| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5页 |
| 引言 | 第9-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-20页 |
| 1.1 热休克蛋白的概述 | 第11-13页 |
| 1.1.1 热休克蛋白的起源和分类 | 第11-12页 |
| 1.1.2 热休克蛋白的功能及特点 | 第12-13页 |
| 1.2 基因家族 | 第13页 |
| 1.3 全基因组加倍 | 第13-14页 |
| 1.4 序列比对 | 第14-15页 |
| 1.4.1 序列比对的概念 | 第14页 |
| 1.4.2 序列比对常用的工具 | 第14-15页 |
| 1.5 系统发育树 | 第15页 |
| 1.6 亚细胞定位的概述及软件介绍 | 第15页 |
| 1.7 支持向量机 | 第15-20页 |
| 1.7.1 支持向量机的概况 | 第15-16页 |
| 1.7.2 支持向量机的分类 | 第16-19页 |
| 1.7.3 支持向量机的核函数 | 第19-20页 |
| 第2章 热休克蛋白90的进化分析 | 第20-27页 |
| 2.1 数据材料与方法 | 第20-21页 |
| 2.1.1 数据材料 | 第20页 |
| 2.1.2 亚细胞定位方法 | 第20页 |
| 2.1.3 系统发育树的构建 | 第20-21页 |
| 2.2 结果和分析 | 第21-26页 |
| 2.2.1 热休克蛋白90在不同基因组中的分布 | 第21-22页 |
| 2.2.2 热休克蛋白90的亚细胞定位分析 | 第22-23页 |
| 2.2.3 热休克蛋白90系统发育分析 | 第23-25页 |
| 2.2.4 热休克蛋白90基因结构分析 | 第25-26页 |
| 2.3 本章小结 | 第26-27页 |
| 第3章 热休克蛋白的进化分析 | 第27-47页 |
| 3.1 数据材料和方法 | 第27-30页 |
| 3.1.1 数据材料与预处理 | 第27-28页 |
| 3.1.2 全基因组预测禾本科植物热休克蛋白 | 第28-29页 |
| 3.1.3 热休克蛋白基因共线性分析和染色体定位 | 第29页 |
| 3.1.4 禾本科植物热休克蛋白基因进化速率和自然选择分析 | 第29页 |
| 3.1.5 禾本科植物热休克蛋白系统发育树的构建及保守结构分析 | 第29-30页 |
| 3.2 结果和分析 | 第30-46页 |
| 3.2.1 禾本科植物热休克蛋白鉴定及亚细胞定位 | 第30-31页 |
| 3.2.2 热休克蛋白基因共线性结果和染色体定位分析 | 第31-38页 |
| 3.2.3 禾本科植物热休克蛋白进化分析 | 第38页 |
| 3.2.4 禾本科植物热休克蛋白自然选择分析 | 第38-39页 |
| 3.2.5 热休克蛋白系统发育分析 | 第39-43页 |
| 3.2.6 热休克蛋白家族保守结构域分析 | 第43-46页 |
| 3.3 本章小结 | 第46-47页 |
| 第4章 基于支持向量机的热休克蛋白家族分类算法研究 | 第47-53页 |
| 4.1 材料和方法 | 第47-50页 |
| 4.1.1 数据集 | 第47页 |
| 4.1.2 氨基酸n肽组分信息 | 第47-48页 |
| 4.1.3 支持向量机 | 第48-49页 |
| 4.1.4 算法评价 | 第49-50页 |
| 4.2 结果和分析 | 第50-52页 |
| 4.2.1 热休克蛋白氨基酸成分分析 | 第50-51页 |
| 4.2.2 热休克蛋白类型的预测 | 第51-52页 |
| 4.3 本章小结 | 第52-53页 |
| 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-61页 |
| 附录A 热休克蛋白染色体定位 | 第61-63页 |
| 附录B 热休克蛋白家族保守结构域鉴定列表(部分) | 第63-69页 |
| 附录C 热休克蛋白家族保守基序分析 | 第69-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 导师简介 | 第78-79页 |
| 作者简介 | 第79-80页 |
| 学位论文数据集 | 第80页 |
