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甘蓝型油菜隐性核不育基因Bnms1的精细定位和克隆

摘要第1-9页
Abstract第9-12页
缩略语表第12-13页
1 文献综述第13-37页
   ·油菜雄性不育与杂种优势利用第13-16页
     ·细胞质雄性不育第14-15页
     ·细胞核雄性不育第15-16页
   ·油菜细胞核雄性不育的研究第16-22页
     ·油菜细胞核雄性不育的细胞学研究第16-17页
     ·油菜细胞核雄性不育的遗传第17-19页
       ·显性细胞核雄性不育第17-18页
       ·隐性细胞核雄性不育第18-19页
     ·油菜细胞核雄性不育基因的定位第19-20页
     ·油菜细胞核雄性不育的分子机理第20-22页
   ·油菜的遗传图谱及重要基因的定位第22-26页
     ·甘蓝型油菜的遗传图谱第22-23页
     ·甘蓝型油菜重要基因的定位第23-26页
       ·品质性状相关基因的定位第23-24页
       ·抗病性状相关基因的定位第24-25页
       ·开花期性状相关基因的定位第25页
       ·育性相关基因的定位第25-26页
   ·芸薹属作物与拟南芥比较基因组研究第26-30页
     ·共线性比较第26-28页
     ·芸薹属和拟南芥的起源与进化关系第28页
     ·芸薹属作物与拟南芥比较基因组研究的意义第28-30页
   ·拟南芥花粉发育的研究第30-35页
     ·拟南芥花粉发育时期的划分和主要形态变化第30-31页
     ·花药绒毡层的发育和功能第31-34页
     ·花粉外壁合成相关基因第34-35页
   ·本研究的目的和意义第35-37页
2 材料和方法第37-53页
   ·试验材料第37页
   ·花药半薄切片的制作第37-38页
   ·AFLP与BSA分析第38-40页
     ·DNA提取及样品池的构建第38页
     ·AFLP分析第38-40页
   ·SCAR标记转化第40-42页
     ·差异片段的回收与连接第40页
     ·差异片段的克隆与测序第40-41页
     ·PCR walking第41页
     ·SCAR引物设计、PCR扩增第41-42页
   ·基因的遗传定位第42-44页
     ·DH群体的分子标记分析第42-43页
       ·SSR标记分析第42页
       ·RFLP标记分析第42页
       ·RAPD标记分析第42-43页
       ·SRAP标记分析第43页
     ·连锁遗传分析第43-44页
   ·BAC文库的筛选及Shotgun测序第44-50页
     ·BAC文库第44-45页
     ·BAC文库的筛选和阳性克隆的PCR鉴定第45-47页
       ·菌落杂交第45-46页
       ·阳性克隆的PCR鉴定第46-47页
     ·Shotgun测序第47-49页
       ·Shotgun测序文库的构建第47-48页
       ·序列分析第48-49页
     ·新标记的开发第49页
     ·候选基因的表达分析第49页
     ·候选基因的比较测序第49-50页
       ·DNA比较测序第49页
       ·cDNA比较测序和RNA提取第49-50页
   ·农杆菌介导的遗传转化第50-53页
     ·植物表达载体的构建第50-51页
       ·pBnG15表达载体的构建第50页
       ·pAtG15RNAi干涉载体的构建第50-51页
     ·油菜的遗传转化第51-52页
     ·拟南芥的遗传转化第52-53页
3 结果与分析第53-84页
   ·不育性状的遗传分析第53-54页
   ·花药半薄切片观察第54-57页
   ·与Bnms1连锁的AFLP标记第57-59页
   ·SCAR标记转化第59-61页
     ·差异片段的克隆测序第59页
     ·AFLP侧翼序列的分离第59-60页
     ·SCAR标记体系的建立第60页
     ·标记位点序列的生物信息学分析第60-61页
   ·Bnms1基因的遗传定位第61-66页
     ·DH群体标记多态性筛选及标记群体分析第61-62页
     ·DH群体遗传连锁图谱构建第62-64页
     ·Bnms1基因的图谱定位第64-66页
   ·Bnms1基因的物理定位第66-77页
     ·Bnms1基因的BAC克隆定位第66-67页
     ·Shotgun测序和新标记的开发第67-71页
     ·候选基因的预测第71-72页
     ·候选基因的表达分析第72-73页
     ·候选基因的比较测序第73-77页
       ·DNA序列比较第73-75页
       ·cDNA序列比较第75-77页
   ·候选基因的遗传转化第77-83页
     ·甘蓝型油菜的遗传转化第77-79页
       ·转基因载体的构建第77-78页
       ·油菜转化单株的GUS检测第78-79页
     ·拟南芥遗传转化第79-83页
       ·RNAi载体的构建第79-81页
       ·拟南芥转基因植株筛选和育性观察第81-83页
   ·小结第83-84页
4 讨论第84-90页
   ·AFLP标记结合BSA分析是基因定位的有效方法第84-85页
   ·油菜基因组多倍性对图位克隆的影响第85-86页
   ·候选基因G15可能是S45A败育的关键基因第86-88页
   ·显性基因BnMs1的应用第88页
   ·进一步的工作第88-90页
5 参考文献第90-105页
致谢第105-106页
附录1:本研究所用的引物第106-107页
附录2:油菜转基因所用的培养基第107-108页
附录3:作者简介和在读期间发表论文第108页

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