| 致谢 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 1 研究背景 | 第18-43页 |
| 1.1 植物免疫系统 | 第18-27页 |
| 1.1.1 PMAP诱发的植物免疫 | 第19-21页 |
| 1.1.2 效应子诱发的植物免疫 | 第21-23页 |
| 1.1.3 番茄Cf-4与Avr4及Cf-9与Avr9互作 | 第23-27页 |
| 1.2 植物非寄主抗性研究进展 | 第27-35页 |
| 1.2.1 植物非寄主抗性类型 | 第27-29页 |
| 1.2.2 植物非寄主抗性机理 | 第29-34页 |
| 1.2.3 植物非寄主抗性和植物寄主抗性的协同调控 | 第34-35页 |
| 1.2.4 植物非寄主抗性的应用 | 第35页 |
| 1.3 农杆菌与植物互作研究进展 | 第35-38页 |
| 1.3.1 农杆菌及其发现 | 第35-36页 |
| 1.3.2 根癌农杆菌的侵染过程 | 第36页 |
| 1.3.3 农杆菌与植物互作研究进展 | 第36-37页 |
| 1.3.4 农杆菌对植物-病原微生物互作的影响 | 第37-38页 |
| 1.4 DNA甲基化及其对植物抗病性的调控作用研究进展 | 第38-41页 |
| 1.4.1 DNA甲基化及去甲基化 | 第38-39页 |
| 1.4.2 DNA甲基化对基因表达调控的影响 | 第39-40页 |
| 1.4.3 DNA甲基化在植物发育中的作用 | 第40页 |
| 1.4.4 DNA甲基化对植物抗病性的调控作用 | 第40-41页 |
| 1.5 本论文研究的目的和意义 | 第41-43页 |
| 2 番茄抗叶霉病基因Cf-4和Cf-9的表达调控机理分析 | 第43-69页 |
| 2.1 材料与方法 | 第45-52页 |
| 2.1.1 实验材料和取样 | 第45页 |
| 2.1.2 基因表达的实时荧光定量PCR分析 | 第45-46页 |
| 2.1.3 番茄总DNA提取 | 第46页 |
| 2.1.4 DNA甲基化检测分析 | 第46-47页 |
| 2.1.5 靶标番茄Cf-4和Cf-9的miRNA预测 | 第47页 |
| 2.1.6 miRNA对靶标基因的降解功能分析 | 第47-48页 |
| 2.1.7 番茄甲基化酶和去甲基化酶基因家族鉴定 | 第48页 |
| 2.1.8 番茄甲基化酶和去甲基化酶基因家族的VIGS功能分析 | 第48-52页 |
| 2.2 结果与分析 | 第52-66页 |
| 2.2.1 株龄对Cf-4和Cf-9基因表达以及启动子962-1284 bp区域甲基化程度的影响 | 第52-53页 |
| 2.2.2 温度对Cf-4和Cf-9基因表达以及启动子序列甲基化程度的影响 | 第53-55页 |
| 2.2.3 Avr对Cf-4和Cf9基因表达以及启动子序列甲基化程度的影响 | 第55-58页 |
| 2.2.4 番茄甲基化酶和去甲基化酶基因家族的鉴定 | 第58-59页 |
| 2.2.5 番茄甲基化酶和去甲基化酶家族基因沉默对Cf-4和Cf-9基因表达的影响 | 第59-61页 |
| 2.2.6 番茄甲基化酶和去甲基化酶基因沉默对Cf-4和Cf-9基因甲基化的影响 | 第61-62页 |
| 2.2.7 番茄甲基化酶和去甲基化酶家族基因沉默对Cf-4和Cf-9介导的活性氧积累的影响 | 第62-64页 |
| 2.2.8 靶标Cf4和Cf-9基因的miRNA预测 | 第64页 |
| 2.2.9 miRCf-4/9对Cf-4和Cf-9基因表达调控的影响 | 第64-66页 |
| 2.3 讨论 | 第66-69页 |
| 3 本氏烟中Cf-4介导的HR调控基因的筛选和功能分析 | 第69-91页 |
