| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-13页 |
| 1.1.1 癌症概况 | 第10-11页 |
| 1.1.2 癌症治疗的难点 | 第11-13页 |
| 1.2 癌症研究进展 | 第13-14页 |
| 1.3 本研究的目的与主要内容 | 第14-15页 |
| 1.4 分析技术与工具 | 第15-16页 |
| 1.4.1 所用生物信息分析工具 | 第15-16页 |
| 第二章 泛癌症基因组突变分析 | 第16-25页 |
| 2.1 前言 | 第16-17页 |
| 2.2 材料与方法 | 第17-18页 |
| 2.2.1 数据来源 | 第17页 |
| 2.2.2 分析方法 | 第17-18页 |
| 2.3 结果 | 第18-23页 |
| 2.3.1 各种类型的癌症在不同的阶段都具有显著的异质性 | 第18-20页 |
| 2.3.2 突变数量与正常干细胞累计终身分裂次数相关性分析 | 第20-22页 |
| 2.3.3 候选癌症驱动基因分析 | 第22-23页 |
| 2.4 讨论 | 第23页 |
| 2.5 本章小结 | 第23-25页 |
| 第三章 泛癌症转录因子与靶基因共表达分析 | 第25-44页 |
| 3.1 前言 | 第25-26页 |
| 3.2 材料与方法 | 第26-28页 |
| 3.2.1 数据来源与样本分组 | 第26页 |
| 3.2.2 数据预处理与共表达分析 | 第26-27页 |
| 3.2.3 功能注释 | 第27-28页 |
| 3.3 结果 | 第28-40页 |
| 3.3.1 数据概况与数据处理 | 第28-30页 |
| 3.3.2 整合转录因子靶基因数据库分析 | 第30-33页 |
| 3.3.3 癌症的普遍性与特异性分析 | 第33页 |
| 3.3.4 癌症细胞系验证 | 第33-40页 |
| 3.3.5 普遍性与组织特异性TF-TG基因对功能注释 | 第40页 |
| 3.4 讨论 | 第40-43页 |
| 3.5 本章小结 | 第43-44页 |
| 第四章 泛癌症基因突变与表达整合分析 | 第44-66页 |
| 4.1 前言 | 第44页 |
| 4.2 材料与方法 | 第44-45页 |
| 4.2.1 数据来源与差异表达分析 | 第44-45页 |
| 4.2.2 突变基因分析 | 第45页 |
| 4.2.3 候选驱动基因与差异表达基因对比分析方法 | 第45页 |
| 4.3 结果 | 第45-64页 |
| 4.3.1 差异表达分析 | 第45-47页 |
| 4.3.2 候选驱动基因与差异表达基因对比分析 | 第47-49页 |
| 4.3.3 共表达基因对与差异表达基因整合分析 | 第49-55页 |
| 4.3.4 共表达基因对与基因组突变整合分析 | 第55-61页 |
| 4.3.5 基因组与转录组整合分析 | 第61-64页 |
| 4.4 讨论 | 第64页 |
| 4.5 本章小结 | 第64-66页 |
| 创新性成果 | 第66-67页 |
| 局限与展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-75页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 附件 | 第77页 |
