| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 1 绪论 | 第9-20页 |
| 1.1 引言 | 第9页 |
| 1.2 传统DNA探针设计方法比较 | 第9-15页 |
| 1.2.1 探针设计的原理 | 第9-12页 |
| 1.2.2 不同探针设计软件的特异性筛选 | 第12-13页 |
| 1.2.3 不同探针设计软件的敏感性筛选 | 第13-14页 |
| 1.2.4 不同探针设计软件对解链温度(Tm值)的计算 | 第14-15页 |
| 1.3 探针设计软件的应用 | 第15-17页 |
| 1.4 各章内容安排 | 第17-20页 |
| 2 肽核酸(PNA)芯片探针设计算法研究 | 第20-30页 |
| 2.1 背景及现状 | 第20-21页 |
| 2.2 肽核酸(PNA)探针设计流程 | 第21-22页 |
| 2.3 PNA芯片探针的特异性检测 | 第22-28页 |
| 2.3.1 后缀数组(Suffix Array) | 第23-25页 |
| 2.3.2 改进的MAFFT算法 | 第25-28页 |
| 2.4 候选探针的筛选(一致性和敏感性检测) | 第28-29页 |
| 2.5 本章小结 | 第29-30页 |
| 3 算法应用实例及程序设计 | 第30-40页 |
| 3.1 基于后缀数组的检测探针序列串联重复部分的算法应用实例(特异性) | 第30-31页 |
| 3.2 程序设计与实现 | 第31-39页 |
| 3.2.1 程序功能结构 | 第32-33页 |
| 3.2.2 公共类设计 | 第33-34页 |
| 3.2.3 程序运行环境和设计结果 | 第34-35页 |
| 3.2.4 用户界面设计与介绍 | 第35-37页 |
| 3.2.5 算法应用实例 | 第37-39页 |
| 3.3 本章小结 | 第39-40页 |
| 4 结论与展望 | 第40-42页 |
| 4.1 工作总结 | 第40页 |
| 4.2 未来工作展望 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-48页 |
| 攻读学位期间主要的研究成果目录 | 第48-49页 |
| 致谢 | 第49页 |