凉山猪不同生长发育时期肌肉转录组表达谱及表达特征研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 高频词对照表 | 第9-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-37页 |
| 1 凉山猪的生长发育 | 第12-19页 |
| ·凉山猪的形成历史 | 第12-14页 |
| ·猪的生长发育曲线 | 第14-18页 |
| ·生长发育主效基因的概述 | 第18-19页 |
| 2 猪的胴体和肉质性状 | 第19-27页 |
| ·胴体性状的发育 | 第20-21页 |
| ·肉质性状的发育 | 第21-25页 |
| ·影响猪胴体和肉质性状的因素 | 第25-27页 |
| 3 转录组测序 | 第27-34页 |
| ·转录组测序(RNA-seq) | 第27-28页 |
| ·RNA测序技术平台 | 第28-31页 |
| ·RNA-seq原理 | 第31页 |
| ·RNA-seq建库测序流程 | 第31-32页 |
| ·RNA-seq生物信息学分析流程 | 第32-33页 |
| ·RNA-seq技术优势 | 第33-34页 |
| 4 RNA-sEQ技术在猪生长发育中的研究进展 | 第34-37页 |
| ·RNA-seq技术在猪肌肉生长发育研究中的应用 | 第35页 |
| ·RNA-seq技术在猪脂肪生长发育研究中的应用 | 第35-36页 |
| ·RNA-seq技术在猪其他一些组织研究中的应用 | 第36-37页 |
| 第二章 本研究选题背景与目的意义 | 第37-40页 |
| 1 选题背景 | 第37-38页 |
| 2 主要研究内容 | 第38页 |
| 3 研究的目的意义 | 第38-40页 |
| 第三章 材料与方法 | 第40-63页 |
| 1 实验动物 | 第40页 |
| 2 实验仪器与主要试剂 | 第40-42页 |
| 3 试验方法 | 第42-63页 |
| 第四章 结果与分析 | 第63-108页 |
| 1 不同发育阶段表型性状分析结果 | 第63-74页 |
| 2 不同部位肌肉组织转录组文库构建 | 第74-76页 |
| 3 不同发育阶段肌肉组织转录组特征分析 | 第76-86页 |
| ·RNA-seq测序质量评估 | 第76-80页 |
| ·测序数据概述 | 第80-81页 |
| ·Clean reads的基因组比对 | 第81-86页 |
| ·实验重复性分析 | 第86页 |
| 4 不同发育阶段肌肉组织转录组差异分析 | 第86-107页 |
| 5 测序结果的可靠性验证 | 第107-108页 |
| 第五章 讨论 | 第108-118页 |
| 1 凉山猪的保种重要性 | 第108页 |
| 2 生长曲线拟合方法的选择 | 第108-110页 |
| 3 转录组特征分析 | 第110-111页 |
| 4 导致生长拐点与非拐点时期功能差异的基因 | 第111-116页 |
| 5 RNA-seq结果的可靠性 | 第116-118页 |
| 第六章 结论与创新点 | 第118-120页 |
| 1 结论 | 第118-119页 |
| 2 本研究创新点 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
| 博士在读期间发表的论文 | 第130页 |
