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耐药整合子细菌在水环境中的散播调查及其多样性分析

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-13页
缩略符号说明第13-14页
第一章 前言第14-31页
   ·细菌耐药的现状第15-16页
   ·细菌常见的耐药机制第16-18页
     ·细菌改变细胞膜通透性第16页
     ·细菌生物被膜的形成第16-17页
     ·细菌主动药物外排机制第17页
     ·细菌产生灭活酶或钝化酶第17-18页
     ·细菌药物作用靶位改变第18页
   ·细菌耐药的危害及防控措施第18-19页
   ·整合子-基因盒系统第19-26页
     ·整合子定义及简介第20页
     ·整合子的典型结构第20-22页
     ·整合子的分类第22-23页
     ·基因盒的结构、种类及起源第23-25页
       ·基因盒的结构第23-24页
       ·基因盒的种类第24页
       ·基因盒的来源第24-25页
     ·整合子对基因盒捕获、剪切及表达第25-26页
   ·细菌对β-内酰胺类抗生素的耐药第26-29页
     ·β-内酰胺酶的种类其性质第26-28页
       ·超广谱β-内酰胺酶(ESBLS)第27页
       ·头孢菌素酶(AmpC酶)第27页
       ·金属β-内酰胺酶(MBL)第27-28页
       ·碳青霉烯酶(carbapenemases)第28页
     ·PBP及细菌对β-内酰胺类抗生素耐药机制第28-29页
       ·青霉素结合蛋白(PBPs)第29页
       ·β-内酰胺类抗生素耐药机制第29页
   ·立题依据及意义第29-31页
第二章 耐药菌株的筛选及其药敏实验第31-41页
   ·引言第31页
   ·材料和方法第31-37页
     ·实验材料第31-34页
       ·样品采集第31-32页
       ·培养基(Medium)第32-33页
       ·筛选耐药细菌所用抗生素的配制及保存方法第33页
       ·实验主要试剂及对照菌种第33-34页
       ·主要仪器第34页
     ·实验方法第34-37页
       ·取样及耐药细菌的筛选第34-35页
       ·K-B纸片琼脂扩散法检测细菌药物敏感试验第35-37页
   ·结果与讨论第37-39页
     ·七批样品水样耐药菌株的筛选第37-38页
     ·各批次样品水样耐药菌株的筛选第38-39页
   ·本章小结第39-41页
第三章 247株耐药菌株1、2、3型整合子的检测及分析第41-52页
   ·引言第41页
   ·材料与方法第41-46页
     ·实验材料第41-43页
       ·实验样品第41-42页
       ·实验溶液第42页
       ·实验试剂及仪器第42-43页
       ·实验方法第43-46页
       ·CTAB法提取细菌基因组DNA第43-44页
       ·PCR扩增检测1型,2型及3型整合酶第44-45页
       ·琼脂糖凝胶电泳第45-46页
       ·含1型整合子细菌与不含1型整合子细菌抗性谱结果的统计学分析第46页
   ·实验结果与讨论第46-50页
     ·CTAB法提取基因组DNA及其质量检测第46-48页
     ·PCR检测耐药细菌中所携带的整合子类型第48-49页
     ·含1型整合子细菌与不含1型整合子抗性谱结果的统计学分析第49-50页
   ·本章小结第50-52页
第四章 建立基因盒阵列EcoRⅡ酶切图谱库第52-65页
   ·引言第52页
   ·材料与方法第52-59页
     ·实验材料第52-53页
       ·实验菌株及质粒第52页
       ·实验试剂第52-53页
     ·实验方法第53-59页
       ·PCR扩增1型整合子可变区所含基因盒阵列第53-54页
       ·PCR检测位于基因盒阵列之外的耐药基因第54-55页
       ·DNA片段的切胶回收、纯化及连接第55页
       ·氯化钙改良法制备高效感受态细胞第55-56页
       ·用于电转化感受态细胞的制备第56页
       ·常规热激转化实验第56-57页
       ·电转化实验第57页
       ·碱法小提质粒第57-58页
       ·重组质粒的筛选、鉴定及测序第58-59页
   ·结果与讨论第59-63页
     ·1 型整合子可变区所含基因盒阵列的检测第59-61页
     ·建立基因盒阵列EcoRⅡ酶切图谱库第61-63页
       ·寻找合适的限制性内切酶消化基因盒阵列第61页
       ·利用EcoRⅡ酶切图谱库检测细菌整合子中基因盒阵列的方法简介第61-63页
       ·EcoRⅡ酶切建库分析基因盒阵列的意义及应用第63页
   ·本章小结第63-65页
第五章 1型整合子细菌中基因盒阵列多样性检测及分析第65-71页
   ·引言第65页
   ·材料与方法第65-66页
     ·实验材料第65页
       ·实验菌株及质粒第65页
       ·实验试剂第65页
     ·实验方法第65-66页
   ·结果与讨论第66-69页
     ·1型整合子可变区所含基因盒阵列的检测第66-68页
     ·同一菌株含有多种基因盒阵列第68页
     ·新型基因盒阵列的筛选第68-69页
   ·本章小结第69-71页
第六章 2型整合子细菌中基因盒阵列多样性检测及分析第71-83页
   ·引言第71页
   ·材料与方法第71-74页
     ·实验材料第71页
       ·实验菌株第71页
       ·实验试剂第71页
     ·实验方法第71-74页
       ·2型整合子可变区基因盒的检测及其测序第71-72页
       ·2型整合子可变区基因盒分析及其它整合子外耐药基因的检测第72页
       ·接合转移实验进行2型整合子定位第72-74页
   ·结果与讨论第74-77页
     ·2型整合子菌株中所含的基因盒阵列第74页
     ·三种位于Tn7转座子家族中新型2型基因盒阵列的分析第74-76页
     ·1型整合子及位于整合子外耐药基因的检测第76页
     ·运用EcoRⅡ建立2型基因盒阵列酶切图谱库第76-77页
     ·接合转移实验定位2型整合子第77页
     ·32株2型整合酶阳性的菌株抗性谱实验第77页
   ·本章小结第77-83页
第七章 含有新型基因盒阵列1型整合子细菌的研究第83-90页
   ·引言第83页
   ·材料与方法第83-84页
     ·实验材料第83页
       ·实验菌株第83页
       ·实验试剂第83页
     ·实验方法第83-84页
       ·七株含新型基因盒阵列菌株菌种的鉴定第83页
       ·七株含新型基因盒阵列菌株的接合转移实验及质粒转化实验第83-84页
       ·接合子的药敏实验第84页
       ·整合子外耐药基因的检测与分析第84页
   ·结果与讨论第84-89页
     ·七株含新型基因盒阵列菌株菌种的鉴定第84-85页
     ·七株新型基因盒阵列的分析第85-86页
     ·新型基因盒lin的比对分析第86页
     ·七株含新型基因盒阵列菌株整合子外耐药基因的检测第86-87页
     ·七株含新型基因盒阵列菌株的接合转移及转化实验第87-89页
   ·本章小结第89-90页
第八章 全文总结第90-92页
参考文献第92-98页
致谢第98-99页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第99-100页
附件第100-120页
学位论文评阅及答辩情况表第120页

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