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七鳃鳗组织蛋白酶D的克隆表达及生物信息学分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
1 绪论第11-21页
    1.1 组织蛋白酶 D 的产生、合成、转运与激活第11-13页
    1.2 组织蛋白酶 D 参与多种体内生理学活动第13-15页
        1.2.1 组织蛋白酶 D 参与不同底物水解第13-15页
        1.2.2 组织蛋白酶 D 参与表皮分化第15页
        1.2.3 组织蛋白酶 D 参与细胞凋亡第15页
    1.3 组织蛋白酶 D 参与多种体内病理学活动第15-20页
        1.3.1 组织蛋白酶 D 与阿尔茨海默病第15-16页
        1.3.2 组织蛋白酶 D 与动脉粥样硬化第16-17页
        1.3.3 组织蛋白酶 D 与先天性肌肉萎缩第17页
        1.3.4 组织蛋白酶 D 与癌症第17-20页
    1.4 问题与展望第20-21页
2 七鳃鳗 CTSD 基因的分子克隆第21-43页
    2.1 材料第21-22页
        2.1.1 实验动物第21页
        2.1.2 仪器设备第21-22页
        2.1.3 实验试剂第22页
    2.2 方法第22-37页
        2.2.1 引物设计第22-23页
        2.2.2 七鳃鳗口腔腺 Total RNA 的提取第23-24页
        2.2.3 七鳃鳗口腔腺 cDNA 模板制备第24-26页
        2.2.4 七鳃鳗 CTSD 基因的扩增第26页
        2.2.5 目的片段的回收第26-27页
        2.2.6 目的片段与 T 载体的连接及转化第27-28页
        2.2.7 阳性转化子的鉴定第28-29页
        2.2.8 重组质粒 DNA 小量纯化及测序第29页
        2.2.9 3’末端快速扩增反应第29-32页
        2.2.10 5’末端快速扩增反应第32-36页
        2.2.11 cDNA 全长序列拼接及 ORF 片段扩增第36-37页
    2.3 结果第37-41页
        2.3.1 七鳃鳗口腔腺 Toal RNA 的提取第37-38页
        2.3.2 七鳃鳗 CTSD 基因的克隆及 3’和 5’末端快速扩增反应第38-39页
        2.3.3 七鳃鳗 CTSD 基因的 cDNA 全长的序列拼接及最终验证第39-41页
    2.4 讨论第41-42页
    2.5 小结第42-43页
3 七鳃鳗 CTSD 的生物信息学分析第43-59页
    3.1 生物信息学分析所需软件和数据库第43页
    3.2 结果第43-57页
        3.2.1 七鳃鳗 CTSD 的理化性质分析第43-45页
        3.2.2 蛋白质二级结构和结构域分析第45-49页
        3.2.3 三级结构模拟第49-50页
        3.2.4 同源序列比对第50-52页
        3.2.5 保守基序分析第52-56页
        3.2.6 系统发育分析第56-57页
    3.3 讨论第57页
    3.4 小结第57-59页
4 实时定量 PCR 法检测 L-CTSD 基因在七鳃鳗各组织中的表达谱第59-65页
    4.1 材料第59-60页
        4.1.1 实验动物第59页
        4.1.2 仪器设备第59-60页
        4.1.3 实验试剂第60页
    4.2 实验方法第60-62页
        4.2.1 免疫刺激第60页
        4.2.2 Total RNA 的提取与检测第60页
        4.2.3 引物设计第60-61页
        4.2.4 Real Time PCR 反应第61-62页
    4.3 结果第62-64页
        4.3.1 七鳃鳗各组织 Total RNA 的提取第62-63页
        4.3.2 L-CTSD 基因在七鳃鳗不同组织中的相对表达谱分析第63-64页
    4.4 讨论第64页
    4.5 小结第64-65页
5 pColdⅠ-CTSD 表达载体的构建及重组蛋白的纯化鉴定第65-80页
    5.1 材料第65-66页
        5.1.1 实验材料第65页
        5.1.2 仪器设备第65-66页
        5.1.3 实验试剂第66页
    5.2 实验方法第66-73页
        5.2.1 引物设计第66页
        5.2.2 PCR 扩增第66-67页
        5.2.3 目的片段的回收与双酶切第67-68页
        5.2.4 目的片段与载体的连接及转化第68页
        5.2.5 重组表达菌的鉴定第68页
        5.2.6 重组蛋白的诱导表达第68-69页
        5.2.7 表达菌的小量超声破碎第69页
        5.2.8 包涵体重组蛋白的提取和鉴定第69-70页
        5.2.9 包涵体纯化第70-71页
        5.2.10 包涵体透析复性第71页
        5.2.11 蛋白质浓缩第71页
        5.2.12 蛋白质浓度测定第71-72页
        5.2.13 质谱鉴定第72页
        5.2.14 rL-CTSD 对牛血红蛋白的酶切活性检测第72-73页
    5.3 结果第73-78页
        5.3.1 pColdⅠ-CTSD 表达载体的构建及测序第73-74页
        5.3.2 七鳃鳗 CTSD 蛋白的诱导表达与纯化第74-76页
        5.3.3 重组七鳃鳗 CTSD 的质谱鉴定第76-77页
        5.3.4 rL-CTSD 对牛血红蛋白的酶切活性检测第77-78页
    5.4 讨论第78-79页
    5.5 小结第79-80页
结论第80-81页
本论文的创新点第81-82页
参考文献第82-86页
附录A 不同物种 CTSD 的 FASTA 格式氨基酸序列第86-92页
附录B 表达载体 pColdⅠ质粒图谱第92-93页
附录 C BCA 蛋白质浓度测定标准曲线第93-94页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第94-95页
致谢第95页

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