| 3.1 材料与方法 | 第70-76页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第70页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第70-76页 |
| 3.2 结果与分析 | 第76-86页 |
| 3.2.1 Ca~(2+)信号传导途径在Cf-4介导HR中作用的药理学分析 | 第76-78页 |
| 3.2.2 9 个基因对Cf-4介导HR中作用的VIGS分析 | 第78-81页 |
| 3.2.2.1 用于沉默分析的9个基因 | 第78页 |
| 3.2.2.2 基因沉默处理对植株生长的影响 | 第78-79页 |
| 3.2.2.3 VIGS沉默效率检测 | 第79-80页 |
| 3.2.2.4 9个基因的沉默对Cf-4介导的HR的影响 | 第80-81页 |
| 3.2.3 Cf-4介导HR的调控基因的cDNA文库VIGS筛选 | 第81-86页 |
| 3.3 讨论 | 第86-91页 |
| 4 Xoo介导的非寄主抗性调控基因的筛选和功能分析 | 第91-119页 |
| 4.1 材料与方法 | 第92-95页 |
| 4.1.1 材料 | 第92页 |
| 4.1.2 细菌的培养及接种 | 第92-93页 |
| 4.1.3 本氏烟叶片活性氧染色分析 | 第93页 |
| 4.1.4 外源H_2O_2处理与本氏烟叶片中H_2O_2的清除 | 第93页 |
| 4.1.5 PR和HR标志基因表达检测 | 第93-94页 |
| 4.1.6 本氏烟基因沉默分析 | 第94页 |
| 4.1.7 Xoo菌量计数 | 第94页 |
| 4.1.8 本氏烟基因沉默cDNA均一化文库的构建 | 第94-95页 |
| 4.2 结果与分析 | 第95-102页 |
| 4.2.1 Xoo诱导本氏烟产生强烈的HR | 第95-96页 |
| 4.2.2 本氏烟中Xoo诱导HR的影响因素 | 第96-99页 |
| 4.2.3 Xoo诱导的本氏烟非寄主抗性的生理和分子特征 | 第99-102页 |
| 4.3 H_2O_2在Xoo诱导的本氏烟非寄主抗性中的作用 | 第102-107页 |
| 4.3.1 外源施加H_2O_2促使Xoo诱导的HR更早产生 | 第102-104页 |
| 4.3.2 H_2O_2的清除抑制本氏烟中Xoo诱导的HR的产生 | 第104-106页 |
| 4.3.3 Xoo T3SS突变体菌株不能诱导H_2O_2的积累和HR的产生 | 第106-107页 |
| 4.4 从抗病差异表达基因中筛选Xoo诱导的HR调控基因 | 第107-110页 |
| 4.4.1 5个基因的沉默对Xoo诱导的HR的影响 | 第107-108页 |
| 4.4.2 5个基因的沉默对Xoo诱导的非寄主抗性的影响 | 第108-109页 |
| 4.4.3 5个基因的沉默对Xoo诱导的活性氧积累的影响 | 第109-110页 |
| 4.5 Xoo诱导的HR调控基因的本氏烟叶片cDNA文库VIGS初筛 | 第110-111页 |
| 4.5.1 本氏烟cDNA文库序列基因沉默 | 第110页 |
| 4.5.2 Xoo诱导的HR调控基因的筛选 | 第110-111页 |
| 4.6 硫氧还蛋白h型基因的抗病调控功能分析 | 第111-115页 |
| 4.6.1 TRX蛋白序列分析 | 第111-112页 |
| 4.6.2 NtTRXh在Xoo诱导的HR中的作用 | 第112-114页 |
| 4.6.3 NtTRXh在Xoo诱导的非寄主抗性中的作用 | 第114-115页 |
| 4.7 讨论 | 第115-119页 |
| 5 根癌农杆菌对本氏烟-Xoo非寄主抗性互作的影响及作用机制 | 第119-139页 |
| 5.1 材料和方法 | 第120-123页 |
