西门塔尔牛肉质性状低密度芯片的基因组选择
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 基因组选择的优势 | 第11-12页 |
| 1.2 基因组选择的计算方法和研究进展 | 第12-15页 |
| 1.2.1 估计基因组育种值 | 第12-14页 |
| 1.2.2 基因组育种值的评价指标及影响因素 | 第14-15页 |
| 1.3 基因组选择在畜禽中的应用现状 | 第15页 |
| 1.4 基因组选择存在的问题和展望 | 第15-16页 |
| 1.5 全基因组关联分析的统计分析及研究进展 | 第16-18页 |
| 1.5.1 全基因组关联分析的实验设计及分析方法 | 第17页 |
| 1.5.2 群体分层的校正 | 第17-18页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-23页 |
| 2.1 实验材料 | 第19页 |
| 2.2 基因型数据处理 | 第19页 |
| 2.2.1 基因型数据的质量控制 | 第19页 |
| 2.2.2 基因型的填充 | 第19页 |
| 2.3 表型性状数据处理 | 第19-20页 |
| 2.3.1 性状表型记录的测定 | 第20页 |
| 2.3.2 性状表型的校正 | 第20页 |
| 2.4 统计分析 | 第20-23页 |
| 2.4.1 全基因组关联分析 | 第20-21页 |
| 2.4.2 筛选低密度标记及育种值估计 | 第21-22页 |
| 2.4.3 交叉验证和准确性 | 第22-23页 |
| 第三章 实验结果 | 第23-34页 |
| 3.1 高密度芯片基因型信息及质量控制结果 | 第23页 |
| 3.2 表型性状 | 第23页 |
| 3.3 全基因组关联分析结果 | 第23-28页 |
| 3.3.1 群体遗传结构 | 第23-24页 |
| 3.3.2 关联分析结果 | 第24-28页 |
| 3.4 低密度芯片的基因组预测 | 第28-34页 |
| 3.4.1 不同类型低密度芯片筛选 | 第28-31页 |
| 3.4.2 基因组育种值准确性评价 | 第31-34页 |
| 第四章 讨论 | 第34-37页 |
| 4.1 全基因组关联分析 | 第34-35页 |
| 4.2 低密度芯片的基因组选择 | 第35-37页 |
| 第五章 全文结论 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-44页 |
| 附录 | 第44-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 作者简历 | 第54页 |
