| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第14-40页 |
| 1.1 微生物多样性研究 | 第14-33页 |
| 1.1.1 生物多样性 | 第14-20页 |
| 1.1.1.1 生物多样性的概况 | 第14-17页 |
| 1.1.1.2 生物多样性价值 | 第17-20页 |
| 1.1.2 胡杨林根系微生物多样性 | 第20-24页 |
| 1.1.2.1 新疆胡杨林自然背景与环境特征 | 第20页 |
| 1.1.2.2 胡杨的特性 | 第20-21页 |
| 1.1.2.3 植物根际微生物 | 第21-24页 |
| 1.1.3 微生物多样性研究方法 | 第24-33页 |
| 1.1.3.1 平板纯培养技术 | 第25-26页 |
| 1.1.3.2 Biolog微孔板分析技术 | 第26-27页 |
| 1.1.3.3 磷脂脂肪酸分析技术(PLFA) | 第27-28页 |
| 1.1.3.4 分子生物学技术 | 第28-33页 |
| 1.2 微生物多相分类学 | 第33-38页 |
| 1.2.1 表型特征 | 第33-34页 |
| 1.2.2 全细胞脂肪酸组分 | 第34-35页 |
| 1.2.3 细胞膜异戊烯醌类 | 第35页 |
| 1.2.4 细胞膜极性脂 | 第35页 |
| 1.2.5 细胞壁组成结构 | 第35-36页 |
| 1.2.6 多胺 | 第36页 |
| 1.2.7 16S rRNA序列分析 | 第36-37页 |
| 1.2.8 G+Cmol% | 第37页 |
| 1.2.9 多基因序列分型 | 第37-38页 |
| 1.2.10 DNA同源性分析 | 第38页 |
| 1.3 拟杆菌门的概述 | 第38-39页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第39-40页 |
| 第二章 新疆胡杨林根际土壤细菌多样性的研究 | 第40-64页 |
| 2.1 引言 | 第40页 |
| 2.2 材料与方法 | 第40-51页 |
| 2.2.1. 材料 | 第40-44页 |
| 2.2.1.1 样品的采集 | 第40-41页 |
| 2.2.1.2 试剂与药品 | 第41-43页 |
| 2.2.1.3 仪器与设备 | 第43-44页 |
| 2.2.2 方法 | 第44-51页 |
| 2.2.2.1 菌株的分离与纯化 | 第44-45页 |
| 2.2.2.2 菌种的有效保藏 | 第45页 |
| 2.2.2.3 基因组DNA的小量提取 | 第45-46页 |
| 2.2.2.4 16S rRNA基因序列PCR扩增 | 第46-47页 |
| 2.2.2.5 16S rRNA序列测定与对比 | 第47页 |
| 2.2.2.6 系统进化树的构建 | 第47-48页 |
| 2.2.2.7 脂肪酸组分检测 | 第48-51页 |
| 2.3 结果 | 第51-61页 |
| 2.3.1 菌株的分离与纯化 | 第51页 |
| 2.3.2 菌株形态特征 | 第51-53页 |
| 2.3.3 16S rRNA基因序列分析 | 第53-54页 |
| 2.3.4 全细胞脂肪酸组分的测定 | 第54-61页 |
| 2.4 讨论 | 第61-63页 |
| 2.5 小结 | 第63-64页 |
| 第三章 两个潜在新分类单元的多相分类学研究 | 第64-111页 |
| 3.1 引言 | 第64页 |
| 3.2 PONTIBACTER属 | 第64-65页 |
| 3.3 材料与方法 | 第65-68页 |
| 3.3.1 材料 | 第65-68页 |
| 3.3.1.1 菌株 | 第65页 |
| 3.3.1.2 培养基 | 第65页 |
| 3.3.1.4 试剂与药品 | 第65-67页 |
| 3.3.1.5 仪器与设备 | 第67-68页 |
| 3.4 方法 | 第68-80页 |
| 3.4.1 形态特征 | 第68-69页 |
| 3.4.2 生理生化特性检测 | 第69-73页 |
| 3.4.2.1 菌株耐受性检测 | 第69页 |
| 3.4.2.2 碳源的利用 | 第69-70页 |
| 3.4.2.3 酶学特性 | 第70-73页 |
| 3.4.3 化学分类 | 第73-78页 |
| 3.4.3.1 全细胞脂肪酸组分测定 | 第73-74页 |
| 3.4.3.2 细胞醌组分测定 | 第74-75页 |
| 3.4.3.3 磷酸类脂检测 | 第75-78页 |
| 3.4.4 分子系统学 | 第78-80页 |
| 3.4.4.1 基因组DNA大量提取 | 第78页 |
| 3.4.4.2 DNA的纯化 | 第78-80页 |
| 3.5 结果 | 第80-103页 |
| 3.5.1 菌株7-15~T | 第80-91页 |
| 3.5.1.1 形态特征 | 第80-81页 |
| 3.5.1.2 16S rRNA基因序列分析 | 第81-83页 |
| 3.5.1.3 API系统的检测结果 | 第83-85页 |
| 3.5.1.4 Biolog系统对碳源利用的检测 | 第85-86页 |
| 3.5.1.5 化学分类特征 | 第86-90页 |
| 3.5.1.6 G+C mol%的测定 | 第90-91页 |
| 3.5.2 菌株7-26~T | 第91-103页 |
| 3.5.2.1 形态特征 | 第91-93页 |
| 3.5.2.2 16S rRNA基因序列及系统发育分析 | 第93-95页 |
| 3.5.2.3 API系统的检测结果 | 第95-97页 |
| 3.5.2.4 Biolog系统对碳源利用的检测 | 第97-98页 |
| 3.5.2.5 化学分类 | 第98-103页 |
| 3.5.2.6 菌株7-26~T的基因组G+C mol% | 第103页 |
| 3.6 讨论 | 第103-110页 |
| 3.6.1 菌株7-15~T | 第103-107页 |
| 3.6.2 菌株7-26~T | 第107-110页 |
| 3.7 小结 | 第110-111页 |
| 附录 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-121页 |
| 攻读博士学位期间己发表和待发表论文目录 | 第121-122页 |
| 致谢 | 第122页 |
