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人类未知基因MGC13096的鉴定与功能研究

中文摘要第1-9页
Abstract第9-11页
本文的创新点第11-12页
第一部分 研究目的和设计思路第12-14页
   ·研究目的第12页
   ·设计思路第12-13页
   ·技术路线框架第13-14页
第二部分 文献综述第14-40页
   ·MGC13096、PDCD2的基本资料及基因分类(Gene ontology)第14-24页
     ·MGC13096的基本资料第14-16页
     ·Gene ontology对 MGC13096的功能和细胞内定位电子预测第16-17页
     ·PDCD2的基本资料第17-24页
   ·Gene ontology介绍第24-25页
   ·如何研究基因功能第25-38页
     ·获得基因第25-26页
     ·组织表达谱分析第26页
     ·基因调节第26页
     ·蛋白质细胞定位第26页
     ·蛋白质相互作用第26-28页
     ·基因功能研究策略第28-38页
 参考文献第38-40页
第三部分 实验材料和方法第40-51页
   ·生物信息学分析第40-41页
     ·在细胞中的定位分析第40页
     ·组织表达谱和发育表达谱第40页
     ·保守结构域分析第40页
     ·转录因子结合位点分析第40页
     ·基因表达谱分析第40-41页
   ·MGC13096、PDCD2转录本1、2编码区(CDS)的克隆第41-42页
     ·RT-PCR MGC13096及真核表达载体的构建第41-42页
     ·RT-PCR PDCD2两个转录本第42页
     ·与NCBI Genbank数据库里的序列比对第42页
   ·细胞 DNA提取第42-43页
   ·MGC13096、PDCD2在凋亡细胞中的表达第43-44页
     ·细胞培养第43页
     ·荧光定量 PCR法鉴定 MGC13096、PDCD2的表达第43-44页
     ·流式细胞术分析凋亡组细胞和正常细胞的亚 G0期百分比第44页
   ·细胞转染第44页
   ·HEK293T、pcDNA3.1/293T、MGC13096-pcDNA3.1/293T细胞的生长周期分析,生长曲线,凋亡分析第44-45页
     ·细胞生长周期分析第44-45页
     ·细胞生长曲线第45页
     ·凋亡分析第45页
   ·荧光素酶法寻找 MGC13096影响的细胞通路第45-46页
     ·细胞培养第45页
     ·制备 DNA-Lipfectamine TM2000复合物第45-46页
     ·转染第46页
     ·数据处理第46页
   ·Pull down寻找 MGC13096的相互作用蛋白第46-49页
     ·细胞培养第46页
     ·原核表达 MGC13096第46-47页
     ·Pull-down实验第47-49页
     ·蛋白质鉴定第49页
   ·主要分析测试仪器第49-50页
 参考文献第50-51页
第四部分 结果和讨论第51-92页
   ·MGC13096的生物信息学分析第51-55页
     ·Results of Subprograms第51-52页
     ·Results of the k-NN Prediction第52页
     ·MGC13096的组织和发育表达谱第52-53页
     ·MGC13096的基因表达谱分析第53-55页
   ·PDCD2的生物信息学分析第55-70页
     ·Results of Subprograms第55-57页
     ·Results of the k-NN Prediction第57页
     ·PDCD2的组织和发育表达谱第57-58页
     ·PDCD2的保守结构域第58-59页
     ·转录因子结合位点第59-61页
     ·PDCD2基因表达谱分析第61-70页
   ·MGC13096、PDCD2转录本1、2编码区(CDS)及 PDCD2_C domain的克隆及序列比对第70-72页
   ·MGC13096、PDCD2在凋亡细胞中的表达第72-76页
     ·流式细胞仪分析凋亡细胞和正常细胞的亚 G0期百分比第72-75页
     ·MGC13096、PDCD2在凋亡细胞中的表达第75-76页
   ·MGC13096的过表达引起细胞生长变缓不是凋亡引起的第76-81页
     ·B12细胞中MGC13096的表达比293T和 H5增加了9倍还多第77页
     ·H5,B12细胞生长曲线第77-78页
     ·HEK293T、H5、B12细胞的生长周期分析第78页
     ·HEK293T、H5、B12细胞凋亡分析第78-81页
   ·荧光素酶法寻找 MGC13096影响的细胞通路第81页
   ·Pull down寻找 MGC13096的相互作用蛋白第81-88页
     ·MGC13096-pET32a/BL21(DE3)在几种培养基中的生长曲线第82-83页
     ·原核表达 MGC13096第83-84页
     ·原核表达 PDCD2_C domain第84页
     ·Pull-down实验第84-85页
     ·蛋白质鉴定第85-88页
   ·进一步的研究展望第88页
 参考文献第88-92页
附录1: 细菌培养基配方第92页
附录2: MGC13096的测序报告第92-95页
附录3: 凋亡细胞中MGC13096、PDCD2、18s rRNA的表达第95-99页
附录4: 293T、H5、B12细胞中MGC13096、18s rRNA的表达第99-102页
附录5: MGC13096相互作用蛋白质谱图第102-105页
附录6: 博士生期间发表的论文第105-106页
致谢第106页

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