| 5.1.1 材料 | 第120页 |
| 5.1.2 Xoo PXO99A抗性菌株构建 | 第120-121页 |
| 5.1.3 农杆菌及Xoo PXO99A接种 | 第121页 |
| 5.1.4 菌落计数 | 第121页 |
| 5.1.5 本氏烟叶片中活性氧染色 | 第121页 |
| 5.1.6 本氏烟RNA的提取及基因表达检测 | 第121页 |
| 5.1.7 农杆菌对过氧化氢的耐受力分析 | 第121-123页 |
| 5.2 结果与分析 | 第123-136页 |
| 5.2.1 农杆菌菌株GV3101抑制本氏烟中Xoo PXO99A诱导的HR | 第123-124页 |
| 5.2.2 农杆菌GV3101抑制Xoo诱导HR的时空特异性 | 第124-126页 |
| 5.2.3 其他三种农杆菌对本氏烟中Xoo诱导HR的影响 | 第126-127页 |
| 5.2.4 农杆菌GV3101强烈抑制Xoo生长 | 第127-129页 |
| 5.2.5 农杆菌菌株LBA4404和EHA105对Xoo生长有一定抑制作用,但抑制作用弱于GV3101菌株 | 第129-130页 |
| 5.2.6 农杆菌GV3101的Ti质粒是重要的抑菌因子 | 第130-132页 |
| 5.2.7 农杆菌菌株LBA4404和EHA105通过抑制本氏烟中H_2O_2的积累抑制Xoo诱导的HR | 第132-133页 |
| 5.2.8 四种农杆菌菌株对H_2O_2的降解能力没有显著差别 | 第133-134页 |
| 5.2.9 农杆菌菌株LBA4404、EHA105和C58C1对Xoo T3SS基因表达的影响 | 第134-136页 |
| 5.3 讨论 | 第136-139页 |
| 6 全文小结与研究展望 | 第139-142页 |
| 6.1 全文小结 | 第139-140页 |
| 6.2 研究展望 | 第140-142页 |
| 附文植物病原细菌中吩嗪-1-羧酸合成基因生物信息学分析及鉴定 | 第142-166页 |
| 1.1 材料与方法 | 第143-146页 |
| 1.1.1 材料 | 第143页 |
| 1.1.2 phz基因的获得以及植物病原细菌的筛选 | 第143页 |
| 1.1.3 植物病原细菌phz基因的鉴定及保守结构域分析 | 第143-144页 |
| 1.1.4 Phz蛋白序列进化树构建 | 第144页 |
| 1.1.5 PCA的提取与鉴定 | 第144-145页 |
| 1.1.6 PCA抑菌活性检测 | 第145页 |
| 1.1.7 Pst DC3000基因phzF突变体构建 | 第145页 |
| 1.1.8 Pst DC3000致病性检测及菌量计数 | 第145-146页 |
| 1.2 结果与分析 | 第146-163页 |
| 1.2.1 植物病原细菌中phz基因的鉴定 | 第146页 |
| 1.2.2 植物病原细菌中Phz的种类和数量 | 第146-151页 |
| 1.2.3 植物病原细菌phz基因在基因组上的排列 | 第151-152页 |
| 1.2.4 各个Phz蛋白系统进化树构建 | 第152-160页 |
| 1.2.5 Pst DC3000和Xoo PXO99A中PCA合成的鉴定 | 第160-161页 |
| 1.2.6 Pst DC3000和Xoo PXO99A对PCA耐受性检测 | 第161页 |
| 1.2.7 PCA是Pst DC3000的重要致病因子 | 第161-163页 |
| 1.3 讨论 | 第163-166页 |
| 参考文献 | 第166-179页 |
| 附录 论文相关缓冲液及培养基配方 | 第179-182页 |
| 作者攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第182页 |
