缩略词表 | 第6-8页 |
中文摘要 | 第8-9页 |
Abstract | 第9页 |
前言 | 第10-13页 |
实验材料与仪器 | 第13-18页 |
第一部分 海分枝杆菌基因随机高表达文库的构建 | 第18-40页 |
实验方法 | 第18-33页 |
1 vcs257和XLI-Blue MR宿主菌株的制备 | 第18页 |
2 海分枝杆菌基因组的提取 | 第18-19页 |
3 海分枝杆菌基因组不完全酶切插入片段的制备 | 第19-20页 |
4 载体的制备 | 第20-28页 |
5 连接 | 第28页 |
6 包装 | 第28-29页 |
7 包装反应物滴度测定 | 第29-30页 |
8 随机高表达文库的扩增和保存 | 第30页 |
9 文库质量的鉴定 | 第30-31页 |
10 海分枝杆菌基因随机高表达文库的验证 | 第31-33页 |
实验结果 | 第33-40页 |
1 海分枝杆菌基因组的制备 | 第33-34页 |
2 插入片段的制备 | 第34页 |
3 载体的制备 | 第34-38页 |
4 包装阳性对照滴度测定结果 | 第38页 |
5 重组子鉴定 | 第38-39页 |
6 库容量计算 | 第39页 |
7 文库验证结果 | 第39-40页 |
第二部分 3277-3耐药突变菌株的筛选及其作用靶标研究 | 第40-61页 |
实验方法 | 第40-45页 |
1 野生型海分枝杆菌的培养 | 第40页 |
2 海分枝杆菌的紫外诱变 | 第40页 |
3 诱变后的海分枝杆菌的平板筛选 | 第40页 |
4 耐3277-3突变菌株的基因组提取 | 第40-41页 |
5 海分枝杆菌基因组的质量测定 | 第41-42页 |
6 海分枝杆菌的全基因组重测序及序列比对 | 第42-45页 |
实验结果 | 第45-61页 |
1 获得两株3277-3耐药的海分枝杆菌突变菌株 | 第45页 |
2 Mm3277-36和Mm3277-48对3277-3的MIC测定 | 第45页 |
3 海分枝杆菌基因组的质测定结果 | 第45-50页 |
4 Mm3277-36和Mm3277-48的16s rRNA DNA测序结果 | 第50-57页 |
5 Mm3277-36和Mm3277-48相同突变基因的基因分析 | 第57-61页 |
讨论 | 第61-63页 |
结论 | 第63-64页 |
参考文献 | 第64-67页 |
文献综述 | 第67-75页 |
参考文献 | 第72-75页 |
附录 | 第75-91页 |
附录1 cos位点测序结果 | 第75-76页 |
附录2 Mm3277-36_1.fq.stat.base.ps | 第76-77页 |
附录3 Mm3277-36_1.fq.stat.qual.ps | 第77-78页 |
附录4 Mm3277-36_2.fq.stat.base.ps | 第78-79页 |
附录5 Mm3277-36_2.fq.stat.qual.ps | 第79-80页 |
附录6 Mm3277-48_1.fq.stat.base.ps | 第80-81页 |
附录7 Mm3277-48_1.fq.stat.qual.ps | 第81-82页 |
附录8 Mm3277-48_2.fq.stat.base.ps | 第82-83页 |
附录9 Mm3277-48_2.fq.stat.qual.ps | 第83-84页 |
附录10 Mm3277-36.indel.filt | 第84-85页 |
附录11 Mm3277-36.snp.filt.anno | 第85-86页 |
附录12 Mm3277-48.indel.filt | 第86-87页 |
附录13 Mm3277-48 48.snp.filt.anno | 第87-88页 |
附录14 群体共同Indel.filt.anno | 第88-89页 |
附录15 群体共同Snp.filt.anno | 第89-90页 |
附录16 群体相同Snp.both | 第90-91页 |
致谢 | 第91-92页 |