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功能化碳纳米管吸附溶菌酶的分子动力学研究

学位论文数据集第1-4页
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 绪论第11-27页
   ·溶菌酶简介第11-15页
     ·溶菌酶的分类第11-12页
     ·溶菌酶的应用第12-13页
     ·溶菌酶的固定化第13页
     ·溶菌酶的分离纯化技术第13-14页
     ·功能化纳米材料在蛋白质固定化中的应用第14-15页
   ·碳纳米管简介第15-20页
     ·碳纳米管的基本构型和分类第15-17页
     ·碳纳米管的特性和应用第17-18页
     ·碳纳米管的功能化第18-20页
   ·分子动力学模拟第20-25页
     ·分子动力学方法第21-22页
     ·GROMACS第22-23页
     ·分子动力学模拟力场第23-25页
   ·分子动力学模拟在溶菌酶吸附机理研究中的应用第25-26页
   ·本课题的研究背景及主要内容第26-27页
第二章 鸡蛋清溶菌酶的预处理及碳纳米管功能化的模拟第27-37页
   ·前言第27-29页
   ·鸡蛋清溶菌酶的预处理第29-30页
   ·SCS功能化碳纳米管的模拟第30-33页
     ·计算方法第30-31页
     ·参数设置第31-32页
     ·结果与讨论第32-33页
   ·选取吸附初始构象第33-36页
   ·本章小结第36-37页
第三章 功能化碳纳米管吸附溶菌酶的分子动力学模拟第37-51页
   ·计算方法和参数设置第37-38页
   ·结果与讨论第38-50页
     ·各组分RMSD分析第38-39页
     ·溶菌酶回转半径g(r)第39-40页
     ·溶菌酶残基均方根偏差(RMSF)第40-42页
     ·溶菌酶二级结构第42-46页
     ·溶菌酶吸附取向变化第46-48页
     ·溶菌酶和SCS相互作用能第48-50页
   ·本章小结第50-51页
第四章 溶菌酶的PMF模拟和能量分析第51-67页
   ·计算方法第51-52页
     ·平均力势PMF(Potential of mean force)第51页
     ·能量计算第51-52页
   ·结果与讨论第52-65页
     ·热力学分析第52-59页
     ·构象分析第59-63页
     ·体系中水的分布第63-65页
   ·本章小结第65-67页
第五章 结论第67-69页
   ·结论第67页
   ·创新第67-69页
参考文献第69-73页
致谢第73-75页
研究成果及发表的学术论文第75-77页
作者和导师介绍第77-79页
附件第79-80页

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