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单核细胞增生李斯特菌:应激转录组学与RsbX对SigB表达和细菌存活的调控

摘要第10-13页
Abstract第13-16页
第一章 文献综述第19-41页
    1 单核细胞增生李斯特菌概述第19-23页
    2 单核细胞增生李斯特菌的致病机理第23-24页
    3 单核细胞增生李斯特菌的毒力因子及其调控第24-31页
        3.1 粘附与侵袭相关因子第24-26页
        3.2 胞内增殖与迁移相关因子第26-29页
        3.3 毒力调控因子第29-31页
    4 单核细胞增生李斯特菌的抗应激作用第31-38页
        4.1 SigB应激调控因子第31-35页
        4.2 酸应激第35-36页
        4.3 渗透压应激第36-37页
        4.4 应激交叉保护第37-38页
    5 研究目的第38-41页
第二章 单核细胞增生李斯特菌报告质粒的构建及其在抗应激研究中的应用第41-57页
    1 材料与方法第42-49页
        1.1 菌株及其培养第42页
        1.2 主要试剂和仪器第42页
        1.3 生物信息学分析第42页
        1.4 重组SigB蛋白表达及多克隆体制备第42-46页
        1.5 携带不同启动子的报告质粒构建第46-47页
        1.6 不同启动子的比较第47-48页
        1.7 不同应激对启动子的激活第48-49页
    2 结果第49-54页
        2.1 生物信息学分析第49-50页
        2.2 携带σ~B激活的启动子和gfp报告质粒pERL3-P_x::gfp的鉴定第50页
        2.3 重组SigB蛋白表达纯化及抗体效价第50-51页
        2.4 不同启动子的敏感性差异比较第51-52页
        2.5 不同应激对σ~B激活能力的比较第52-53页
        2.6 不同应激时间和应激强度对σ~B激活能力的比较第53-54页
    3 讨论第54-57页
第三章 转录组测序(RNA-Seq)技术分析单核细胞增生李斯特菌在不同应激中的基因表达差异第57-72页
    1 材料与方法第58-63页
        1.1 菌株及其培养第58页
        1.2 主要试剂第58页
        1.3 应激试验第58页
        1.4 RNA提取第58-60页
        1.5 cDNA文库制备第60-62页
        1.6 文库制备产物质量检测第62页
        1.7 Illumina Solexa测序及序列组装第62页
        1.8 RNA-Seq数据的处理第62页
        1.9 荧光定量PCR验证第62-63页
    2 结果与分析第63-71页
        2.1 样品质量检测第63-64页
        2.2 RNA-Seq数据分析结果第64-70页
        2.3 差异表达基因的荧光定量PCR验证第70-71页
    3 讨论第71-72页
第四章 单核细胞增生李斯特菌rsbX基因的生物学功能第72-96页
    第一节 单核细胞增生李斯特菌rsbX缺失株的构建以及抗体制备第72-82页
        1 材料与方法第72-77页
            1.1 菌株及其培养第73页
            1.2 主要试剂和质粒第73页
            1.3 重组表达质粒构建第73-74页
            1.4 重组RsbX蛋白表达及多克隆抗体的制备第74页
            1.5 rsbX基因缺失株及回补株的构建第74-76页
            1.6 基因转录和蛋白表达水平变化分析第76-77页
        2 结果第77-82页
            2.1 重组表达质粒pET30a-RsbX的鉴定第77-78页
            2.2 重组RsbX蛋白的表达纯化及抗体效价第78-79页
            2.3 rsbX基因缺失株及回补株的鉴定第79-82页
    第二节 单核细胞增生李斯特菌rsbX基因的生物学功能分析第82-95页
        1 材料与方法第82-87页
            1.1 菌株、细胞及培养条件第82-83页
            1.2 质粒、主要试剂和仪器第83页
            1.3 生长试验第83页
            1.4 生物被膜试验第83-84页
            1.5 红细胞溶血试验第84页
            1.6 溶脂试验第84页
            1.7 菌落形成大小试验第84-85页
            1.8 运动能力试验第85页
            1.9 细胞间迁移试验第85页
            1.10 细胞粘附与侵袭试验第85-86页
            1.11 小鼠毒力试验第86-87页
        2 结果第87-95页
            2.1 rsbX基因不影响单增李斯特菌的体外生长特性第87-88页
            2.2 rsbX基因影响单增李斯特菌的生物被膜形成能力第88页
            2.3 rsbX基因不影响单增李斯特菌的溶血能力第88-89页
