DNA自组装计算模型研究及其在图着色问题中的应用
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-21页 |
| ·选题背景及意义 | 第12-14页 |
| ·国内外研究现状和已有成果 | 第14-19页 |
| ·DNA 计算国际研究进展 | 第14页 |
| ·DNA 计算国内研究进展 | 第14-15页 |
| ·DNA 自组装技术研究进展 | 第15-18页 |
| ·二维DNA 瓦片组装模型研究进展 | 第18页 |
| ·图着色问题的DNA 计算方法研究进展 | 第18-19页 |
| ·论文的研究思路和主要工作 | 第19-20页 |
| ·论文的结构 | 第20-21页 |
| 第2章 DNA 自组装计算模型研究 | 第21-33页 |
| ·ADLEMAN 的开创性实验 | 第21-23页 |
| ·DNA 自组装的形式语言文法定义 | 第23-25页 |
| ·线性自组装等价于正则语言 | 第25-26页 |
| ·树状自组装等价于上下文无关语言 | 第26-28页 |
| ·二维自组装等价于图灵可识别语言 | 第28-29页 |
| ·一种二维自组装抽象模型 | 第29-32页 |
| ·Wang 的瓦片覆盖理论 | 第29-30页 |
| ·瓦片组装模型的形式化表示 | 第30-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第3章 一种三维 DNA 自组装计算模型 | 第33-37页 |
| ·三维DNA 瓦片构造 | 第33页 |
| ·模型的抽象几何结构 | 第33-34页 |
| ·模型的数学表示 | 第34-36页 |
| ·本章小结 | 第36-37页 |
| 第4章 枚举型三维 DNA 自组装图着色模型 | 第37-45页 |
| ·图着色问题 | 第37页 |
| ·图着色非确定性算法 | 第37-38页 |
| ·邻接表与着色表 | 第38-39页 |
| ·三维瓦片设计 | 第39-41页 |
| ·自组装过程 | 第41-44页 |
| ·种子配置 | 第41-42页 |
| ·成功组装示例 | 第42-43页 |
| ·失败组装示例 | 第43-44页 |
| ·模型正确性分析 | 第44页 |
| ·模型复杂性分析 | 第44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第5章 非枚举型三维DNA 自组装图着色模型 | 第45-58页 |
| ·图着色问题 | 第45-46页 |
| ·自组装算法设计 | 第46-48页 |
| ·剪枝回溯图着色算法 | 第46页 |
| ·基于有序邻居的顶点排序算法 | 第46-47页 |
| ·带剪枝策略的非确定性图着色算法 | 第47-48页 |
| ·算法模拟 | 第48-50页 |
| ·自组装系统设计 | 第50-53页 |
| ·有限瓦片集合 | 第50-52页 |
| ·粘结强度函数 | 第52页 |
| ·阀值温度 | 第52-53页 |
| ·自组装系统验证 | 第53-57页 |
| ·模型复杂性分析 | 第57页 |
| ·本章小结 | 第57-58页 |
| 结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
