基于序列信息的重组热点和蛋白质折叠识别
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-16页 |
| 1.1 课题研究的背景 | 第9-10页 |
| 1.2 课题研究的目的和意义 | 第10-11页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第11-13页 |
| 1.3.1 重组热点识别研究现状 | 第11-12页 |
| 1.3.2 蛋白质折叠识别研究现状 | 第12-13页 |
| 1.4 本课题的研究内容 | 第13-14页 |
| 1.5 本课题的组织结构 | 第14-16页 |
| 第2章 基于序列信息的特征 | 第16-24页 |
| 2.1 引言 | 第16页 |
| 2.2 序列 | 第16-17页 |
| 2.2.1 DNA序列 | 第16页 |
| 2.2.2 蛋白质序列 | 第16-17页 |
| 2.3 基于序列信息的特征 | 第17-23页 |
| 2.3.1 Kmer | 第17页 |
| 2.3.2 Gapped kmer | 第17-18页 |
| 2.3.3 位置特异性得分矩阵 | 第18-19页 |
| 2.3.4 伪氨基酸组成 | 第19-21页 |
| 2.3.5 自协方差 | 第21-22页 |
| 2.3.6 Bi-gram特征 | 第22页 |
| 2.3.7 五种属性特征 | 第22-23页 |
| 2.4 本章小结 | 第23-24页 |
| 第3章 基于gapped kmer的重组热点识别 | 第24-34页 |
| 3.1 引言 | 第24页 |
| 3.2 重组热点识别 | 第24-25页 |
| 3.3 预测方法 | 第25-29页 |
| 3.3.1 DNA向量化方法 | 第25页 |
| 3.3.2 分类模型构建 | 第25-29页 |
| 3.3.3 交叉验证评价方法 | 第29页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第29-33页 |
| 3.4.1 重组热点数据集 | 第29页 |
| 3.4.2 性能评价指标 | 第29-30页 |
| 3.4.3 性能评估 | 第30-33页 |
| 3.5 本章小结 | 第33-34页 |
| 第4章 基于多特征的蛋白质折叠识别 | 第34-52页 |
| 4.1 引言 | 第34页 |
| 4.2 序列预处理 | 第34-35页 |
| 4.3 预测方法 | 第35-39页 |
| 4.3.1 蛋白质向量化方法 | 第35-37页 |
| 4.3.2 分类模型构建 | 第37-39页 |
| 4.4 实验结果分析 | 第39-51页 |
| 4.4.1 折叠识别数据集 | 第39-42页 |
| 4.4.2 性能评价指标 | 第42页 |
| 4.4.3 性能评估 | 第42-51页 |
| 4.5 本章小结 | 第51-52页 |
| 结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 攻读硕士期间发表的论文及其它成果 | 第59-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
