| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词 | 第16-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-41页 |
| 1.1 微生物生态学概述 | 第17-18页 |
| 1.2 微生物分子生态学研究方法 | 第18-27页 |
| 1.2.1 以核酸分子杂交技术为基础的方法 | 第19页 |
| 1.2.2 以PCR技术为基础的方法 | 第19-22页 |
| 1.2.3 高通量测序技术 | 第22-27页 |
| 1.3 微生物群落多样性生态学相关数据分析及软件应用 | 第27-30页 |
| 1.4 氮循环及氨氧化微生物的研究 | 第30-32页 |
| 1.4.1 氮循环概述 | 第30-31页 |
| 1.4.2 氨氧化微生物多样性研究进展 | 第31-32页 |
| 1.5 湿地研究概述 | 第32-36页 |
| 1.5.1 湿地的概念及其生态学意义 | 第32-33页 |
| 1.5.2 湿地分类及现状 | 第33-34页 |
| 1.5.3 湿地生物多样性的研究 | 第34-36页 |
| 1.5.4 湿地生态系统中氮循环 | 第36页 |
| 1.6 纳帕海高原湿地自然概况及研究 | 第36-38页 |
| 1.7 本研究目的及意义 | 第38-41页 |
| 第二章 环境因子与纳帕海高原湿地微生物数量相关性研究 | 第41-61页 |
| 2.1 引言 | 第41-42页 |
| 2.2 材料与方法 | 第42-48页 |
| 2.2.1 土壤样品的采集及保存 | 第42-43页 |
| 2.2.2 土壤样品理化因子的测定 | 第43-44页 |
| 2.2.3 土壤样品DNA的提取 | 第44-46页 |
| 2.2.4 细菌、古菌及真菌数量的荧光定量PCR检测 | 第46-47页 |
| 2.2.5 数据分析 | 第47-48页 |
| 2.3 结果与分析 | 第48-57页 |
| 2.3.1 采样区分布情况 | 第48-49页 |
| 2.3.2 土壤样品基因DNA电泳图 | 第49页 |
| 2.3.3 土壤样品理化因子测定及相关性分析 | 第49-53页 |
| 2.3.4 土壤样品微生物数量的分布特征 | 第53-55页 |
| 2.3.5 土壤样品微生物数量与土壤理化因子相关性分析 | 第55-57页 |
| 2.4 讨论 | 第57-60页 |
| 2.5 小结 | 第60-61页 |
| 第三章 纳帕海高原湿地微生物群落多样性与组成分析 | 第61-96页 |
| 3.1 引言 | 第61-62页 |
| 3.2 材料与方法 | 第62-65页 |
| 3.2.1 土壤样品的采集及DNA的提取 | 第62页 |
| 3.2.2 PCR扩增 | 第62-63页 |
| 3.2.3 高通量测序及数据处理分析 | 第63-65页 |
| 3.3 结果与分析 | 第65-88页 |
| 3.3.1 PCR扩增结果 | 第65页 |
| 3.3.2 土壤样品中细菌群落多样性和组成分析 | 第65-76页 |
| 3.3.3 土壤样品中古菌群落多样性和组成分析 | 第76-82页 |
| 3.3.4 土壤样品中真菌群落多样性和组成分析 | 第82-88页 |
| 3.4 讨论 | 第88-93页 |
| 3.5 小结 | 第93-96页 |
| 第四章 纳帕海高原湿地氨氧化微生物群落多样性研究 | 第96-113页 |
| 4.1 引言 | 第96-97页 |
| 4.2 材料与方法 | 第97-100页 |
| 4.2.1 土壤样品的采集与DNA的提取 | 第97页 |
| 4.2.2 土壤样品理化因子的测定 | 第97页 |
| 4.2.3 氨氧化微生物amoA基因的PCR扩增 | 第97-98页 |
| 4.2.4 PCR产物回收纯化 | 第98页 |
| 4.2.5 氨氧化微生物amoA基因克隆文库的构建 | 第98-99页 |
| 4.2.6 氨氧化微生物相关统计学分析 | 第99页 |
| 4.2.7 氨氧化微生物amoA基因的系统发育分析 | 第99页 |
| 4.2.8 氨氧化微生物amoA荧光定量PCR分析 | 第99-100页 |
| 4.2.9 氨氧化微生物与土壤理化因子相关性分析 | 第100页 |
| 4.3 结果与分析 | 第100-109页 |
| 4.3.1 土壤理化因子测定结果 | 第100-101页 |
| 4.3.2 AOA和AOB amoA基因的扩增 | 第101-102页 |
| 4.3.3 AOA和AOB群落分布与多样性分析 | 第102-103页 |
| 4.3.4 AOA和AOB群落组成差异性分析 | 第103-104页 |
| 4.3.5 AOA和AOB组成系统发育分析 | 第104-107页 |
| 4.3.6 AOA和AOB群落多样性与土壤理化因子典型相关分析 | 第107-108页 |
| 4.3.7 AOA和AOB amoA基因荧光定量PCR分析 | 第108-109页 |
| 4.4 讨论 | 第109-111页 |
| 4.5 小结 | 第111-113页 |
| 结论与展望 | 第113-118页 |
| 研究结论 | 第113-116页 |
| 创新点 | 第116页 |
| 展望 | 第116-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-139页 |
| 附录 | 第139页 |
