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基于生物信息学的甲状腺癌生物标志物的筛选及验证

中文摘要第4-10页
Abstract第10-16页
第1章 绪论第21-44页
    1.1 甲状腺癌第21-34页
        1.1.1 甲状腺癌概况第21-22页
        1.1.2 甲状腺癌的病理分型及症状第22-25页
        1.1.3 甲状腺癌的相关危险因素第25-27页
        1.1.4 甲状腺癌的诊断第27-28页
        1.1.5 甲状腺癌的相关分子生物学研究第28-34页
    1.2 生物信息学第34-37页
        1.2.1 生物信息学概述第34-35页
        1.2.2 生物信息学的应用第35-37页
    1.3 肿瘤标志物第37-44页
        1.3.1 肿瘤标志物的定义第37-38页
        1.3.2 肿瘤标志物的分类第38页
        1.3.3 肿瘤标志物的功能第38-39页
        1.3.4 临床常用肿瘤标志物及意义第39-41页
        1.3.5 肿瘤标志物的筛选方法第41页
        1.3.6 肿瘤标志物的评价标准第41-42页
        1.3.7 目前用于临床肿瘤标志物的缺点和不足第42-44页
第2章 材料方法第44-59页
    2.1 研究对象第44-45页
        2.1.1 样本来源及标准第44页
        2.1.2 样本数量第44页
        2.1.3 组织、血液样本与临床资料的收集及处理第44-45页
            2.1.3.1 组织样本的采集与保存第44-45页
            2.1.3.2 血液样品的处理与保存第45页
    2.2 主要试剂、仪器和器材第45-47页
        2.2.1 主要试剂第45-46页
        2.2.2 主要仪器第46页
        2.2.3 主要器材第46-47页
    2.3 基因和 miRNA 表达的高通量检测第47页
    2.4 生物信息学分析第47-51页
        2.4.1 miRNA 靶基因的预测第47-48页
        2.4.2 The Cancer GenomeAtlas (TCGA)第48-50页
        2.4.3 差异表达基因的筛选第50-51页
        2.4.4 差异表达基因的验证第51页
    2.5 主要实验方法第51-56页
        2.5.1 细胞株第51页
        2.5.2 培养液配制第51-52页
        2.5.3 D-Hank’s 液的配制第52页
        2.5.4 胰酶的配制第52页
        2.5.5 细胞冻存和复苏第52页
        2.5.6 RNA 提取第52-53页
        2.5.7 Real-time PCR 检测目的基因第53-56页
    2.6 数据分析第56-58页
        2.6.1 数据库的建立第56-58页
        2.6.2 ROC 曲线第58页
        2.6.3 诊断标志物评价指标第58页
    2.7 统计分析第58-59页
第3章 结果第59-132页
    3.1 甲状腺癌样本资料的一般情况第59页
    3.2 高通量芯片差异表达 miRNA 和基因筛选第59页
    3.3 差异表达 miRNA 靶基因预测第59-66页
    3.4 差异表达miRNA 和基因作为肿瘤标志物及与病理特征的分析第66-123页
        3.4.1 差异表达 miRNA第66-81页
        3.4.2 差异表达基因第81-123页
    3.5 甲状腺乳头状癌差异表达 miRNA 与靶基因筛选第123-124页
    3.6 甲状腺癌辐射敏感 miRNA 的筛选第124-126页
    3.7 验证 AXIN2 在甲状腺乳头状癌肿瘤组织中的表达第126页
    3.8 AXIN2 在甲状腺癌血中的表达及作为肿瘤标志物的分析第126-132页
第4章 讨论第132-146页
    4.1 利用生物信息学分析大数据的意义第132-133页
    4.2 基因芯片的数据挖掘第133-135页
    4.3 差异表达 miRNA 及基因与甲状腺乳头状癌的关系第135-138页
    4.4 辐射与甲状腺癌差异表达 miRNA第138页
    4.5 差异表达基因与甲状腺乳头状癌的关系第138-144页
    4.6 肿瘤标志物的筛选第144-146页
结论第146-148页
参考文献第148-174页
附件第174-177页
作者简介及科研成果第177-179页
致谢第179-180页

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