| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略词 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-20页 |
| 1.1 马铃薯与晚疫病 | 第11页 |
| 1.2 植物的双层免疫系统 | 第11-12页 |
| 1.3 胞内免疫(R基因抗性)的局限性 | 第12-13页 |
| 1.4 胞外免疫的重要性及优势 | 第13-16页 |
| 1.5 Elicitin诱导的信号途径 | 第16-17页 |
| 1.6 蛋白组学技术 | 第17-19页 |
| 1.7 本研究的目的与意义 | 第19-20页 |
| 2 基于iTRAQ技术分析本氏烟草中INF1诱导的差异蛋白 | 第20-34页 |
| 2.1 前言 | 第20页 |
| 2.2 材料与方法 | 第20-24页 |
| 2.2.1 植物材料 | 第20-21页 |
| 2.2.2 菌株及载体 | 第21页 |
| 2.2.3 主要试剂及仪器 | 第21页 |
| 2.2.4 样品处理和iTRAQ蛋白组检测 | 第21-22页 |
| 2.2.5 关键基因的VIGS载体的构建 | 第22页 |
| 2.2.6 植物总RNA抽提及反转录cDNA的合成 | 第22页 |
| 2.2.7 定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR) | 第22-24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-31页 |
| 2.3.1 INF1诱导后本氏烟草叶片形态变化 | 第24页 |
| 2.3.2 INF1诱导后差异表达蛋白鉴定与功能分析 | 第24-28页 |
| 2.3.3 利用VIGS技术对上调表达蛋白进行功能分析 | 第28-31页 |
| 2.4 讨论 | 第31-34页 |
| 2.4.1 参与信号转导/转录的蛋白 | 第31页 |
| 2.4.2 参与转运相关的蛋白 | 第31-32页 |
| 2.4.3 参与光合作用的蛋白 | 第32页 |
| 2.4.4 防御相关的蛋白 | 第32-33页 |
| 2.4.5 参与蛋白质合成相关的蛋白 | 第33-34页 |
| 3 基于SWATH技术分析晚疫病菌PAMP诱导本氏烟中的差异蛋白 | 第34-58页 |
| 3.1 前言 | 第34-36页 |
| 3.2 材料与方法 | 第36-42页 |
| 3.2.0 材料与仪器 | 第36-37页 |
| 3.2.1 CF制备及烟草叶片注射 | 第37页 |
| 3.2.2 本氏烟叶片蛋白质的提取 | 第37-38页 |
| 3.2.3 蛋白质定量 | 第38页 |
| 3.2.4 总蛋白的酶切 | 第38页 |
| 3.2.5 酶解蛋白液的除盐干燥 | 第38页 |
| 3.2.6 第一维高pH反向(Reversed-phase)高效液相分离 | 第38-39页 |
| 3.2.7 参考质谱数据库的建立 | 第39-40页 |
| 3.2.8 SWATH数据采集 | 第40-41页 |
| 3.2.9 SWATH数据定性与定量分析 | 第41-42页 |
| 3.3 结果分析 | 第42-57页 |
| 3.3.1 CF诱导后本氏烟草叶片表型变化 | 第42页 |
| 3.3.2 SWATH中CF诱导本氏烟草中蛋白的鉴定 | 第42-43页 |
| 3.3.3 质谱数据主成分分析(PCA) | 第43-44页 |
| 3.3.4 CF诱导本氏烟中的差异表达蛋白分析 | 第44-46页 |
| 3.3.5 差异蛋白聚类分析 | 第46-47页 |
| 3.3.6 差异蛋白GO注释分析 | 第47-52页 |
| 3.3.7 差异表达蛋白KEGG通路及表达模式分析 | 第52-57页 |
| 3.4 讨论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-69页 |
| 附表1 部分通路差异蛋白列表 | 第69-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
