生物序列数据K-mer频次统计与可视化研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-19页 |
| ·研究背景及意义 | 第11-12页 |
| ·研究现状 | 第12-15页 |
| ·生物序列数据k-mer频次统计算法 | 第13-14页 |
| ·生物序列数据k-mer频次可视化及应用 | 第14-15页 |
| ·本文研究内容 | 第15-16页 |
| ·生物序列数据k-mer频次统计算法 | 第15页 |
| ·生物序列数据k-mer频次可视化及应用 | 第15-16页 |
| ·论文组织 | 第16-19页 |
| 第2章 相关技术与知识 | 第19-31页 |
| ·生物序列数据介绍 | 第19-21页 |
| ·DNA | 第19页 |
| ·RNA | 第19-20页 |
| ·蛋白质 | 第20-21页 |
| ·生物序列数据k-mer定义及应用 | 第21-22页 |
| ·生物序列数据可视化技术 | 第22-26页 |
| ·DNA序列可视化 | 第23-24页 |
| ·RNA序列可视化 | 第24-25页 |
| ·蛋白质序列可视化 | 第25-26页 |
| ·生物序列处理相关云计算技术 | 第26-29页 |
| ·本章小结 | 第29-31页 |
| 第3章 生物序列数据k-mer频次统计算法研究 | 第31-47页 |
| ·全序列的k-mer频次统计算法研究 | 第31-39页 |
| ·问题定义 | 第31页 |
| ·已有工作介绍 | 第31-33页 |
| ·基于MapReduce的PDSK算法描述及分析 | 第33-38页 |
| ·实验结果及结论 | 第38-39页 |
| ·序列间的k-mer频次统计算法研究 | 第39-45页 |
| ·问题定义 | 第39-40页 |
| ·已有工作介绍 | 第40页 |
| ·基于逆向遍历的BTKC算法描述及分析 | 第40-42页 |
| ·实验结果及结论 | 第42-45页 |
| ·本章小结 | 第45-47页 |
| 第4章 生物序列数据k-mer频次可视化 | 第47-59页 |
| ·已有的工作 | 第47-50页 |
| ·k-mer频次构造序列条形码 | 第47-49页 |
| ·其它可视化相关工作 | 第49-50页 |
| ·生物序列数据k-mer频次可视化软件设计 | 第50-55页 |
| ·需求分析 | 第50-51页 |
| ·总体结构设计 | 第51-52页 |
| ·界面设计 | 第52-54页 |
| ·功能实现 | 第54-55页 |
| ·k-mer频次可视化软件的应用 | 第55-57页 |
| ·模式串的查找与展示 | 第55-56页 |
| ·扩展的序列Logo图生成 | 第56-57页 |
| ·本章小结 | 第57-59页 |
| 第5章 总结 | 第59-63页 |
| ·本文工作 | 第59-60页 |
| ·本文贡献与创新之处 | 第60-61页 |
| ·进一步工作 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-66页 |
| 附录1 插图索引 | 第66-67页 |
| 附录2 表格索引 | 第67-69页 |
| 致谢 | 第69-71页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第71-72页 |
| 攻读学位期间参加的科研项目 | 第72页 |
