun文库的构建第35页
     ·随机亚克隆片段的两端测序第35页
     ·原始序列的拼接第35-36页
   ·BAC克隆的序列分析第36页
   ·依赖PCR的基因组测序分析第36页
   ·农杆菌介导的转化第36-37页
4 结果与分析第37-71页
   ·Xa4基因的遗传定位第37页
   ·Xa4基因的精细定位和局部物理图谱的建立第37-40页
   ·明恢63-3H8 BAC的测序及分析第40-42页
   ·突变体的分析第42-44页
   ·IRBB4/RKa的获得第44页
   ·特青(TQ)/RKa和IRBB4/RKa的序列完全相同第44-45页
   ·IRBB4/Rka,RKb的表达和结构分析第45-49页
   ·基因的转化和Xa4基因显性的逆转第49页
   ·明恢63的RKa和RKb基因第49-52页
   ·转明恢63/Rkb的单株表现出对水稻白叶枯病原小种PXO61很强的抗性第52-54页
   ·IRBB3/RKa、RKb和扎昌龙/RKa、RKb基因区段的分析第54-57页
   ·IR24/RKa和IRBB4/RKa、明恢63/Rka对比分析第57-58页
   ·明恢63/3H8抗病基因家族的组织结构第58-59页
   ·特青/26N11抗病基因家族的组织结构第59-60页
   ·明恢63/3H8和特青/26N11对比分析第60-61页
   ·特青和93-11的关系第61-63页
   ·不同基因家族RKa、RKb和RKc基因的对比分析第63-67页
   ·两类受体激酶的对比分析第67-71页
5 讨论第71-80页
   ·Xa4基因的定位第71页
   ·遗传距离和物理距离的关系第71-72页
   ·全基因组测序完成之后的图位克隆第72-73页
   ·抗病RLK和细菌性病原菌无毒基因产物互作的细胞定位第73-74页
   ·Xa22、Xa3和Xa4基因的关系第74页
   ·遗传背景对水稻抗白叶枯病基因的影响第74-75页
   ·等位抗病基因在育种中的应用第75-76页
   ·利用基因重组建立广谱,高抗的全生育期抗病基因第76页
   ·Xa4基因家族的形成第76-78页
   ·抗病基因演化机理第78页
   ·同源重组可能是造成93-11/RKe2和RKb变异的主要原因第78-80页
6 小结第80-81页
7 参考文献第81-90页
Abstract第90-92页
附录1 Primers used in this paper第92-94页
致谢第94页

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