基于禁忌搜索的RNA二级结构预测研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-14页 |
| ·研究背景及意义 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-12页 |
| ·论文工作与安排 | 第12-14页 |
| 第二章 RNA 序列与结构 | 第14-26页 |
| ·RNA 的生物学背景 | 第14-16页 |
| ·RNA 的生物学知识 | 第16-22页 |
| ·RNA 的组成 | 第16-19页 |
| ·RNA 的种类及功能 | 第19-20页 |
| ·RNA 的生物结构 | 第20-22页 |
| ·RNA 的二级结构定义 | 第22-25页 |
| ·RNA 的二级结构 | 第22-23页 |
| ·RNA 二级结构图形表示 | 第23-24页 |
| ·RNA 二级结构数学定义 | 第24-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第三章 RNA 二级结构预测模型 | 第26-39页 |
| ·比较序列分析法 | 第26-27页 |
| ·共变模型 | 第26-27页 |
| ·随机上下文无关语法模型 | 第27页 |
| ·动态规划算法 | 第27-32页 |
| ·最大碱基配对算法 | 第27-31页 |
| ·最小自由能算法 | 第31-32页 |
| ·启发式算法 | 第32-38页 |
| ·遗传算法 | 第33-34页 |
| ·基于排列的进化算法 | 第34-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 基于禁忌搜索的RNA 二级结构预测 | 第39-68页 |
| ·禁忌搜索算法 | 第39-41页 |
| ·RNA 的禁忌搜索算法 | 第41-49页 |
| ·RNA 的禁忌搜索算法模型 | 第41-42页 |
| ·RNA 结构模型转化中的问题 | 第42-44页 |
| ·RNA 的禁忌搜索算法实现的技术问题 | 第44-49页 |
| ·RNA 的禁忌搜索算法实现 | 第49-58页 |
| ·算法流程描述 | 第49页 |
| ·集中性搜索实现步骤 | 第49-50页 |
| ·扩充性搜索实现步骤 | 第50-52页 |
| ·RNATS 算法终止条件 | 第52页 |
| ·RNATS 算法 | 第52-53页 |
| ·RNATS 算法开发平台 | 第53-54页 |
| ·RNATS 算法编程实现 | 第54-58页 |
| ·RNA 的禁忌搜索算法实验 | 第58-67页 |
| ·集中性搜索实验对比 | 第58-59页 |
| ·参数设置 | 第59-63页 |
| ·两种算法实验对比 | 第63-67页 |
| ·本章小结 | 第67-68页 |
| 第五章 总结与展望 | 第68-70页 |
| ·总结 | 第68-69页 |
| ·展望 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-74页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第74-75页 |
