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基于线粒体COⅠ/COⅡ和重测序SNP黄翅大白蚁地理种群遗传分化研究

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
第1章 文献综述第8-16页
   ·研究背景第8-13页
     ·黄翅大白蚁生物学、生态学研究第8-10页
     ·黄翅大白蚁分子生物学研究第10-12页
     ·黄翅大白蚁生物信息学分析第12-13页
   ·科学问题的提出第13-15页
     ·黄翅大白蚁的起源中心和扩散路线第13-14页
     ·黄翅大白蚁的培菌习性第14页
     ·黄翅大白蚁一王多后、多王多后现象第14-15页
   ·研究内容方法和技术路线第15页
     ·研究内容方法第15页
     ·技术路线第15页
   ·研究的目的意义第15-16页
第2章 基于线粒体COⅠ/COⅡ黄翅大白蚁地理种群遗传变异分析第16-26页
   ·材料与方法第16-19页
     ·材料第16-18页
     ·DNA的提取第18页
     ·标记基因COⅠ/COⅡ PCR扩增第18页
     ·制胶及PCR产物检测第18-19页
     ·DNA序列数据的处理及分子系统树构建第19页
   ·结果与分析第19-23页
     ·COⅠ/COⅡ基因PCR扩增结果第19-20页
     ·COⅠ/COⅡ基因序列分析第20页
     ·COⅠ/COⅡ基因遗传距离分析第20-22页
     ·COⅠ/COⅡ基因系统发育分析第22-23页
   ·讨论第23-26页
     ·外群的选择第23-24页
     ·黄翅大白蚁不同地理种群遗传变异分析第24-26页
第3章 基于SNP对黄翅大白蚁地理种群遗传变异分析第26-41页
   ·材料和方法第27-32页
     ·材料第27-28页
     ·DNA的提取第28页
     ·GBS文库构建及测序第28-29页
     ·测序数据统计第29-30页
     ·测序数据质量评估第30-31页
     ·酶切数据统计第31-32页
     ·聚类SNP检测第32页
   ·群体遗传多样性结果与分析第32-39页
     ·群体主成分分析第32-36页
     ·群体结构分析第36-37页
     ·群体进化树分析第37-39页
   ·讨论第39-41页
     ·两广、海南为黄翅大白蚁起源中心第39页
     ·广西龙胜、武鸣为黄翅大白蚁分化为土垄大白蚁的过渡区域第39-41页
第4章 基于 16S、COⅠ、COⅡ黄翅大白蚁起源中心分子遗传分析第41-48页
   ·基于 16S序列构建的大白蚁属亲缘关系第41-42页
   ·基于COⅠ序列构建的大白蚁属亲缘关系第42-44页
   ·基于COⅡ序列构建的大白蚁属亲缘关系第44-46页
   ·基于COⅠ/COⅡ序列构建的黄翅大白蚁不同地理种群亲缘关系第46-47页
   ·讨论第47-48页
     ·外群的选择第47页
     ·黄翅大白蚁起源中心分析第47-48页
第5章 全文总结与讨论第48-51页
   ·主要结果第48-49页
   ·讨论第49-51页
     ·非洲是大白蚁属起源中心第49页
     ·台湾和海南黄翅大白蚁分布的比较第49-50页
     ·本论文后续研究计划第50-51页
参考文献第51-58页
致谢第58页

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