            2.4 rsbX基因不影响单增李斯特菌的溶脂能力第89-90页
            2.5 rsbX基因影响单增李斯特菌菌落形成大小第90-91页
            2.6 rsbX基因影响单增李斯特菌的运动能力第91页
            2.7 rsbX基因影响单增李斯特菌的细胞间迁移能力第91-92页
            2.8 rsbX基因影响单增李斯特菌的粘附与侵袭能力第92-93页
            2.9 rsbX基因不影响单增李斯特菌对小鼠的毒力第93-95页
    第三节 讨论第95-96页
第五章 单核细胞增生李斯特菌rsbX基因在抗应激过程中的作用机制第96-129页
    第一节 单核细胞增生李斯特菌rsbX基因的抗应激作用第96-107页
        1 材料与方法第97-100页
            1.1 菌株及其培养第97页
            1.2 质粒、主要试剂和仪器第97页
            1.3 生物信息学分析第97页
            1.4 应激生长试验第97-98页
            1.5 应激存活试验第98页
            1.6 交叉应激试验第98-99页
            1.7 ATP水平分析第99-100页
            1.8 转录水平分析第100页
            1.9 蛋白水平分析第100页
        2 结果第100-106页
            2.1 生物信息学分析第100页
            2.2 rsbX基因不影响单增李斯特菌的应激生长第100-101页
            2.3 rsbX基因不影响单增李斯特菌的应激存活率第101-102页
            2.4 rsbX基因不影响单增李斯特菌的交叉应激存活率第102-103页
            2.5 rsbX基因不影响单增李斯特菌的ATP水平第103-104页
            2.6 rsbX基因缺失对sigB转录水平的影响第104-105页
            2.7 rsbX基因缺失对SigB蛋白水平的影响第105-106页
        3 讨论第106-107页
    第二节 单增李斯特菌rsbX基因在应激后的调控作用第107-122页
        1 材料与方法第107-111页
            1.1 菌株及其培养第107-108页
            1.2 质粒、主要试剂和仪器第108页
            1.3 基因缺失株的构建第108-109页
            1.4 报告质粒的构建第109页
            1.5 应激-恢复-再应激存活试验第109-110页
            1.6 应激后恢复期转录水平分析第110页
            1.7 应激后恢复期启动子活性分析第110-111页
            1.8 应激后恢复期蛋白水平分析第111页
            1.9 应激后恢复期ATP水平分析第111页
        2 结果第111-120页
            2.1 基因缺失株的鉴定第111-112页
            2.2 报告质粒的鉴定第112-113页
            2.3 rsbX基因介导恢复后再应激的存活率第113-115页
            2.4 rsbX基因介导应激后恢复期的sigB转录水平第115-116页
            2.5 rsbX基因介导应激后恢复期的sigB启动子活性第116-118页
            2.6 rsbX基因介导应激后恢复期的SigB蛋白水平第118-119页
            2.7 rsbX基因介导应激后恢复期的ATP水平第119-120页
        3 讨论第120-122页
    第三节 单增李斯特菌rsbX基因在生长平台期的调控作用第122-129页
        1 材料与方法第122-124页
            1.1 菌株及其培养第122页
            1.2 主要试剂和质粒第122-123页
            1.3 平台期应激存活试验第123页
            1.4 平台期转录水平分析第123-124页
            1.5 平台期启动子活性分析第124页
            1.6 平台期蛋白水平分析第124页
            1.7 平台期ATP水平分析第124页
        2 结果第124-128页
            2.1 rsbX基因介导平台期的存活率第124-125页
            2.2 rsbX基因介导平台期的sigB转录水平第125-126页
            2.3 rsbX基因介导平台期的sigB启动子活性第126页
            2.4 rsbX基因介导平台期的SigB蛋白水平第126-127页
            2.5 rsbX基因介导平台期的ATP水平第127-128页
        3 讨论第128-129页
全文结论第129-130页
创新点第130-131页
展望第131-132页
参考文献第132-146页
作者简介第146-148页
致谢第148-149页

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