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利用诱导多能干细胞研究丙戊酸诱发Alpers-Huttenlocher综合征肝毒性的机理

摘要第5-7页
ABSTRACT第7页
第一章 绪论第12-38页
    1.1 引言第12页
    1.2 线粒体疾病的研究进展第12-17页
    1.3 Alpers综合征的研究进展第17-23页
    1.4 丙戊酸(VPA)引发肝毒性的研究进展第23-26页
    1.5 线粒体疾病的治疗研究进展第26-29页
    1.6 人诱导多能干细胞疾病模型研究进展第29-33页
        1.6.1 诱导多能干细胞第29页
        1.6.2 遗传疾病模型及机制研究第29-33页
    1.7 肝细胞体外分化的研究第33-38页
第二章 实验方法与实验步骤第38-62页
    2.1 AHS病人iPSCs细胞的诱导第38-39页
        2.1.1 AHS病人细胞的获得和培养第38页
        2.1.2 AHS iPSCs细胞的诱导第38-39页
    2.2 AHS-iPSCs细胞的扩大培养与日常维持第39-40页
    2.3 AHS-iPSCs细胞的鉴定第40-44页
        2.3.1 突变类型以及核型的确认第40页
        2.3.2 碱性磷酸酶染色鉴定第40-41页
        2.3.3 免疫荧光染色第41页
        2.3.4 实时定量PCR方法鉴定内源性和外源多能性基因的表达第41-42页
        2.3.5 启动子去甲基化鉴定第42-44页
        2.3.6 AHS iPSCs细胞体外自发分化成拟胚体及鉴定第44页
        2.3.7 畸胎瘤分析第44页
    2.4 AHS iPSCs细胞体外肝分化第44-47页
        2.4.1 AHS iPSCs体外肝分化方法第44-45页
        2.4.2 AHS iPSCs来源的肝细胞的鉴定第45-47页
    2.5 AHS iPSCs-Hep线粒体功能相关指标检测第47-57页
        2.5.1 AHS iPSCs-Hep线粒体形态的电镜观察第47-48页
        2.5.2 AHS iPSCs-Hep线粒体形态的激光共聚焦显微镜观察第48页
        2.5.3 AHS iPSCs-Hep细胞ATP的检测第48-49页
        2.5.4 AHS iPSCs-Hep线粒体复合物Ⅳ的功能的检测第49页
        2.5.5 AHS iPSCs-Hep线粒体DNA含量的检测第49-50页
        2.5.6 Western检测AHS iPSCs-Hep线粒体DNA聚合酶POLG表达量第50-52页
        2.5.7 Western检测VPA处理和未处理的细胞的凋亡相关蛋白的表达情况第52页
        2.5.8 Western检测VPA处理和未处理的细胞的细胞色素c的表达情况第52-53页
        2.5.9 Western检测AHS iPSCs-Hep OPA1(optic atrophy 1)复合物与溶解的OPA 第53页
        2.5.10 AHS iPSCs-Hep乳酸和丙酮酸含量的检测第53-54页
        2.5.11 AHS iPSCs-Hep细胞活性氧ROS检测第54-55页
        2.5.12 AHS iPSCs-Hep谷胱甘肽含量的检测第55页
        2.5.13 质谱法检测AHS iPSCs-Hep细胞中VPA代谢产物4-ene-VPA第55-56页
        2.5.14 AHS iPSCs-Hep细胞线粒体超氧炫的检测第56页
        2.5.15 AHS iPSCs-Hep细胞线粒体mPTP孔道检测第56-57页
    2.6 药物处理AHS iPSCs-Hep以及凋亡检测第57-58页
        2.6.1 VPA处理分化的AHS iPSCs-Hep第57页
        2.6.2 N-乙酰半胱氨酸(NAC),乙酰胆碱(Carnitine)处理分化的AHS iPSCs-Hep第57页
        2.6.3 环孢素CsA等抗氧化剂处理分化的AHS iPSCs-Hep第57-58页
    2.7 分子克隆,肝细胞过表达线粒体DNA聚合酶POLG第58-62页
        2.7.1 PCR扩增人POLG基因第58-59页
        2.7.2 POLG片段和pRLenti载体的酶切第59-60页
        2.7.3 酶切后的产物连接、转化、涂板、摇菌、大提质粒第60页
        2.7.4 pRLenti-POLG慢病毒的包装第60-61页
