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蓝猪耳(Torenia fournieri L.)肌动蛋白基因的克隆及生物信息学分析

缩写词第4-5页
摘要第5-6页
Abstract第6页
1 前言第11-23页
    1.1 文献综述第11-22页
        1.1.1 高等植物肌动蛋白研究进展第11-13页
            1.1.1.1 高等植物肌动蛋白的性质第11页
            1.1.1.2 高等植物肌动蛋白的功能第11-13页
            1.1.1.3 肌动蛋白的分子生物学研究第13页
        1.1.2 种子贮藏蛋白及其基因启动子研究进展第13-17页
            1.1.2.1 植物启动子的一般结构第14-15页
            1.1.2.2 种子贮藏蛋白基因启动子的结构和功能研究第15-16页
            1.1.2.3 种子贮藏蛋白基因启动子的应用第16页
            1.1.2.4 问题与展望第16-17页
        1.1.3 反义 RNA技术及其在植物学研究中的应用第17-22页
            1.1.3.1 天然存在的反义 RNA及其作用第17-18页
            1.1.3.2 反义 RNA的作用机理第18-19页
            1.1.3.3 反义 RNA技术在植物学研究中的应用第19-22页
    1.2 引言第22-23页
        1.2.1 研究目的和意义第22页
        1.2.2 研究内容第22-23页
2 材料和方法第23-38页
    2.1 实验材料第23-26页
        2.1.1 植物材料第23页
        2.1.2 载体及菌株第23页
        2.1.3 购买的药品及试剂第23-24页
        2.1.4 主要仪器设备第24页
        2.1.5 常用试剂及配制第24-26页
            2.1.5.1 高盐低 pH值法所用主要试剂第24页
            2.1.5.2 SDS法所用主要试剂第24-25页
            2.1.5.3 CTAB法所用主要试剂第25页
            2.1.5.4 蓝白斑筛选用试剂第25页
            2.1.5.5 细菌培养基第25页
            2.1.5.6 碱法提取质粒 DNA所用溶液第25页
            2.1.5.7 常用抗生素储备液浓度第25页
            2.1.5.8 其他分子生物学常用溶液第25-26页
    2.2 实验方法第26-38页
        2.2.1 蓝猪耳基因组 DNA的提取第26-27页
            2.2.1.1 高盐低pH值法第26页
            2.2.1.2 SDS法第26-27页
            2.2.1.3 CTAB法第27页
            2.2.1.4 蓝猪耳基因组 DNA产量和质量的检测第27页
        2.2.2 蓝猪耳肌动蛋白基因的克隆第27-32页
            2.2.2.1 PCR引物的设计第27-28页
            2.2.2.2 PCR预扩增第28页
            2.2.2.3 PCR扩增第28-29页
            2.2.2.4 PCR产物的切胶回收第29页
            2.2.2.5 PCR产物与载体的连接第29-30页
            2.2.2.6 大肠杆菌感受态细胞的制备第30页
            2.2.2.7 大肠杆菌感受态细胞的转化与蓝白斑筛选第30-31页
            2.2.2.8 重组质粒的小量提取(碱裂解法)第31页
            2.2.2.9 重组质粒的酶切鉴定第31页
            2.2.2.10 重组质粒的PCR鉴定第31-32页
            2.2.2.11 PCR产物的测序第32页
        2.2.3 蓝猪耳肌动蛋白基因的生物信息学分析第32-33页
            2.2.3.1 测序结果的同源性检索分析第32页
            2.2.3.2 蓝猪耳肌动蛋白基因外显子/内含子的预测第32页
            2.2.3.3 蓝猪耳肌动蛋白基因编码氨基酸序列的推导第32页
            2.2.3.4 蓝猪耳肌动蛋白基因编码氨基酸序列中肌动蛋白信号的搜索第32页
            2.2.3.5 蓝猪耳肌动蛋白基因编码氨基酸序列的同源建模第32-33页
            2.2.3.6 蓝猪耳肌动蛋白基因的系统发育分析第33页
        2.2.4 蓝猪耳肌动蛋白基因在叶片中的表达分析第33-35页
            2.2.4.1 蓝猪耳 RNA的提取与快速检测第33-34页
            2.2.4.2 蓝猪耳第一链cDNA的合成第34页
            2.2.4.3 蓝猪耳TF-ACT2部分编码区的PCR扩增第34-35页
        2.2.5 反义蓝猪耳肌动蛋白基因种子特异性表达载体的构建第35-38页
            2.2.5.1 反义TF-ACF2基因片段的获得第35-36页
            2.2.5.2 中间载体pCAMBIA1390~+的构建第36-38页
3 结果和分析第38-55页
    3.1 不同提取方法的DNA纯度和产率第38页
    3.2 三种提取方法的DNA完整性第38-39页
    3.3 Mg~(2+)浓度梯度对 PCR扩增效果的影响第39-40页
    3.4 PCR扩增结果与产物的克隆鉴定第40-41页
        3.4.1 肌动蛋白基因部分序列的PCR扩增与克隆鉴定第40-41页
        3.4.2 肌动蛋白基因全长序列的PCR扩增与克隆鉴定第41页
    3.5 重组质粒插入片段的测序第41-43页
        3.5.1 重组质粒pAct.tf 1插入片段的测序第41-42页
        3.5.2 重组质粒pAct.tf 2插入片段的测序第42-43页
    3.6 蓝猪耳肌动蛋白基因的生物信息学分析第43-52页
        3.6.1 重组质粒插入片段测序结果的同源性检索分析第43-44页
        3.6.2 TF-ACT1、TF-ACT2外显子/内含子的预测第44-47页
        3.6.3 TF-ACT2编码氨基酸序列的推导第47-49页
        3.6.4 TF-ACT2编码氨基酸序列中肌动蛋白信号的搜索第49-50页
        3.6.5 TF-ACT2编码氨基酸序列的同源建模第50页
        3.6.6 蓝猪耳肌动蛋白基因的系统发育分析第50-52页
    3.7 蓝猪耳TF-ACT2在叶片中的表达分析第52页
    3.8 反义蓝猪耳肌动蛋白基因种子特异性表达载体的构建第52-55页
        3.8.1 pAct.tf 459的验证第52-54页
            3.8.1.1 pAct.tf459的Bgl II/BstE II双酶切验证第53页
            3.8.1.2 pAct.tf459的 PCR验证第53-54页
        3.8.2 中间载体pCAMBIA1390~+的验证第54-55页
4 讨论第55-60页
    4.1 试验材料的选择第55页
    4.2 蓝猪耳基因组 DNA的提取第55-56页
    4.3 PCR条件的优化第56-57页
    4.4 蓝猪耳肌动蛋白基因的克隆策略第57页
    4.5 分子生物学和生物信息学分析软件的使用第57-58页
    4.6 肌动蛋白基因的分子系统发育分析第58-59页
    4.7 利用蓝猪耳肌动蛋白基因种子特异性反义表达获得无核性状的理论设想第59-60页
5 结论第60-61页
参考文献第61-66页
图版第66-68页
在读期间发表论文目录第68-69页
附录 扩增片段测序报告第69-77页
致谢第77页

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