摘要 | 第8-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
1 前言 | 第11-22页 |
1.1 葫芦科介绍 | 第11-12页 |
1.1.1 葫芦科经济价值 | 第11页 |
1.1.2 葫芦科物种的制约因素 | 第11-12页 |
1.2 分子标记种类及应用 | 第12-17页 |
1.2.1 分子标记介绍 | 第12页 |
1.2.2 基于DNA的标记 | 第12-13页 |
1.2.3 限制性片段长度多态性标记 | 第13页 |
1.2.4 小卫星标记 | 第13页 |
1.2.5 DNA序列多态性标记 | 第13-14页 |
1.2.6 单核苷酸多态性标记 | 第14页 |
1.2.7 基于PCR的标记 | 第14-15页 |
1.2.8 RAPD,ISSR,IRAP和AFLP | 第15页 |
1.2.9 简单重复序列标记 | 第15-17页 |
1.3 基因组测序介绍 | 第17-19页 |
1.3.1 基因组测序的历史 | 第17-18页 |
1.3.2 基因组测序技术的发展 | 第18-19页 |
1.4 基于测序的微卫星标记的应用 | 第19-20页 |
1.5 生物信息数据库的建立 | 第20-22页 |
2 材料与方法 | 第22-25页 |
2.1 数据来源 | 第22-23页 |
2.2 实验方法 | 第23-25页 |
2.2.1 葫芦科物种微卫星标记开发 | 第23页 |
2.2.2 引物开发 | 第23-24页 |
2.2.3 通用引物设计 | 第24-25页 |
3 结果与分析 | 第25-36页 |
3.1 微卫星标记开发及分析 | 第25-33页 |
3.1.1 基因组中不同类型SSRs的分布 | 第26-28页 |
3.1.2 EST序列中不同类型SSRs的分布 | 第28页 |
3.1.3 不同类型SSRs的特征 | 第28-33页 |
3.2 引物开发 | 第33-35页 |
3.2.1 SSRs中引物密度及其多态性 | 第33-34页 |
3.2.2 通用引物设计 | 第34-35页 |
3.3 葫芦科SSRs数据库的建立 | 第35-36页 |
4 讨论 | 第36-41页 |
4.1 葫芦科基因组中SSRs的频率和分布 | 第36-39页 |
4.2 葫芦科物种之间SSRs的碱基比例 | 第39-40页 |
4.3 葫芦科引物特征 | 第40-41页 |
5 结论 | 第41-42页 |
参考文献 | 第42-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
攻读学位期间发表论文情况 | 第53页 |