| 缩略词表 | 第1-8页 |
| 中文摘要 | 第8-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-18页 |
| ·蛋白质翻译后修饰 | 第11-12页 |
| ·蛋白质泛素化 | 第12页 |
| ·β-TrCP | 第12-14页 |
| ·原核生物的类泛素化 | 第14-18页 |
| 第2章 β-TrCP 介导泛素化的生物信息学分析 | 第18-42页 |
| ·引言 | 第18-19页 |
| ·材料与方法 | 第19-37页 |
| ·数据收集和整理 | 第19页 |
| ·GPS 2.2 算法 | 第19-21页 |
| ·性能评估 | 第21-22页 |
| ·实验材料 | 第22-23页 |
| ·本论文中所用载体及其来源 | 第22页 |
| ·本论文中所用质粒 | 第22页 |
| ·本论文中所用细胞株及其来源 | 第22页 |
| ·本论文中所用抗体及其来源 | 第22页 |
| ·本论文中所用试剂及其来源 | 第22-23页 |
| ·实验方法 | 第23-37页 |
| ·PCR 反应 | 第23页 |
| ·琼脂糖电泳及DNA 片段的回收 | 第23-24页 |
| ·酶切反应 | 第24页 |
| ·连接反应 | 第24页 |
| ·制备E.coli 感受态细胞 | 第24-26页 |
| ·质粒转化 | 第26页 |
| ·质粒DNA 的小量制备 | 第26-27页 |
| ·大批量质粒DNA 的制备 | 第27-29页 |
| ·定点突变 | 第29-30页 |
| ·细胞培养 | 第30页 |
| ·原核系统蛋白质表达和纯化 | 第30-31页 |
| ·脂质体法转染 | 第31-32页 |
| ·磷酸钙法转染 | 第32-33页 |
| ·细胞裂解液的制备 | 第33页 |
| ·GST pull-down 实验 | 第33-34页 |
| ·免疫沉淀 | 第34-35页 |
| ·蛋白质降解实验 | 第35-36页 |
| ·蛋白质Western 印迹法 | 第36-37页 |
| ·结果 | 第37-41页 |
| ·基于GPS 2.2 算法的GPS-BeTrIP 1.0 的开发 | 第37-39页 |
| ·GPS-BeTrIP 1.0 预测结果的实验验证 | 第39-41页 |
| ·讨论 | 第41-42页 |
| 第3章 原核生物类泛素化的生物信息学预测 | 第42-58页 |
| ·引言 | 第42-44页 |
| ·材料与方法 | 第44-48页 |
| ·数据收集和整理 | 第44页 |
| ·GPS 2.2 算法 | 第44-46页 |
| ·统计性显著分析 | 第46-47页 |
| ·性能评估 | 第47页 |
| ·在线服务和程序包下载 | 第47-48页 |
| ·结果 | 第48-57页 |
| ·PUP 保守性的分析 | 第48-49页 |
| ·基于GPS 2.2 算法的GPS-PUP 1.0 的开发 | 第49-51页 |
| ·预测性能比较 | 第51-52页 |
| ·Pupylation 位点的大规模预测以及底物的统计显著性分析 | 第52-57页 |
| ·讨论 | 第57-58页 |
| 第4章 参考文献 | 第58-62页 |
| 第5章 致谢 | 第62-64页 |
| 第6章 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第64页 |
