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少棘蜈蚣线粒体基因组全序列和平耳孔蜈蚣的地理种群遗传变异分析

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第一章 多足总纲线粒体基因组和地理种群遗传变异分析的研究进展第8-20页
    1.1 多足总纲线粒体基因组的研究进展第8-14页
        1.1.1 多足总纲线粒体基因组的研究背景第8-9页
        1.1.2 多足总纲线粒体基因组的重排第9-12页
        1.1.3 多足总纲线粒体基因组的重排机制第12-14页
    1.2 地理种群遗传变异分析的研究进展第14-17页
        1.2.1 地理种群遗传变异分析的研究背景第14-15页
        1.2.2 地理种群遗传变异分析的研究内容第15-16页
        1.2.3 地理种群遗传变异分析的分子标记第16-17页
        1.2.4 地理种群遗传变异分析的分析方法第17页
    参考文献第17-20页
第二章 补全少棘蜈蚣线粒体基因组全序列第20-42页
    引言第20页
    2.1 材料与方法第20-25页
        2.1.1 材料第20-21页
        2.1.2 DNA的提取第21页
        2.1.3 mtDNA的扩增第21页
        2.1.4 测序策略第21-25页
        2.1.5 基因序列比对及基因组分析第25页
    2.2 结果与讨论第25-36页
        2.2.1 少棘蜈蚣线粒体基因组结构第25-27页
        2.2.2 基因组成和基因顺序第27-30页
        2.2.3 基因组的核苷酸组成第30-31页
        2.2.4 蛋白质编码基因的核苷酸组成第31-32页
        2.2.5 非编码区第32-33页
        2.2.6 tRNA基因第33-36页
    参考文献第36-42页
第三章 平耳孔蜈蚣的地理种群遗传变异分析第42-57页
    3.1 实验材料与方法第42-47页
        3.1.1 平耳孔蜈蚣样地选择第42页
        3.1.2 平耳孔蜈蚣的鉴定方法第42-46页
        3.1.3 DNA的提取第46页
        3.1.4 PCR扩增和测序第46-47页
        3.1.5 序列分析第47页
    3.2 结果与讨论第47-53页
        3.2.1 序列变异和种群遗传多样性第47-48页
        3.2.2 种群结构和遗传变异分析第48-49页
        3.2.3 种群间遗传分化第49-50页
        3.2.4 地理种群之间的系统发生关系第50-51页
        3.2.5 TCS网络图分析第51-52页
        3.2.6 单元型之间的最小跨度网络图分析第52-53页
    参考文献第53-57页
附录1: 少棘蜈蚣基因组轻链核苷酸和蛋白编码基因的氨基酸序列第57-64页
附录2: 58个个体的细胞色素b基因序列定义的26个单元型第64-65页
附录3: 26个单元型间的遗传距离第65-67页
致谢第67页

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