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CHIP负调控Smad1/5蛋白的分子机理

摘要第1-5页
Abstract第5-15页
第1章 引言第15-40页
   ·TGF- 超家族信号通路概述第15-18页
     ·信号传导方式第15-16页
     ·TGF- 超家族通路配体第16页
     ·TGF- 超家族通路受体第16-18页
   ·Smad 家族蛋白第18-24页
     ·Smad 家族蛋白的发现和结构域划分第18-20页
     ·Smad 家族蛋白的结构第20-24页
   ·TGF- 超家族信号通路在 Smad 蛋白层次上的调控第24-33页
     ·I-Smad 负调控 TGF- 超家族信号通路第25-26页
     ·泛素-蛋白酶体通路负调控 TGF- 超家族信号通路第26-30页
       ·泛素化系统简介第26-28页
       ·HECT 家族泛素 E3 连接酶泛素化降解 Smad 蛋白第28-29页
       ·其它泛素 E3 连接酶泛素化降解 Smad 蛋白第29-30页
     ·蛋白磷酸酶调控 TGF- 超家族信号通路第30-32页
     ·R-Smad/Co-Smad 复合物的解离第32-33页
     ·蛋白-蛋白相互作用调控 TGF- 超家族信号通路第33页
   ·CHIP 蛋白第33-38页
     ·CHIP 蛋白简介第33-36页
     ·CHIP 蛋白的结构第36页
     ·CHIP 蛋白的功能第36-37页
     ·CHIP 负调控 TGF- 信号通路第37-38页
   ·本研究的意义与技术路线第38-40页
第2章 SMAD 和 CHIP 蛋白的制备第40-62页
   ·引言第40页
   ·材料与方法第40-49页
     ·cDNA第40页
     ·载体第40页
     ·菌种第40-41页
     ·试剂第41页
     ·蛋白纯化柱和柱材第41-42页
     ·仪器第42页
     ·大肠杆菌表达质粒的构建与筛选第42-46页
       ·DNA 引物的设计第42页
       ·PCR第42-43页
       ·DNA 片段的回收第43页
       ·DNA 限制性内切酶酶切第43-44页
       ·目的 DNA 片段与表达载体连接第44页
       ·JM109 (DE3) 超级感受态细胞的制备第44-45页
       ·连接产物转化 JM109 (DE3) 超级感受态细胞第45页
       ·阳性克隆的筛选第45页
       ·突变体的构建第45-46页
     ·蛋白的表达与纯化方法第46-49页
       ·BL21(DE3)感受态细胞的制备第46-47页
       ·目的蛋白的表达第47页
       ·重组表达蛋白的提取第47页
       ·利用镍亲和层析柱纯化蛋白第47-48页
       ·利用 GST 亲和层析柱纯化蛋白第48页
       ·亲和柱上酶切去除亲和标签第48页
       ·利用离子交换层析柱纯化蛋白第48页
       ·浓缩蛋白第48-49页
       ·利用分子筛层析柱纯化蛋白第49页
   ·结果与讨论第49-61页
     ·Smad 家族蛋白的表达与纯化第49-58页
       ·Smad 家族全长蛋白的表达与纯化第49-51页
       ·Smad1/2/3/4/5-MH1 的表达与纯化第51-52页
       ·Smad1/5-MH2 的表达与纯化第52-53页
       ·Smad2-MH2 的表达与纯化第53-55页
       ·Smad1/2/4/5-L-MH2 的表达与纯化第55-56页
       ·Smad3-L-MH2 的表达与纯化第56页
       ·Smad6/7/8 的表达与纯化第56-58页
     ·CHIP 蛋白的表达与纯化第58-61页
   ·小结第61-62页
第3章 CHIP 结合 SMAD1 碳末端尾巴第62-76页
   ·引言第62页
   ·材料与方法第62-67页
     ·cDNA 和表达质粒第62页
     ·蛋白浓度的测定第62页
     ·分子筛层析方法研究蛋白-蛋白相互作用第62-64页
     ·GST pulldown 方法研究蛋白-蛋白相互作用第64页
     ·真核表达质粒的构建与筛选第64页
     ·HEK293T 细胞的培养与传代第64-65页
     ·免疫共沉淀方法研究蛋白-蛋白相互作用第65页
     ·蛋白质印迹 (免疫印迹)第65-66页
     ·体外泛素化第66-67页
   ·结果与讨论第67-75页
     ·CHIP-TPR 负责结合 Smad1第67-69页
     ·Smad1-MH2 负责结合 CHIP第69-70页
     ·Smad1 碳末端缺失突变体不结合 CHIP第70-73页
     ·CHIP 倾向于结合激活状态 Smad1第73-74页
     ·CHIP 倾向于泛素化激活状态 Smad1第74-75页
   ·小结第75-76页
第4章 CHIP-SMAD1 复合物晶体结构的解析第76-91页
   ·引言第76页
   ·材料与方法第76-81页
     ·Smad1 多肽第76页
     ·结晶条件筛选试剂盒第76页
     ·试剂第76页
     ·仪器第76-77页
     ·结晶样品制备第77页
     ·晶体初步筛选第77-78页
     ·晶体优化第78-81页
     ·选择防冻液第81页
   ·结果与讨论第81-90页
     ·晶体的筛选与优化第81-84页
     ·数据收集第84页
     ·结构解析第84页
     ·结构分析第84-90页
   ·小结第90-91页
第5章 分子伴侣抑制 CHIP 泛素化 SMAD177第91-101页
   ·引言第91页
   ·材料与方法第91-93页
     ·质粒第91页
     ·分子伴侣多肽第91页
     ·仪器第91页
     ·等温滴定量热方法研究蛋白-蛋白相互作用第91-93页
   ·结果与讨论第93-100页
     ·Hsp70/Hsc70-C 多肽与 CHIP-TPR 复合物晶体结构第93-95页
     ·分子伴侣与 Smad1 竞争性结合 CHIP第95-99页
     ·分子伴侣抑制 CHIP 泛素化 Smad1第99-100页
   ·小结第100-101页
第6章 CHIP 特异性识别 SMAD1/587第101-107页
   ·引言第101页
   ·结果与讨论第101-106页
     ·CHIP 结合 Smad5,不结合 Smad2、Smad3 和 Smad4第101-103页
     ·疏水氨基酸残基提供识别特异性第103-105页
     ·CHIP 破坏具有生物学活力的 R-/Co-Smad 复合体第105-106页
   ·小结第106-107页
第7章 其它相关研究工作第107-118页
   ·CHIP 蛋白其它片段结构生物学研究第107-110页
   ·Smad 蛋白相关蛋白磷酸酶研究第110-116页
     ·Smad 蛋白磷酸酶之 SCP第110-113页
     ·Smad 蛋白磷酸酶之 PPM1A第113-114页
     ·Smad 蛋白磷酸酶之 PDP第114-116页
   ·小结第116-118页
第8章 总结与展望第118-122页
   ·总结第118-120页
   ·展望第120-122页
参考文献第122-131页
致谢第131-133页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第133页

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