| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略语表 | 第9-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-17页 |
| 1.1 植物多倍体形成中的遗传与表观遗传机制 | 第10-11页 |
| 1.2 非整倍体遗传与基因表达研究 | 第11-12页 |
| 1.3 植物体远缘杂交和异附加系的创建研究 | 第12-13页 |
| 1.4 高通量测序技术进展 | 第13-15页 |
| 1.4.1 高通量测序简介 | 第13-14页 |
| 1.4.2 高通量测序技术在动植物基因组和基因表达研究中的应用 | 第14-15页 |
| 1.4.2.1 动植物基因组从头测序 | 第14页 |
| 1.4.2.2 动植物基因组重测序 | 第14-15页 |
| 1.4.2.3 转录组和表观遗传研究 | 第15页 |
| 1.5 甘蓝型油菜起源、进化及种质创新研究 | 第15-16页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第16-17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-24页 |
| 2.1 实验材料 | 第17-18页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第17页 |
| 2.1.2 实验仪器与设备、试剂盒、试剂、酶 | 第17-18页 |
| 2.2 方法 | 第18-24页 |
| 2.2.1 附加系植株的鉴定 | 第18-20页 |
| 2.2.1.1 分子生物学手段：AFLP | 第18-20页 |
| 2.2.1.2 形态学鉴定 | 第20页 |
| 2.2.1.3 细胞学手段 | 第20页 |
| 2.2.2RNA-seq | 第20-24页 |
| 2.2.2.1 材料准备 | 第20-21页 |
| 2.2.2.2 提取RNA，检测浓度和质量 | 第21页 |
| 2.2.2.3 RNA-seq文库制备 | 第21页 |
| 2.2.2.4 测序及数据处理 | 第21-22页 |
| 2.2.2.5 差异表达基因（DEGs）的筛选 | 第22-23页 |
| 2.2.2.6 Gene Ontology（GO）功能显著性富集分析 | 第23-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-42页 |
| 3.1 附加系细胞学鉴定与表型观察 | 第24-25页 |
| 3.2 clean reads的获得与定位 | 第25-26页 |
| 3.3 附加系中甘蓝型油菜基因组基因表达变化 | 第26-27页 |
| 3.4 甘蓝型油菜不同表达水平的基因受影响程度分析 | 第27-28页 |
| 3.5 A、C基因组的基因表达受影响程度分析 | 第28-29页 |
| 3.6 A、C 基因组内不同亚基因组基因表达受影响程度分析 | 第29-31页 |
| 3.7 差异表达的基因在各染色体上的分布 | 第31-39页 |
| 3.8 四个附加系材料与亲本甘蓝型油菜之间表达的相关性分析 | 第39-40页 |
| 3.9 差异表达基因的GO富集分析 | 第40-42页 |
| 4.讨论 | 第42-45页 |
| 参考文献 | 第45-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
