| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-28页 |
| 1.1 引言 | 第13-14页 |
| 1.2 嗜盐放线菌分类研究 | 第14-17页 |
| 1.3 嗜盐微生物嗜盐机制研究 | 第17-19页 |
| 1.3.1 离子转运系统 | 第17-18页 |
| 1.3.2 渗透保护物 | 第18-19页 |
| 1.4 嗜盐微生物组学研究 | 第19-22页 |
| 1.5 嗜盐放线菌的应用 | 第22-25页 |
| 1.5.1 抗生素、抗病毒、抗肿瘤化合物 | 第22-24页 |
| 1.5.2 酶制剂 | 第24页 |
| 1.5.3 渗透保护物 | 第24页 |
| 1.5.4 生物修复 | 第24-25页 |
| 1.5.5 其他潜在应用 | 第25页 |
| 1.6 立题依据及研究内容 | 第25-28页 |
| 第二章 放线菌新种AFM10111~T多相分类学鉴定 | 第28-44页 |
| 引言 | 第28页 |
| 2.1 材料与方法 | 第28-31页 |
| 2.1.1 材料 | 第28-29页 |
| 2.1.2 试验内容及方法 | 第29-31页 |
| 2.2 结果与分析 | 第31-41页 |
| 2.2.1 菌株AFM10111~T的形态学特征 | 第31-32页 |
| 2.2.2 菌株AFM10111~T的菌落及培养特征 | 第32-33页 |
| 2.2.3 生理生化特性研究 | 第33-35页 |
| 2.2.4 化学成分鉴定 | 第35-39页 |
| 2.2.5 分子生物学鉴定 | 第39-41页 |
| 2.3 讨论 | 第41-42页 |
| 2.4 菌株A.flavaAFM10111~T的描述 | 第42-44页 |
| 第三章 放线菌新种AFM10238~T多相分类学鉴定 | 第44-57页 |
| 引言 | 第44页 |
| 3.1 材料及方法 | 第44-45页 |
| 3.1.1 材料 | 第44页 |
| 3.1.2 试验内容及方法 | 第44-45页 |
| 3.2 试验结果 | 第45-54页 |
| 3.2.1 菌株AFM10238~T的形态学特征 | 第45-46页 |
| 3.2.2 菌株AFM10238~T菌落及培养特征 | 第46-47页 |
| 3.2.3 生理生化特性研究 | 第47-48页 |
| 3.2.4 化学成分鉴定 | 第48-53页 |
| 3.2.5 分子生物学鉴定 | 第53-54页 |
| 3.3 讨论 | 第54-56页 |
| 3.4 菌株S.griseoalbaAFM10238~T的描述 | 第56-57页 |
| 第四章 放线菌新属AFM10258~T的多相分类学鉴定 | 第57-68页 |
| 引言 | 第57页 |
| 4.1 材料及方法 | 第57-58页 |
| 4.1.1 材料 | 第57页 |
| 4.1.2 试验内容及方法 | 第57-58页 |
| 4.2 试验结果 | 第58-65页 |
| 4.2.1 菌株AFM10258~T的形态学特征 | 第58-59页 |
| 4.2.2 菌株AFM10258~T的菌落及培养特征 | 第59-60页 |
| 4.2.3 生理生化特性研究 | 第60-61页 |
| 4.2.4 化学成分鉴定 | 第61-64页 |
| 4.2.5 分子生物学鉴定 | 第64-65页 |
| 4.3 讨论 | 第65-67页 |
| 4.4 Haloactinomyces属的描述 | 第67页 |
| 4.5 菌株H.albusAFM10258~T的描述 | 第67-68页 |
| 第五章 嗜盐放线菌新种AFM10040~T多相分类学鉴定 | 第68-81页 |
| 引言 | 第68页 |
| 5.1 材料与仪器 | 第68-69页 |
| 5.1.1 材料 | 第68页 |
| 5.1.2 试验内容及方法 | 第68-69页 |
| 5.2 试验结果 | 第69-78页 |
| 5.2.1 菌株AFM10040~T的形态学特征 | 第69-70页 |
| 5.2.2 菌株AFM10040~T的菌落及培养特征 | 第70-71页 |
| 5.2.3 生理生化特性研究 | 第71-73页 |
| 5.2.4 化学成分鉴定 | 第73-77页 |
| 5.2.5 分子生物学鉴定 | 第77-78页 |
| 5.3 讨论 | 第78-80页 |
| 5.4 菌株H.halophilusAFM10040~T的描述 | 第80-81页 |
| 第六章 嗜盐菌HalopolysporaalbaAFM10251基因组测序及分析 | 第81-100页 |
| 引言 | 第81-82页 |
| 6.1 材料与方法 | 第82-83页 |
| 6.1.1 试验材料 | 第82页 |
