| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 引言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-21页 |
| 1 表观遗传学与DNA甲基化 | 第13-15页 |
| 1.1 表观遗传学 | 第13页 |
| 1.2 DNA甲基化 | 第13-15页 |
| 1.2.1 DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase)和tRNA甲基转移酶(DNMT2) | 第14-15页 |
| 1.2.2 DNA去甲基化酶(DNA demethylase) | 第15页 |
| 2 DNA甲基化对植物生长发育的影响 | 第15-17页 |
| 2.1 DNA甲基化可调节植物内源基因的表达 | 第15-16页 |
| 2.2 DNA甲基化对植物种子萌发及其他表型的影响 | 第16页 |
| 2.3 DNA甲基化与植物的春化作用 | 第16-17页 |
| 2.4 DNA甲基化对植物基因组防御的作用 | 第17页 |
| 3 DNA甲基化对果实发育的影响 | 第17-18页 |
| 4 植物的抗逆性与DNA甲基化 | 第18-20页 |
| 4.1 干旱胁迫对植物生长发育以及DNA甲基化的影响 | 第18页 |
| 4.2 盐胁迫对植物生长发育以及DNA甲基化的影响 | 第18-19页 |
| 4.3 冷胁迫对植物生长发育以及DNA甲基化的影响 | 第19页 |
| 4.4 高温胁迫对植物生长发育以及DNA甲基化的影响 | 第19-20页 |
| 5 研究意义及展望 | 第20-21页 |
| 参考文献 | 第21-27页 |
| 第二章 DNA甲基化修饰酶基因的鉴定及生物信息学分析 | 第27-47页 |
| 1 材料与方法 | 第27-28页 |
| 1.1 蛋白库的获取 | 第27页 |
| 1.2 方法 | 第27-28页 |
| 1.2.1 DNA甲基化修饰酶的搜索 | 第27页 |
| 1.2.2 DNA甲基化修饰酶基因的序列比对及进化树的构建 | 第27页 |
| 1.2.3 DNA甲基化修饰酶的保守结构域和motif结构分析 | 第27-28页 |
| 1.2.4 DNA甲基化酶的外显子-内含子结构分析 | 第28页 |
| 2 结果与分析 | 第28-47页 |
| 2.1 DNA甲基化修饰酶基因的鉴定 | 第28-33页 |
| 2.2 DNA甲基化修饰酶基因各家族的信息分析 | 第33-35页 |
| 2.3 DNA甲基化修饰酶各家族保守结构域的分析 | 第35-37页 |
| 2.4 DNA甲基化酶修饰酶的motif结构分析 | 第37-42页 |
| 2.4.1 DNA甲基化酶和去甲基化酶全蛋白的motif分析 | 第37-38页 |
| 2.4.2 DNA甲基化酶和去甲基化酶功能结构域的motif分析 | 第38-42页 |
| 2.5 DNA甲基化修饰酶基因的外显子-内含子结构分析 | 第42-44页 |
| 2.6 DNA甲基化修饰酶基因的进化过程中复制事件分析 | 第44-47页 |
| 第三章 DNA甲基化修饰酶在森林草莓果实发育过程中的表达水平分析 | 第47-55页 |
| 1 材料与方法 | 第47-51页 |
| 1.1 材料 | 第47-48页 |
| 1.1.1 森林草莓果实发育前期转录组数据的获取 | 第47页 |
| 1.1.2 植物材料的收集 | 第47页 |
| 1.1.3 主要试剂及仪器 | 第47页 |
| 1.1.4 裂解缓冲液的配制 | 第47-48页 |
| 1.2 方法 | 第48-51页 |
| 1.2.1 果实RNA的提取 | 第48-49页 |
| 1.2.2 电泳初步检测RNA条带 | 第49页 |
| 1.2.3 RNA浓度测定及纯度检测 | 第49页 |
| 1.2.4 cDNA的合成 | 第49-50页 |
| 1.2.5 cDNA质量检测 | 第50页 |
| 1.2.6 实时定量PCR | 第50-51页 |
| 2 结果与分析 | 第51-55页 |
| 2.1 DNA甲基化修饰酶基因在森林草莓果实发育前期的表达情况分析 | 第51-52页 |
| 2.2 DNA甲基化修饰酶基因在森林草莓果实发育后期的表达情况分析 | 第52-55页 |
| 第四章 非生物胁迫下DNA去甲基化酶的表达水平 | 第55-61页 |
| 1 材料与方法 | 第55-56页 |
| 1.1 材料 | 第55页 |
| 1.1.1 植物材料的收集 | 第55页 |
| 1.1.2 主要仪器及试剂 | 第55页 |
| 1.1.3 裂解缓冲液的配制 | 第55页 |
| 1.2 方法 | 第55-56页 |
| 1.2.1 草莓幼苗RNA的提取 | 第55-56页 |
| 1.2.2 电泳初步检测 | 第56页 |
| 1.2.3 RNA浓度测定及纯度检测 | 第56页 |
| 1.2.4 cDNA的合成 | 第56页 |
| 1.2.5 cDNA质量检测 | 第56页 |
| 1.2.6 实时定量PCR | 第56页 |
| 2 结果与分析 | 第56-61页 |
| 2.1 四种非生物胁迫下拟南芥DNA去甲基化酶的表达量分析 | 第56-57页 |
| 2.2 四种非生物胁迫下森林草莓DNA去甲基化酶的表达量分析 | 第57-61页 |
| 第五章 讨论 | 第61-65页 |
| 1 DNA甲基化酶基因和DNA去甲基化酶基因的鉴定及进化分析 | 第61页 |
| 2 DNA甲基化酶和DNA去甲基化酶在单子叶植物和双子叶植物中的分布 | 第61-62页 |
| 3 DNA甲基化酶基因和DNA去甲基化酶基因的进化数量与复制事件的关系 | 第62页 |
| 4 森林草莓果实成熟与DNA甲基化的相关性 | 第62-63页 |
| 5 森林草莓应对非生物胁迫与DNA甲基化的相关性 | 第63-65页 |
| 全文结论和意义 | 第65-67页 |
| 创新之处 | 第67-69页 |
| 论文发表情况 | 第69-71页 |
| 附录 | 第71-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
