| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-19页 |
| 第一部分 文献综述 | 第19-32页 |
| 第一章 沙门氏菌特异性检测基因的研究进展 | 第19-25页 |
| 1. 沙门氏菌属特异性检测靶基因 | 第19-22页 |
| 2. 沙门氏菌种特异性检测靶基因 | 第22页 |
| 3. 血清型特异性检测靶基因 | 第22-25页 |
| 第二章 沙门氏菌毒力调控子的研究进展 | 第25-32页 |
| 1. 沙门氏菌毒力岛的研究进展 | 第25-26页 |
| 2. 沙门氏菌的主要毒力调控子 | 第26-32页 |
| ·SPI1与SPI2的关键调控子 | 第26-27页 |
| ·与鞭毛基因表达或装配相关的毒力调控子 | 第27-28页 |
| ·始祖毒力调控子 | 第28-31页 |
| ·毒性质粒相关毒力基团及其调控子 | 第31-32页 |
| 第二部分 实验研究 | 第32-142页 |
| 第三章 沙门氏菌属特异性环介导等温核酸扩增快速诊断方法的建立及其临床应用 | 第32-53页 |
| 1. 材料 | 第33-34页 |
| ·菌株来源 | 第33页 |
| ·检测样本来源 | 第33页 |
| ·主要仪器 | 第33-34页 |
| ·分子操作相关的试剂 | 第34页 |
| ·主要试剂及其配制 | 第34页 |
| 2. 方法 | 第34-44页 |
| ·细菌培养 | 第34-35页 |
| ·细菌平板计数 | 第35页 |
| ·细菌基因组DNA的提取 | 第35页 |
| ·基于沙门氏菌属特异性基因fimY的fimY-LAMP法的构建 | 第35-42页 |
| ·PCR检测方法 | 第42-43页 |
| ·LAMP法对临床样本的检测 | 第43-44页 |
| 3. 结果 | 第44-51页 |
| ·LAMP最佳反应温度的确定 | 第44-45页 |
| ·LAMP最佳反应时间的确定 | 第45页 |
| ·LAMP检测法的最佳反应程序 | 第45页 |
| ·LAMP检测法的特异性 | 第45页 |
| ·LAMP检测法与PCR检测法在纯培养条件下的敏感性比较 | 第45-49页 |
| ·在有外源DNA干扰条件下LAMP的检测极限 | 第49-50页 |
| ·LAMP特应性扩增子的酶切鉴定 | 第50页 |
| ·LAMP法对临床样本的检测 | 第50-51页 |
| 4. 讨论 | 第51-52页 |
| ·检测法的选择 | 第51页 |
| ·fimY-LAMP检测法的建立与优化 | 第51-52页 |
| ·fimY-LAMP检测法的敏感性与特异性 | 第52页 |
| ·fimY-LAMP法直接检测样本中沙门氏菌的可行性 | 第52页 |
| 5. 小结 | 第52-53页 |
| 第四章 我国部分地区肉鸭沙门氏菌流行情况的调查 | 第53-61页 |
| 1. 材料 | 第53-54页 |
| ·待检样本来源 | 第53页 |
| ·部分培养基及试剂盒来源 | 第53-54页 |
| ·主要培养基及试剂配制 | 第54页 |
| ·主要仪器 | 第54页 |
| 2. 方法 | 第54-56页 |
| ·样本处理 | 第54-55页 |
| ·沙门氏菌的分离及鉴定 | 第55-56页 |
| 3. 结果 | 第56-58页 |
| ·疑似沙门氏菌感染死亡鸭子的肝脏及脾脏的LAMP直接鉴定结果 | 第56页 |
| ·疑似沙门氏菌菌落的PCR及LAMP检测 | 第56-57页 |
| ·疑似沙门氏菌临床分离株的种属及血清型鉴定 | 第57-58页 |
| 4. 讨论 | 第58-60页 |
| ·鸭沙门氏菌病在我国的流行情况 | 第58-59页 |
| ·感染鸭子的沙门氏菌血清型 | 第59-60页 |
| 5. 小结 | 第60-61页 |
| 第五章 鸭源鼠伤寒沙门氏菌单突变株的构建 | 第61-94页 |
| 1. 材料 | 第62-64页 |
| ·菌株 | 第62页 |
| ·主要试剂的配制 | 第62-63页 |
| ·主要培养基的配制 | 第63-64页 |
| ·主要仪器 | 第64页 |
| 2. 方法 | 第64-84页 |
| ·鸭源鼠伤寒沙门氏菌临床分离株的抗性鉴定 | 第64-65页 |
