表观遗传修饰间相互作用关系的研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-18页 |
| ·课题研究背景与意义 | 第12-14页 |
| ·研究背景 | 第12-13页 |
| ·研究意义 | 第13-14页 |
| ·相关工作 | 第14-15页 |
| ·基因及基因注释数据 | 第14页 |
| ·基因比对工具 BLAT | 第14-15页 |
| ·传统的模式匹配算法 | 第15页 |
| ·研究内容 | 第15-16页 |
| ·论文结构 | 第16-18页 |
| 第2章 提取 DNA 甲基化特征工具的设计与实现 | 第18-23页 |
| ·背景介绍 | 第18页 |
| ·设计和实现 | 第18-20页 |
| ·特征类型 | 第18-19页 |
| ·计算原理 | 第19-20页 |
| ·使用方法 | 第20-22页 |
| ·输入目标序列 | 第21页 |
| ·输入计算特征 | 第21-22页 |
| ·浏览和保存结果 | 第22页 |
| ·清空结果和复位程序 | 第22页 |
| ·退出程序和软件获取 | 第22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第3章 计算 DNA 序列模式特征的匹配算法 | 第23-31页 |
| ·背景介绍 | 第23页 |
| ·问题的描述和相关算法 | 第23-26页 |
| ·问题的描述 | 第23-24页 |
| ·相关的算法 | 第24页 |
| ·单个序列顺序遍历算法 | 第24-26页 |
| ·Map-based 算法 | 第26-28页 |
| ·结果与分析 | 第28-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第4章 DNA 甲基化的重要特征 | 第31-43页 |
| ·背景介绍 | 第31-32页 |
| ·材料与方法 | 第32-34页 |
| ·DNA 甲基化数据和预处理 | 第32-33页 |
| ·特征和量化 | 第33页 |
| ·特征选择和分类方法 | 第33页 |
| ·实验流程和评价指标 | 第33-34页 |
| ·结果 | 第34-40页 |
| ·单个特征类别间的比较 | 第34-35页 |
| ·特征类别组合的比较 | 第35页 |
| ·特征选择的结果 | 第35-38页 |
| ·特征的紧凑子集 | 第38-40页 |
| ·讨论 | 第40-41页 |
| ·本章小结 | 第41-43页 |
| 第5章 表观遗传修饰间相互作用关系 | 第43-51页 |
| ·背景介绍 | 第43-44页 |
| ·材料与方法 | 第44-48页 |
| ·数据集 | 第44页 |
| ·数据离散化 | 第44-45页 |
| ·偏相关系数和皮尔逊相关系数 | 第45-46页 |
| ·构建表观遗传相互作用网络 | 第46-48页 |
| ·结果与分析 | 第48-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 第6章 总结 | 第51-54页 |
| ·工作总结 | 第51-52页 |
| ·课题展望 | 第52-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-61页 |
| 附录 | 第61-62页 |
| 详细摘要 | 第62-63页 |
