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小麦sssⅡa、sbeⅡa启动子响应花后高温甲基化变化与淀粉含量的相关研究

摘要第5-6页
Abstract第6页
缩略词第10-11页
第一章 文献综述第11-21页
    1.1 小麦淀粉第11-14页
        1.1.1 小麦的直链淀粉与支链淀粉第11-12页
        1.1.2 淀粉合成的相关酶第12-14页
        1.1.3 逆境对淀粉合成酶活性及淀粉含量的影响第14页
    1.2 启动子的研究现状第14-17页
        1.2.1 启动子的核心结构和功能第15页
        1.2.2 启动子的克隆第15-16页
        1.2.3 启动子分析方法第16页
        1.2.4 与淀粉合成相关酶启动子的研究进展第16-17页
    1.3 DNA甲基化研究现状第17-19页
        1.3.1 DNA甲基化与去甲基化第17-18页
        1.3.2 非生物胁迫对植物DNA甲基化的影响第18页
        1.3.3 启动子甲基化对基因表达的影响第18-19页
    1.4 本研究的目的和意义第19-21页
第二章 sssⅡa、sbeⅡb启动子的克隆与瞬时表达第21-35页
    2.1 材料与方法第21-22页
        2.1.1 材料与种植第21页
        2.1.2 菌株和载体第21页
        2.1.3 实验试剂和仪器第21-22页
    2.2 实验方法第22-26页
        2.2.1 小麦总DNA的提取第22页
        2.2.2 查找sssⅡa、sbeⅡb启动子序列第22页
        2.2.3 sssⅡa、sbeⅡb启动子序列功能元件预测第22页
        2.2.4 设计引物克隆目的片段第22页
        2.2.5 sssⅡa、sbeⅡb启动子PCR产物与克隆载体连接第22-24页
            2.2.5.1 sssⅡa、sbeⅡb启动子PCR扩增目的基因第22-23页
            2.2.5.2 sssⅡa、sbeⅡb启动子PCR产物的回收纯化与连接转化第23页
            2.2.5.3 热激法转化连接产物至Trans-T1细胞第23页
            2.2.5.4 质粒提取及双酶切验证第23-24页
            2.2.5.5 测序第24页
            2.2.5.6 序列比对第24页
        2.2.6 sssⅡa、sbeⅡb启动子与表达载体连接第24-25页
            2.2.6.1 sssⅡa-TransT1、sbeⅡb-TransT1重组质粒菌液活化与表达载体转化第24页
            2.2.6.2 质粒的提取及双酶切第24页
            2.2.6.3 回收纯化与连接转化第24-25页
            2.2.6.4 热激法转化sssⅡa-GFP、sbeⅡb-GFP质粒至Trans-T1细胞第25页
            2.2.6.5 质粒的提取及双酶切验证第25页
        2.2.7 sssⅡa-GFP、sbeⅡb-GFP在原生质体中瞬时表达第25-26页
            2.2.7.1 试剂与仪器第25页
            2.2.7.2 材料与方法第25页
            2.2.7.3 PEG介导玉米原生质体转化第25-26页
    2.3 结果分析第26-33页
        2.3.1 sssⅡa、sbeⅡb启动子序列功能元件预测第26-27页
        2.3.2 sssⅡa和sbeⅡb启动子的克隆第27-28页
        2.3.3 sssⅡa、sbeⅡb启动子与克隆载体连接及测序结果第28-31页
        2.3.4 sssⅡa、sbeⅡb启动子与表达载体连接第31-32页
        2.3.5 sssⅡa-GFP重组质粒在原生质体中瞬时表达第32-33页
    2.4 结论与讨论第33-35页
第三章 sssⅡa、sbeⅡa启动子甲基化分析第35-47页
    3.1 材料及实验仪器第35页
        3.1.1 材料与种植第35页
        3.1.2 处理与取样第35页
        3.1.3 实验仪器和试剂第35页
    3.2 实验方法第35-36页
        3.2.1 DNA提取方法及样品质量控制第35-36页
        3.2.2 DNA重亚硫酸盐处理第36页
        3.2.3 sssⅡa、sbeⅡa启动子的序列甲基化位点预测与引物设计第36页
        3.2.4 样本目标片段多重PCR反应第36页
        3.2.5 样本添加特异性标签序列第36页
        3.2.6 定量后上机测序第36页
        3.2.7 数据统计及分析第36页
    3.3 结果分析第36-45页
        3.3.1 DNA质量检测第36-37页
        3.3.2 引物设计第37页
        3.3.3 胞嘧啶转化率第37-39页
        3.3.4 原始数据质量评估第39-42页
            3.3.4.1 原始测序数据统计第39-40页
            3.3.4.2 有效reads筛选统计第40页
            3.3.4.3 各样本目标区域测序深度统计第40-42页
        3.3.5 甲基化水平分析第42-43页
        3.3.6 甲基化水平相似性分析第43-45页
        3.3.7 甲基化水平差异位点分析第45页
    3.4 结论与讨论第45-47页
第四章 sssⅡa和sbeⅡa相对表达量与淀粉含量的相关分析第47-53页
    4.1 材料第47页
        4.1.1 材料第47页
        4.1.2 试剂与仪器第47页
    4.2 实验方法第47-48页
        4.2.1 引物设计第47页
        4.2.2 RNA的提取和cDNA的合成第47-48页
        4.2.3 实时荧光定量PCR第48页
        4.2.4 淀粉含量的测定方法第48页
    4.3 结果分析第48-50页
        4.3.1 不同处理各时期的sssIIa相对表达量第48-49页
        4.3.2 不同处理各时期的sbeIIa相对表达量第49页
        4.3.3 总淀粉含量与基因相对表达量第49-50页
    4.4 结论与讨论第50-53页
创新与展望第53-55页
参考文献第55-62页
致谢第62-63页
作者简介第63-64页
附件第64页

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