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灵长类特异基因ZNF480在Myogenin启动子上的锌指蛋白结合位点分析

中文摘要第3-5页
ABSTRACT第5-7页
第一章 引言和文献综述第11-24页
    1.1 转录调控第11-18页
        1.1.1 基因转录的调控第11-12页
        1.1.2 真核生物基因表达调控组件第12-18页
    1.2 锌指蛋白(zinc finger protein,ZFP)第18-22页
        1.2.1 锌指蛋白结构第18-19页
        1.2.2 锌指蛋白基因家族第19-22页
    1.3 本文研究意义第22-24页
第二章 材料与方法第24-47页
    2.1 材料第24-28页
        2.1.1 生物信息学软件第24页
        2.1.2 主要试剂第24-26页
        2.1.3 质粒、细胞和菌株第26-27页
        2.1.4 主要实验仪器和耗材第27-28页
    2.2 方法第28-47页
        2.2.1 灵长类特异KRAB框锌指蛋白分析第28页
        2.2.2 ZNF480基因的生物信息学分析第28-29页
        2.2.3 myogenin的生物信息学分析第29页
        2.2.4 探针设计与合成第29-31页
        2.2.5 PCR扩增第31-32页
        2.2.6 PCR产物纯化回收第32-33页
        2.2.7 载体连接实验第33页
        2.2.8 感受态细胞的制备第33-34页
        2.2.9 连接产物的转化第34页
        2.2.10 质粒的小量制备第34-35页
        2.2.11 阳性克隆的筛选与鉴定第35-36页
        2.2.12 测序第36页
        2.2.13 重组质粒的构建第36-37页
        2.2.14 常规细胞培养及转染第37-38页
        2.2.15 转基因稳定表达细胞系的建立第38-39页
        2.2.16 荧光素酶报告系统分析第39-40页
        2.2.17 细胞核蛋白提取第40-42页
        2.2.18 Western blot第42页
        2.2.19 凝胶阻滞(EMSA)实验第42-47页
第三章 实验结果及其分析第47-64页
    3.1 灵长类特异KRAB框锌指蛋白基序统计第47页
    3.2 本室几种KRAB框锌指蛋白对AP-1、SRE的转录活性数据分析第47-52页
    3.3 ZNF480与人、小鼠、大鼠myogenin启动子上锌指蛋白结合位点的EMSA实验第52-59页
        3.3.1 人、小鼠、大鼠myogenin启动子潜在的锌指蛋白结合位点生物信息学分析第52-54页
        3.3.2 ZNF480与myogenin启动子上潜在低保守度锌指蛋白结合位点EMSA实验第54-57页
            3.3.2.1 ZNF480与人ZBPF1低保守度锌指蛋白结合位点EMSA实验第54-55页
            3.3.2.2 ZNF480与人ZBPF16个点突变探针EMSA实验第55-57页
        3.3.3 ZNF480与高度保守的人ZBPF3、小鼠ZBPF2、大鼠ZBPF1潜在锌指蛋白结合位点EMSA实验第57-58页
        3.3.4 ZNF480与人ZBPF2、人ZBPF4潜在锌指蛋白结合位点EMSA实验第58-59页
    3.4 讨论第59-64页
第四章 结语第64-66页
第五章 其它工作第66-70页
    5.1 人类COL4A2基因背景资料介绍第66页
    5.2 COL4A2基因克隆至表达载体第66-68页
    5.3 用免疫共沉淀分析DAND5与FBN1的相互作用第68-69页
    5.4 讨论第69-70页
参考文献第70-85页
附录1第85-89页
附录2第89-90页
附录3第90-92页
后记第92-94页

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