| 6.1.2 试验内容及方法 | 第82-83页 |
| 6.2 结果与分析 | 第83-98页 |
| 6.2.1 菌株H.albaAFM10251基因组DNA提取及质量检测 | 第83-84页 |
| 6.2.2 菌株H.albaAFM10251基因组测序概况 | 第84-85页 |
| 6.2.3 菌株H.albaAFM10251基因组编码基因的功能注释 | 第85-88页 |
| 6.2.4 菌株H.albaAFM10251嗜盐耐盐相关基因及代谢通路分析 | 第88-98页 |
| 6.3 讨论 | 第98-99页 |
| 6.4 小结 | 第99-100页 |
| 第七章 盐胁迫下菌株H.albaAFM10251的转录组差异分析 | 第100-126页 |
| 引言 | 第100页 |
| 7.1 材料及方法 | 第100-103页 |
| 7.1.1 材料 | 第100-101页 |
| 7.1.2 试验内容及方法 | 第101-103页 |
| 7.2 结果与分析 | 第103-122页 |
| 7.2.1 RNA样品的提取及质量检测 | 第103-105页 |
| 7.2.2 RNA-seq高通量测序数据概况 | 第105-106页 |
| 7.2.3 菌株H.albaAFM10251在不同盐浓度下差异表达基因分析 | 第106-111页 |
| 7.2.4 菌株H.albaAFM10251中与相容性溶质相关基因的差异表达分析 | 第111-117页 |
| 7.2.5 与胞内Na~+输出和K~+积累有关的基因差异表达分析 | 第117-120页 |
| 7.2.6 不同盐浓度下超高表达基因 | 第120-121页 |
| 7.2.7 实时荧光定量PCR分析基因差异表达情况 | 第121-122页 |
| 7.3 讨论 | 第122-125页 |
| 7.4 小结 | 第125-126页 |
| 第八章 盐胁迫下菌株H.albaAFM10251的蛋白质组差异分析 | 第126-149页 |
| 引言 | 第126页 |
| 8.1 材料与方法 | 第126-128页 |
| 8.1.1 材料 | 第126-127页 |
| 8.1.2 试验内容及方法 | 第127-128页 |
| 8.2 结果与分析 | 第128-146页 |
| 8.2.1 蛋白质提取及质量检测 | 第128-129页 |
| 8.2.2 胞内蛋白质的分离鉴定与功能分类 | 第129-131页 |
| 8.2.3 不同盐浓度下蛋白差异表达分析 | 第131-135页 |
| 8.2.4 不同盐浓度下显著差异表达蛋白分析 | 第135-141页 |
| 8.2.5 不同盐浓度下高表达量蛋白 | 第141-143页 |
| 8.2.6 菌株H.albaAFM10251与相容性溶质相关蛋白差异表达分析 | 第143-145页 |
| 8.2.7 菌株H.albaAFM10251与胞内Na~+输出和K+积累有关蛋白表达差异分析 | 第145-146页 |
| 8.3 讨论 | 第146-148页 |
| 8.4 小结 | 第148-149页 |
| 第九章 结论与创新 | 第149-152页 |
| 9.1 结论 | 第149-151页 |
| 9.1.1 嗜盐放线菌AFM10111~T的鉴定 | 第149页 |
| 9.1.2 耐盐放线菌AFM10238~T的鉴定 | 第149页 |
| 9.1.3 嗜盐放线菌新属AFM10258~T的鉴定 | 第149-150页 |
| 9.1.4 嗜盐放线菌AFM10040~T的鉴定 | 第150页 |
| 9.1.5 嗜盐放线菌H.albaAFM10251全基因组测序及分析 | 第150页 |
| 9.1.6 不同盐浓度条件下嗜盐菌H.albaAFM10251的转录组差异分析 | 第150-151页 |
| 9.1.7 不同盐浓度条件下嗜盐菌H.albaAFM10251蛋白质组差异分析 | 第151页 |
| 9.2 创新点 | 第151-152页 |
| 参考文献 | 第152-163页 |
| 附录1 放线菌新物种细胞全糖组分高效液相色谱图 | 第163-167页 |
| 附录2 放线菌新物种细胞壁氨基酸组分高效液相色谱图 | 第167-170页 |
| 附录3 放线菌新物种醌组分高效液相色谱图 | 第170-173页 |
| 附录4 放线菌新物种16SrRNA全序列 | 第173-176页 |
| 附录5 放线菌新物种GCmol%的高效液相图谱 | 第176-178页 |
| 附录6 RT-qPCR引物序列 | 第178-179页 |
| 附录7 显著差异表达基因 | 第179-184页 |
| 附录8 显著差异表达蛋白 | 第184-185页 |
| 致谢 | 第185-186页 |
| 作者简介 | 第186页 |