| ·重组质粒PKD46的抽提 | 第65页 |
| ·重组质粒PKD46转化鸭源鼠伤寒沙门氏菌亲本株TT-1 | 第65-66页 |
| ·TT-2菌株的纯化与保存 | 第66页 |
| ·打靶片段的制备 | 第66-76页 |
| ·一次重组 | 第76-79页 |
| ·二次重组 | 第79-84页 |
| 3. 结果 | 第84-92页 |
| ·插入突变株PCR鉴定结果 | 第84-88页 |
| ·完全缺失株PCR鉴定结果 | 第88-92页 |
| ·完全缺失株测序结果 | 第92页 |
| 4. 讨论 | 第92-93页 |
| ·同源重组方法的选择 | 第92-93页 |
| ·两步red重组的优势 | 第93页 |
| 5. 小结 | 第93-94页 |
| 第六章 鼠伤寒沙门氏菌单突变株的毒力及在其鸭体内主要靶器官的定殖能力评价 | 第94-113页 |
| 1. 材料 | 第95-96页 |
| ·菌株 | 第95页 |
| ·主要试剂及其配制 | 第95页 |
| ·主要培养基 | 第95-96页 |
| ·主要仪器 | 第96页 |
| 2. 方法 | 第96-101页 |
| ·冻存菌株的复苏及再次鉴定 | 第96-97页 |
| ·亲本株TT-1毒力的复壮 | 第97页 |
| ·OD600与细菌数量曲线的构建 | 第97-98页 |
| ·平板计数 | 第98页 |
| ·鸭源鼠伤寒沙门氏菌亲本株TT-1对一日龄雏鸭的半数致死量测定 | 第98-99页 |
| ·完全缺失株的毒力测定 | 第99-100页 |
| ·完全缺失株对鸭子体内主要靶器官的定殖与清除速率测定 | 第100-101页 |
| 3. 结果 | 第101-110页 |
| ·沙门氏菌OD600与细菌数量曲线的构建 | 第101-102页 |
| ·1日龄雏鸭亲本株TT-1 LD50的测定结果 | 第102-103页 |
| ·完全缺失株的毒力测定结果 | 第103-104页 |
| ·突变株对鸭子体内主要靶器官的定殖与清除速率测定 | 第104-106页 |
| ·突变株定殖数量差异性分析 | 第106-110页 |
| 4. 讨论 | 第110-112页 |
| ·亲本株TT-1及其缺失株的毒力评价 | 第110页 |
| ·完全缺失株对鸭肝脏和脾脏的定殖情况 | 第110-112页 |
| 5. 小结 | 第112-113页 |
| 第七章 鸭源鼠伤寒沙门氏菌基因缺失减毒株作为沙门氏菌活疫苗的免疫及保护力评价 | 第113-142页 |
| 1.材料 | 第114-115页 |
| ·菌株 | 第114页 |
| ·实验动物 | 第114页 |
| ·主要试剂及其配制 | 第114-115页 |
| ·主要仪器 | 第115页 |
| 2. 方法 | 第115-121页 |
| ·免疫及样本采集 | 第115-116页 |
| ·鸭抗鸭源鼠伤寒沙门氏菌阳性血清的制备 | 第116页 |
| ·阳性血清抗体滴度的检验 | 第116-117页 |
| ·沙门氏菌外膜蛋白(OMPs)的提取及鉴定 | 第117页 |
| ·体液免疫评价 | 第117-120页 |
| ·细胞免疫评价 | 第120-121页 |
| ·缺失株的保护力评价 | 第121页 |
| 3. 结果 | 第121-138页 |
| ·阳性血清凝集效价 | 第121-122页 |
| ·沙门氏菌外膜蛋白提取结果 | 第122页 |
| ·ELISA最佳反应条件的优化结果 | 第122-128页 |
| ·ELISA临界值的确定 | 第128-129页 |
| ·ELISA法特异性测试结果 | 第129页 |
| ·细胞因子ELISA试剂盒标准曲线拟合及方程式求解 | 第129-131页 |
| ·体液免疫反应的结果 | 第131-135页 |
| ·细胞免疫反应的结果 | 第135-138页 |
| ·突变株保护力测定结果 | 第138页 |
| 4. 讨论 | 第138-140页 |
| ·缺失株的诱导的免疫保护力 | 第139页 |
| ·缺失株诱导的体液免疫反应 | 第139-140页 |
| 5. 小结 | 第140-142页 |
| 参考文献 | 第142-159页 |
| 附录 | 第159-207页 |
| 致谢 | 第207-208页 |
| 作者介绍 | 第208页 |
