| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 竹类植物分类与系统进化研究现状 | 第10-28页 |
| 1.前言 | 第10页 |
| 2. 竹类植物分类与进化研究历史与现状 | 第10-17页 |
| ·中国竹类植物研究的历史 | 第10-11页 |
| ·用于竹类植物分类的依据与分类系统 | 第11-13页 |
| ·中国竹类植物分类研究的现状与存在的问题 | 第13-15页 |
| ·竹类植物的分子进化研究 | 第15-17页 |
| 3. 序列分析与分子进化研究进展 | 第17-23页 |
| ·分子进化的产生与理论 | 第17页 |
| ·系统树构建方法 | 第17-18页 |
| ·中性分析的方法 | 第18-21页 |
| ·内含子分子进化分析研究进展 | 第21-23页 |
| 4. MADS-BOX相关综述 | 第23页 |
| ·MADS-box基因家族 | 第23页 |
| ·竹子MADS-box基因的克隆 | 第23页 |
| 5. TB1(TEOSINTE BRANCHED 1)基因研究现状 | 第23-24页 |
| 6. MOC1基因研究现状 | 第24-26页 |
| ·侧芽分生组织形成机理与相关基因的克隆 | 第24-25页 |
| ·MOC1基因在竹类植物中的克隆与意义 | 第25-26页 |
| 7. 论文的选题依据与研究的主要内容 | 第26-28页 |
| ·论文的选题 | 第26-27页 |
| ·论文的主要内容 | 第27-28页 |
| 第二章 材料与方法 | 第28-34页 |
| 1. 竹种的选取与DNA样品制备 | 第28-30页 |
| ·竹种取样 | 第28-30页 |
| ·竹子基因组DNA提取 | 第30页 |
| 2 序列扩增、克隆方法 | 第30-32页 |
| ·MADS1、MOC1和TB1的PCR引物设计与合成 | 第30页 |
| ·PCR扩增与回收 | 第30-31页 |
| ·TA克隆 | 第31页 |
| ·感受态细胞制备与大肠杆菌转化 | 第31-32页 |
| ·测序 | 第32页 |
| 3 序列分析方法 | 第32-34页 |
| ·测序列结果读出 | 第32页 |
| ·密码子使用偏性分析 | 第32页 |
| ·序列比对 | 第32页 |
| ·中性分析 | 第32-33页 |
| ·系统树构建 | 第33-34页 |
| 第三章 结果与分析 | 第34-83页 |
| 1. 竹类植物MADS1、MOC1和TB1基因的获取 | 第34-38页 |
| ·PCR扩增与连接转化 | 第34-35页 |
| ·竹类植物MADS1基因的初步分析 | 第35-36页 |
| ·竹类植物MOC1基因的初步分析 | 第36-37页 |
| ·竹类植物TB1基因的初步序列分析 | 第37-38页 |
| 2. 竹类植物MADS1、MOC1和TB1基因的序列特征分析 | 第38-58页 |
| ·G+C含量 | 第38-46页 |
| ·密码子偏性 | 第46-52页 |
| ·DNA序列变异性 | 第52-54页 |
| ·DNA多态性分析 | 第54-58页 |
| 3. 竹类植物MADS1、MOC1和TB1基因的中性检验 | 第58-68页 |
| ·Tajima's D检验和Fu and Li's D~*检验 | 第58-64页 |
| ·d_N/d_S(或Ka/Ks)检验 | 第64-67页 |
| ·HKA分析 | 第67-68页 |
| 4. 竹类植物MADS1、MOC1和TB1基因的系统进化分析 | 第68-79页 |
| ·竹类植物MADS1编码区与禾本科内近缘物种之间的关系 | 第68页 |
| ·对所有取样竹种的系统进化分析 | 第68-76页 |
| ·对青篱竹属复合群竹种间的亲缘关系的分析 | 第76-79页 |
| 5. 竹类植物MADS1基因的长度多态性与系统进化 | 第79-83页 |
| ·不同长度的内含子Ⅶ的indels分布 | 第79-80页 |
| ·不同长度的内含子Ⅶ之间的系统关系 | 第80-81页 |
| ·竹类植物MADS1内含子Ⅶ的可能的进化过程 | 第81-83页 |
| 第四章 讨论 | 第83-93页 |
| 1. 对竹类植物MADS1、MOC1和TB1是功能基因 | 第83页 |
| 2. G+C含量、密码子偏性与竹类植物分类 | 第83-84页 |
| 3. 对中性检验的讨论 | 第84页 |
| 4. 竹类植物的系统进化问题 | 第84-86页 |
| ·竹类植物是单系起源的 | 第84页 |
| ·竹类植物不同类群的进化可能是不平衡的 | 第84-85页 |
| ·丛生竹类不一定是最原始的类群 | 第85页 |
| ·青篱竹属复合群不是单系起源的 | 第85页 |
| ·刚竹属竹种可能不是单系起源的 | 第85-86页 |
| ·非编码序列长度多态性与竹类植物系统进化 | 第86页 |
| 5. 对竹类植物分类改进与修订的讨论 | 第86-90页 |
| ·分子进化信息在竹类植物进化与分类研究中的应用 | 第86-87页 |
| ·据竹类植物MADS1、MOC1和TB1的结果对现有属的看法 | 第87-90页 |
| 6. MADS1、MOC1和TB1与竹类植物系统进化与分类 | 第90页 |
| 7. 根据本研究的结果对竹类植物不同分类依据的评价 | 第90-93页 |
| ·以地下茎作为分类的依据是可靠的 | 第90-91页 |
| ·秆分枝类型作为分属依据有待进一步证实 | 第91页 |
| ·秆高和径粗可作为分类依据之一 | 第91页 |
| ·基因与性状之间的联系与竹类植物分类 | 第91页 |
| ·竹类植物系统进化和分类研究中应当引入数学分析方法 | 第91-93页 |
| 第五章 结论 | 第93-94页 |
| 附件 孝顺竹与早竹组织培养初步探索 | 第94-103页 |
| 1. 竹子织织培养研究进展 | 第94-98页 |
| ·节间培养与微繁 | 第94-95页 |
| ·试管苗开花研究进展 | 第95-97页 |
| ·展望 | 第97-98页 |
| 2. 材料与方法 | 第98-100页 |
| ·材料与药品 | 第98-99页 |
| ·方法 | 第99-100页 |
| 3. 结果与分析 | 第100-101页 |
| ·NAA、BA与TDZ组合对竹子侧芽生长的影响 | 第100页 |
| ·利用TDZ、2，4-D来诱导竹子侧芽愈伤组织 | 第100-101页 |
| ·单独使用TDZ、2，4-D、BA或NAA对竹子外植体褐变的影响 | 第101页 |
| ·试验TDZ、2，4-D与抗氧化剂对竹子侧芽生长与褐变的影响 | 第101页 |
| 4. 讨论 | 第101-103页 |
| ·外植体的选择 | 第101页 |
| ·消毒措施与污染问题 | 第101-102页 |
| ·不同激素对竹子侧芽萌发与生长的作用 | 第102页 |
| ·竹子组织培养中的褐变问题 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-110页 |
| 致谢 | 第110页 |
