摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 综述 | 第9-20页 |
1 类鼻疽研究进展 | 第9-16页 |
1.1 类鼻疽的分布及传播途径 | 第9-10页 |
1.2 类鼻疽的临床表现 | 第10-11页 |
1.3 B.pseudomallei的种属 | 第11-12页 |
1.4 K96243基因组结构的研究 | 第12-14页 |
1.5 类鼻疽的分子病理学 | 第14-15页 |
1.6 B.pseudomallei的毒力因子 | 第15-16页 |
2 转录组研究进展 | 第16-18页 |
2.1 转录组测序概述 | 第16页 |
2.2 转录组测序的原理 | 第16-17页 |
2.3 转录组测序技术在原核和真核生物的应用 | 第17-18页 |
3 研究目的及意义 | 第18-20页 |
第二章 B.pseudomallei感染RAW264.7细胞模型的建立 | 第20-32页 |
1 实验材料 | 第20-23页 |
1.1 菌种及细胞 | 第20页 |
1.2 主要试剂 | 第20-21页 |
1.3 实验仪器 | 第21页 |
1.4 细胞培养相关试剂的配制 | 第21-23页 |
2 实验方法 | 第23-26页 |
2.1 细胞复苏 | 第23页 |
2.2 细胞传代 | 第23页 |
2.3 细胞冻存 | 第23页 |
2.4 细胞计数及铺板 | 第23-24页 |
2.5 B.pseudomallei冻存菌株的鉴定 | 第24-25页 |
2.6 B.pseudomallei感染RAW264.7细胞模型的建立 | 第25-26页 |
2.7 B.pseudomallei感染RAW264.7细胞试验(MOI=10) | 第26页 |
3 结果与分析 | 第26-30页 |
3.1 B.pseudomallei菌株的鉴定结果 | 第26-27页 |
3.2 B.pseudomallei生长曲线的测定 | 第27-28页 |
3.3 B.pseudomallei对RAW264.7细胞的侵袭率分析 | 第28-29页 |
3.4 不同感染复数诱导RAW264.7形成的融合反应 | 第29-30页 |
3.5 B.pseudomallei诱导RAW264.7形成多核巨细胞的定量分析 | 第30页 |
4 讨论 | 第30-31页 |
5 小结 | 第31-32页 |
第三章 B.pseudomallei感染RAW264.7细胞的转录组测序 | 第32-56页 |
1 实验材料 | 第32-33页 |
1.1 主要试剂 | 第32-33页 |
1.2 仪器设备 | 第33页 |
1.3 常用试剂配制 | 第33页 |
2 实验方法 | 第33-37页 |
2.1 总RNA的提取 | 第33-34页 |
2.2 mRNA的建库和测序 | 第34页 |
2.3 原始数据的处理 | 第34页 |
2.4 基因水平差异表达研究 | 第34-35页 |
2.5 差异基因功能分析 | 第35-36页 |
2.6 qRT-PCR对差异基因的验证 | 第36-37页 |
2.7 数据库信息 | 第37页 |
3 结果与分析 | 第37-53页 |
3.1 总RNA质检结果 | 第37-38页 |
3.2 mRNA建库和数据生成的主要特征 | 第38-39页 |
3.3 表达量丰度分布 | 第39-40页 |
3.4 不同采样时间点的差异基因分析(两组分析) | 第40-43页 |
3.5 差异表达基因的趋势分析(多组分析) | 第43-47页 |
3.6 差异表达水平分析 | 第47-48页 |
3.7 qRT-PCR验证 | 第48-51页 |
3.8 17个免疫相关基因的GO聚类分析 | 第51-53页 |
4 讨论 | 第53-55页 |
5 小结 | 第55-56页 |
全文结论 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-65页 |
英文缩写表 | 第65-66页 |
附录 | 第66-73页 |
研究成果 | 第73-74页 |
项目资助 | 第74-75页 |
致谢 | 第75页 |