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基于基因组重测序的玉米温热带自交系转座子特征分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 文献综述第11-26页
   ·转座子扩增对基因组大小和结构的影响第13-14页
     ·转座子影响基因组大小第13页
     ·转座子介导的染色体重排第13-14页
   ·转座子介导压力响应机制和生物体对环境改变的遗传适应性第14-15页
     ·转座子激活响应环境应答第14页
     ·转座子对环境适应性的影响第14-15页
   ·转座子的驯化第15-26页
     ·转座子驯化的揭示第16-17页
     ·驯化转座元件的结构多样性第17-20页
     ·完整转座酶基因和其他功能域相融合后产生的嵌合基因第20-21页
     ·转座子来源的功能基因的进化机制第21-24页
     ·转座子来源的功能基因在多样的生物学过程中的功能角色第24-26页
       ·基因调控功能第24页
       ·染色质相关因子第24页
       ·细胞凋亡相关功能第24页
       ·细胞周期的控制第24-25页
       ·介导转座的能力第25-26页
2 研究目的与意义第26-27页
3 材料与方法第27-30页
   ·研究材料与软件第27-28页
     ·植物材料和SNPs数据第27页
     ·主要软件及公共分析平台第27-28页
   ·研究方法第28-30页
     ·B73基因组转座子扫描和分析第28页
     ·新插入的非参考基因组非冗余转座子筛选第28页
     ·参考基因组重组率计算第28页
     ·材料间转座子数量统计和分类第28-29页
     ·转座子分布特征分析第29页
     ·新鉴定转座子聚类分析第29页
     ·受转座子影响基因的KEGG分析和WEGO聚类第29-30页
4 结果与分析第30-42页
   ·玉米自交系材料全基因组READS扫描和统计新鉴定转座子第30-31页
   ·新插入不同类型转座子在基因组的分布特征第31-35页
   ·聚类分析第35-37页
   ·温、热带材料间新鉴定转座子分布差异特征第37-38页
   ·新鉴定转座子对邻近基因影响和温、热带材料间基因差异分析第38-42页
5 讨论第42-47页
   ·转座子插入偏好性与基因组重组第42-43页
   ·不同地理分布材料中转座元件对环境适应性的影响第43-44页
   ·转座子对下游基因的调控作用第44-47页
6 参考文献第47-55页
7 附件第55-62页
8 致谢第62页

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