| 摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-15页 |
| 第一章 前言 | 第19-43页 |
| 1.1 穗菝葜的概况及研究现状 | 第19-26页 |
| 1.1.1 穗菝葜生物学特征和分类历史 | 第19-20页 |
| 1.1.2 穗菝葜分布区的地理气候特征和植被类型 | 第20-22页 |
| 1.1.3 穗菝葜的研究进展 | 第22-26页 |
| 1.2 古地中海植物区系生物地理学相关研究进展及存在问题 | 第26-33页 |
| 1.2.1 生物地理学分布格局形成学说 | 第26-27页 |
| 1.2.2 地中海形成的地史过程 | 第27-28页 |
| 1.2.3 新生代地中海地质气候的变化及其对植物区系的影响 | 第28-29页 |
| 1.2.4 古地中海植物区系在青藏高原隆起后的演变和发展 | 第29-30页 |
| 1.2.5 古地中海起源的植被类群生物地理学研究 | 第30-33页 |
| 1.2.6 存在问题 | 第33页 |
| 1.3 亲缘地理学研究的意义与方法 | 第33-41页 |
| 1.3.1 亲缘地理学简介 | 第33-34页 |
| 1.3.2 亲缘地理学相关理论 | 第34-37页 |
| 1.3.3 亲缘地理学研究中应用的分子标记 | 第37-41页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第41-43页 |
| 第二章 野外取样及群落调查 | 第43-57页 |
| 2.1 穗菝葜的地理分布 | 第43页 |
| 2.2 穗菝葜的野外取样与群落调查 | 第43-49页 |
| 2.2.1 野外调查与取样 | 第43-44页 |
| 2.2.2 标本样品取样 | 第44-49页 |
| 2.3 不同地区穗菝葜生境特点 | 第49-57页 |
| 2.3.1 环地中海地区 | 第49-52页 |
| 2.3.2 东非地区 | 第52-53页 |
| 2.3.3 南亚(喜马拉雅)地区 | 第53-57页 |
| 第三章 基于核DNA和叶绿体DNA联合片段的系统发育研究 | 第57-75页 |
| 3.1 材料与方法 | 第58-69页 |
| 3.1.1 材料 | 第58-60页 |
| 3.1.2 主要试剂、仪器及其来源 | 第60-61页 |
| 3.1.3 实验方法 | 第61-64页 |
| 3.1.4 数据分析 | 第64-69页 |
| 3.2 结果分析 | 第69-71页 |
| 3.2.1 联合片段一致性检测 | 第69-70页 |
| 3.2.2 联合序列系统树分析 | 第70页 |
| 3.2.3 基于联合片段的分歧时间分析 | 第70-71页 |
| 3.3 讨论 | 第71-75页 |
| 第四章 基于cpDNA序列的亲缘地理学研究 | 第75-103页 |
| 4.1 材料与方法 | 第75-82页 |
| 4.1.1 材料 | 第75页 |
| 4.1.2 主要试剂、仪器及其来源 | 第75-76页 |
| 4.1.3 实验方法 | 第76-77页 |
| 4.1.4 群体遗传与谱系地理结构分析 | 第77-79页 |
| 4.1.5 历史生物地理学分析 | 第79-82页 |
| 4.2 结果分析 | 第82-97页 |
| 4.2.1 叶绿体基因间隔区的序列变异和单倍型分布 | 第82-83页 |
| 4.2.2 叶绿体基因间隔区单倍型系统发育关系 | 第83-84页 |
| 4.2.3 群体内遗传多样性和遗传结构分析 | 第84-90页 |
| 4.2.4 群体动态历史分析 | 第90-93页 |
| 4.2.5 穗菝葜分化时间的计算和生物地理学分析 | 第93-97页 |
| 4.3 讨论 | 第97-103页 |
| 4.3.1 遗传多样性和遗传结构 | 第97-100页 |
| 4.3.2 谱系地理结构与谱系分化时间 | 第100-101页 |
| 4.3.3 群体动态历史 | 第101页 |
| 4.3.4 穗菝莫祖先分布区重建 | 第101-103页 |
| 第五章 基于核基因ITS和Agt1序列的亲缘地理学研究 | 第103-123页 |
| 5.1 材料与方法 | 第103-111页 |
| 5.1.1 材料 | 第103-104页 |
| 5.1.2 主要试剂、仪器及其来源 | 第104页 |
| 5.1.3 主要仪器 | 第104页 |
| 5.1.4 方法 | 第104-109页 |
| 5.1.5 数据分析 | 第109-111页 |
| 5.2 结果分析 | 第111-118页 |
| 5.2.1 ITS序列分析 | 第111页 |
| 5.2.2 Agt1序列分析及中性检验 | 第111页 |
| 5.2.3 基于ITS单倍型系统发育关系 | 第111-118页 |
| 5.3 讨论 | 第118-123页 |
| 第六章 基于形态证据的系统发育分析 | 第123-137页 |
| 6.1 材料与方法 | 第124-126页 |
| 6.1.1 材料的来源 | 第124页 |
| 6.1.2 形态性状的选择 | 第124-125页 |
| 6.1.3 性状极性分析及编码 | 第125页 |
| 6.1.4 数据分析 | 第125-126页 |
| 6.2 结果分析 | 第126-130页 |
| 6.2.1 不同地区的穗菝莫形态多样性分析 | 第126-127页 |
| 6.2.2 穗菝葜基于形态学证据的系统发育学分析 | 第127-130页 |
| 6.3 讨论 | 第130-137页 |
| 第七章 讨论 | 第137-148页 |
| 7.1 穗菝葜的第三纪谱系分化和间断分布模式的形成 | 第138-140页 |
| 7.2 东非-南亚(喜马拉雅)谱系的迁移和地理隔离机制 | 第140-143页 |
| 7.3 地中海谱系的起源与与群体动态历史 | 第143-146页 |
| 7.4 不同基因片段的谱系分选比较 | 第146-148页 |
| 第八章 总结与展望 | 第148-151页 |
| 8.1 结论 | 第148-149页 |
| 8.2 展望 | 第149-151页 |
| 参考文献 | 第151-170页 |
| 附录 | 第170-180页 |
| 博士期间发表论文及出国研修情况 | 第180-181页 |
| 致谢 | 第181-182页 |
