| 致谢 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第11-29页 |
| 1.1 分子系统地理学简介 | 第11-14页 |
| 1.1.1 中性突变和分子钟 | 第11-12页 |
| 1.1.2 奠基者效应和瓶颈效应 | 第12-13页 |
| 1.1.3 溯祖理论 | 第13页 |
| 1.1.4 距离隔离模型 | 第13-14页 |
| 1.2 分子标记与海藻分子系统地理学研究 | 第14-17页 |
| 1.2.1 单位点分子标记 | 第14-16页 |
| 1.2.2 多位点分子标记 | 第16-17页 |
| 1.3 影响大型海藻分子系统地理学模式的非生物因素 | 第17-19页 |
| 1.3.1 温度 | 第17-18页 |
| 1.3.2 盐度 | 第18页 |
| 1.3.3 海岸线结构及潮间带底质 | 第18-19页 |
| 1.3.4 洋流 | 第19页 |
| 1.4 影响大型海藻分子系统地理学模式的生物因素 | 第19-21页 |
| 1.4.1 生活史 | 第19-20页 |
| 1.4.2 扩散能力 | 第20-21页 |
| 1.5 典型海域大型海藻分子系统地理学研究进展 | 第21-28页 |
| 1.5.1 北大西洋 | 第21-24页 |
| 1.5.2 西北太平洋 | 第24-25页 |
| 1.5.3 东南太平洋 | 第25-27页 |
| 1.5.4 东南亚海域 | 第27页 |
| 1.5.5 北美西海岸 | 第27-28页 |
| 1.6 本研究的目的及意义 | 第28-29页 |
| 第二章 北大西洋掌形藻居群遗传结构和谱系分化研究 | 第29-47页 |
| 2.1 前言 | 第29-30页 |
| 2.2 材料与方法 | 第30-32页 |
| 2.2.1 实验材料，器材及试剂 | 第30页 |
| 2.2.2 基因组DNA提取 | 第30-31页 |
| 2.2.3 基因片段的扩增和测序 | 第31-32页 |
| 2.3 数据处理 | 第32-33页 |
| 2.3.1 居群遗传结构分析 | 第32页 |
| 2.3.2 历史基因流和分化时间 | 第32-33页 |
| 2.3.3 历史居群大小变动 | 第33页 |
| 2.4 结果 | 第33-44页 |
| 2.4.1 遗传多样性 | 第33-34页 |
| 2.4.2 居群遗传结构 | 第34-39页 |
| 2.4.3 分化时间 | 第39-40页 |
| 2.4.4 历史居群大小 | 第40-44页 |
| 2.5 讨论 | 第44-47页 |
| 2.5.1 居群演化过程及避难所 | 第44-46页 |
| 2.5.2 居群历史动态及分化时间 | 第46-47页 |
| 第三章 北大西洋宽果藻不同繁殖类群遗传结构及动态历史研究 | 第47-70页 |
| 3.1 前言 | 第47-48页 |
| 3.2 材料与方法 | 第48-50页 |
| 3.2.1 实验材料，器材及试剂 | 第48页 |
| 3.2.2 基因组DNA提取 | 第48页 |
| 3.2.3 基因片段的扩增和测序 | 第48-50页 |
| 3.3 数据处理 | 第50-53页 |
| 3.3.1 遗传多样性及居群结构分析 | 第50页 |
| 3.3.2 距离隔离模型、分化时间及基因流分析 | 第50-53页 |
| 3.3.3 居群动态变动 | 第53页 |
| 3.4 结果 | 第53-67页 |
| 3.4.1 单倍型网状图，分化时间及连锁分析 | 第53-60页 |
| 3.4.2 居群分化及基因流 | 第60-64页 |
| 3.4.3 居群大小变动 | 第64-67页 |
| 3.5 讨论 | 第67-70页 |
| 3.5.1 杂交及谱系分布 | 第67页 |
| 3.5.2 欧洲沿岸居群的分化及扩张 | 第67-68页 |
| 3.5.3 居群动态历史和跨大西洋迁移 | 第68-70页 |
| 第四章 海流对西北太平洋鼠尾藻居群结构影响的研究 | 第70-91页 |
| 4.1 前言 | 第70-72页 |
| 4.2 材料与方法 | 第72-73页 |
| 4.2.1 实验材料、器材及试剂 | 第72页 |
| 4.2.2 基因组DNA提取 | 第72页 |
| 4.2.3 基因片段的扩增和测序 | 第72-73页 |
| 4.3 数据处理 | 第73-77页 |
| 4.3.1 遗传多样性、单倍型网状图及谱系树构建 | 第73-74页 |
| 4.3.2 居群遗传结构和中性检验 | 第74-77页 |
| 4.3.3 距离隔离模型和基因流 | 第77页 |
| 4.4 结果 | 第77-87页 |
| 4.4.1 遗传多样性和谱系树 | 第77-81页 |
| 4.4.2 居群遗传结构 | 第81-85页 |
| 4.4.3 距离隔离模型及基因流 | 第85-87页 |
| 4.5 讨论 | 第87-91页 |
| 4.5.1 鼠尾藻的系统地理结构 | 第87-89页 |
| 4.5.2 洋流及居群结构 | 第89-91页 |
| 第五章 西北太平洋羊栖菜的居群遗传结构和演化历史研究 | 第91-111页 |
| 5.1 前言 | 第91-92页 |
| 5.2 材料与方法 | 第92-94页 |
| 5.2.1 实验材料，器材及试剂 | 第92页 |
| 5.2.2 基因组DNA提取 | 第92页 |
| 5.2.3 基因片段的扩张与测序 | 第92-94页 |
| 5.3 数据处理 | 第94-95页 |
| 5.3.1 遗传多样性，谱系分析及主成分分析（PCoA） | 第94页 |
| 5.3.2 谱系间分化时间 | 第94-95页 |
| 5.3.3 有效居群大小 | 第95页 |
| 5.4 结果 | 第95-107页 |
| 5.4.1 遗传多样性和单倍型分布 | 第95-98页 |
| 5.4.2 谱系分析及居群变异 | 第98-103页 |
| 5.4.3 主成分分析和谱系分化时间 | 第103-104页 |
| 5.4.4 有效居群大小的变动 | 第104-107页 |
| 5.5 讨论 | 第107-111页 |
| 5.5.1 羊栖菜系统地理结构及其影响因素 | 第107-108页 |
| 5.5.2 谱系C居群的亚结构 | 第108-109页 |
| 5.5.3 居群大小变动 | 第109-111页 |
| 第六章 总结 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-131页 |
| 附录 | 第131-132页 |
| 作者简历及发表的学术论文 | 第132-133页 |
