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家鹅细胞色素b基因序列进化及系统发育关系研究

摘要第1-5页
1 前言第5-17页
   ·线粒体DNA第5-8页
     ·动物mtDNA的结构组成第5-6页
     ·mtDNA的遗传特性第6页
     ·鸟类mtDNA的结构特征第6-8页
   ·mtDNA细胞色素b及cyt b基因第8-10页
     ·mtDNA细胞色素b的结构、功能第8-9页
     ·细胞色素b基因第9-10页
   ·mtDNA Cyt b基因在鸟类系统进化研究中的应用第10-13页
     ·研究鸟类的进化特征第10-11页
     ·研究鸟类系统发育关系第11-12页
     ·分析种群的地理分布模式第12-13页
   ·家鹅的起源与系统进化研究第13-16页
     ·家鹅的起源、分类及分布第13-15页
     ·家鹅分子进化与系统发育研究第15-16页
   ·实验目的和意义第16-17页
2 材料与方法第17-25页
   ·材料来源第17-18页
   ·所用仪器和试剂第18页
     ·使用的主要仪器第18页
     ·试剂第18页
   ·试验方法第18-23页
     ·mtDNA的提取与纯化第18-19页
     ·目的DNA片段的扩增第19-21页
     ·PCR产物的回收纯化第21-22页
     ·测序反应及DNA序列测定第22-23页
   ·数据处理第23-25页
3 结果分析第25-48页
   ·mtDNA细胞色素b基因变异位点及单倍型分析第25-33页
     ·家鹅mtDNA细胞色素b序列变异位点第25-26页
     ·家鹅单倍型频率及分布第26-33页
   ·家鹅细胞色素b基因碱基组成与密码使用第33-36页
     ·碱基组成第33-34页
     ·密码子使用频率第34-36页
   ·转换与颠换第36-37页
     ·转换与颠换模式第36-37页
     ·密码子不同位点与p-距离关系第37页
   ·同义替换与非同义替换第37-43页
     ·Cyt b基因序列同义替换和非同义替换的估计第37-39页
     ·非同义密码子替换第39-40页
     ·单步非同义替换(SSNCS)第40-43页
   ·系统发育分析第43-48页
     ·邻接树(NJ树)第43-46页
     ·最大简约树第46页
     ·邻接树、最大简约树的比较第46-48页
4 讨论第48-57页
   ·细胞色素b基因序列进化第48-53页
     ·细胞色素b基因序列的变异模式第48-50页
     ·净化选择(purifying selection)第50-53页
   ·Cyt b基因作为分子遗传标记第53-54页
   ·家鹅的系统发育关系第54-57页
5 结论第57-58页
6 参考文献第58-70页
英文摘要第70-72页
致谢第72页

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