        2.7.5 感染分化的AHS iPSCs-Hep第61-62页
第三章 实验结果与实验数据第62-88页
    3.1 Alpers病人来源的诱导多能干细胞的获得与鉴定第62-68页
        3.1.1 Alpers综合征病人成纤维细胞的获得以及培养第62页
        3.1.2 AHS iPSCs的诱导第62-63页
        3.1.3 AHS iPSCs的鉴定第63-68页
    3.2 Alpers病人来源的体外诱导分化的肝细胞的获得与鉴定第68-72页
        3.2.1 AHS iPSCs体外定向分化为肝细胞样细胞第68-69页
        3.2.2 AHS iPSCs分化过程中表达各个阶段特异性标志物第69页
        3.2.3 AHS iPSCs-Hep表达肝细胞特征性基因第69-71页
        3.2.4 AHS iPSCs-Hep具有肝脏特征性功能第71-72页
    3.3 AHS iPSCs-Hep在体外培养过程加入丙戊酸(VPA)处理时更容易凋亡第72页
    3.4 VPA导致AHS iPSCs-Hep的凋亡是通过线粒体途径的第72-75页
        3.4.1 线粒体凋亡途径的凋亡蛋白Caspase 9和Caspase 3蛋白发生剪切第73页
        3.4.2 细胞色素c的释放第73-74页
        3.4.3 线粒体内膜上OPA1复合体组成异常第74-75页
    3.5 AHS iPSCs-Hep线粒体形态与功能存在缺陷第75-79页
        3.5.1 电镜显示AHS iPSCs-Hep线粒体形态异常第75-76页
        3.5.2 AHS iPSCs-Hep核基因POLG突变仍然存在第76页
        3.5.3 AHS iPSCs-Hep线粒体DNA聚合酶表达情况第76-77页
        3.5.4 AHS iPSCs-Hep线粒体DNA的含量变化第77-78页
        3.5.5 AHS iPSCs-Hep产生ATP的功能异常第78-79页
    3.6 线粒体通透转运孔道(mitochondrial permeability transitionpore,mPTP)的开放产生的超氧炫(superoxide flashes)在AHS iPSCs-Hep线粒体中更加频繁第79-82页
        3.6.1 AHS iPSCs-Hep线粒体中的活性氧(ROS)水平研究第79页
        3.6.2 AHS iPSCs-Hep线粒体中发生超氧炫更加频繁第79-81页
        3.6.3 AHS iPSCs-Hep线粒体通透转运孔道(mPTP)开放频率大于Ctrl iPSCs-Hep和H1 ESCs-Hep第81-82页
    3.7 mPTP的抑制剂可以缓解AHS iPSCs-Hep对VPA引起的凋亡的敏感性第82-85页
        3.7.1 普通抑制活性氧(ROS)的抑制剂不能缓解AHS iPSCs-Hep对VPA引起的凋亡的敏性第83页
        3.7.2 mPTP的抑制剂可以缓解AHS iPSCs-Hep对VPA引起的凋亡的敏感性第83-84页
        3.7.3 AHS iPSCs-Hep线粒体中可能组成mPTP的复合物的组成和功能变化第84-85页
    3.8 传统药物乙酰胆碱(carnitine)和N-乙酰半胱氨酸(NAC)可以缓解AHSiPSCs-Hep对VPA引起的凋亡的敏感性第85-88页
        3.8.1 carintine对于VPA代谢产物4-ene-VPA的影响第85-86页
        3.8.2 NAC对于细胞中谷胱甘肽(GSH)的影响第86-87页
        3.8.3 传统药物乙酰胆碱(carnitine)和N-乙酰半胱氨酸(NAC)可以缓解AHS iPSCs-Hep对VPA引起的凋亡的敏感性第87-88页
第四章 讨论第88-91页
参考文献第91-106页
附录一 实验材料与试剂第106-108页
    1. 实验动物第106页
    2. 实验仪器及耗材第106页
    3. 实验试剂第106-108页
        3.1 人胚胎干细胞以及iPSCs的培养和传代第106页
        3.2 AHS iPSCs诱导第106页
        3.3 iPSCs鉴定第106-107页
        3.4 肝分化第107页
        3.5 肝细胞鉴定第107-108页
        3.6 凋亡检测第108页
        3.7 分子克隆相关试剂第108页
附录二 实验中使用的引物序列与抗体第108-114页
致谢第114-115页
在读期间取得的科研成果第115页

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