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DNA糖基化酶OGG1促进NF-κB结合其DNA靶序列的机制研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
英文缩写词第10-11页
引言第11-28页
    一、活性氧(ROS)以及鸟嘌呤的氧化损伤产物的形成第11-13页
    二、DNA糖基化酶OGG1切除 8-oxoG损伤碱基的机制第13-17页
        1、DNA糖基化酶概述第13页
        2、DNA糖基化酶OGG1概述第13-14页
        3、OGG1识别8-oxoG的机制第14-17页
    三、翻译后修饰对OGG1活性的影响第17-19页
        1、磷酸化修饰第18页
        2、乙酰化修饰第18页
        3、亚硝基化修饰第18页
        4、氧化还原的调节第18-19页
    四、OGG1的非DNA损伤修复酶功能第19-21页
        1、OGG1·8-oxoG复合物能够活化小GTP结合蛋白活性第19-20页
        2、OGG1能够促进位点特异性转录因子的募集第20-21页
    五、DNA氧化性损伤对基因转录的影响第21-28页
        1、NF-κB概述第21-23页
        2、NF-κB-DNA复合物的结构第23-25页
        3、染色质状态下,NF-κB与保守序列的结合第25-26页
        4、DNA氧化性损伤对NF-κB转录调控的影响第26-28页
本文的研究目的和意义第28-29页
材料与方法第29-47页
    一、实验材料第29-32页
        (一) 细胞质粒及引物序列第29-30页
        (二) 主要试剂和试剂盒第30-31页
        (三) 主要溶液组成第31-32页
    二、实验方法第32-47页
        (一) 细胞培养第32页
        (二) TRIzol法提取总RNA和反转录第32-34页
        (三) SYBR Green法实时定量PCR第34-35页
        (四) DNA片段的回收第35页
        (五) DNA酶切第35-36页
        (六) DNA连接与转化第36-37页
        (七) 琼脂糖凝胶电泳第37页
        (八) 定点突变第37-38页
        (九) 碱裂解法提取质粒第38页
        (十) 脂质体转染第38-39页
        (十一) 双荧光素酶报告基因检测第39页
        (十二) 蛋白质免疫印迹(Western Blot)第39-41页
        (十三) 细胞核蛋白的提取第41-42页
        (十四) 寡核苷酸退火第42页
        (十五) 凝胶迁移(Electrophoretic mobility shift assay,EMSA)第42-44页
        (十六) 细胞内基因组DNA的提取第44页
        (十七) DNA点杂交(Dot-blot)第44-45页
        (十八) 染色质免疫共沉淀第45页
        (十九) Streptavidin Pull-down分析第45页
        (二十) OGG1碱基切除活性的检测第45-46页
        (二十一) 蛋白质半胱氨酸氧化水平的检测第46页
        (二十二) 数据分析第46-47页
实验结果与分析第47-75页
    一、染色质状态下NF-κB向启动子区的募集是依赖于OGG1的第47-50页
    二、受NF-κB调控的启动子活性依赖于OGG1的表达第50-54页
    三、NF-κB与保守序列的大量结合依赖于OGG1与损伤底物的识别第54-68页
    四、NF-κB与保守序列的迅速结合依赖于OGG1与损伤底物的识别第68-69页
    五、氧化应激时短暂累积8-oxoG并抑制OGG1碱基切除活性第69-72页
    六、OGG1在NF-κB起始的基因表达中具有重要作用第72-75页
讨论第75-79页
主要结论第79-80页
主要创新点第80-81页
参考文献第81-93页
致谢第93-94页
攻读博士学位期间发表的文章第94页

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