| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第一章 引言 | 第8-15页 |
| ·海洋细菌及其生态功能 | 第8-10页 |
| ·海洋细菌在微食物环中的作用 | 第8-9页 |
| ·海洋细菌在碎屑食物链中的作用 | 第9-10页 |
| ·国内外研究进展 | 第10-11页 |
| ·微生物群落结构分析方法 | 第11-14页 |
| ·变性梯度凝胶电泳（DGGE） | 第12页 |
| ·末端限制性片段长度多态性(T-RFLP) | 第12页 |
| ·荧光原位杂交法（FISH） | 第12-13页 |
| ·16S rDNA 文库构建 | 第13-14页 |
| ·本文研究内容及意义 | 第14-15页 |
| 第二章 材料与方法 | 第15-23页 |
| ·实验材料 | 第15-17页 |
| ·菌株和质粒 | 第15页 |
| ·实验引物 | 第15页 |
| ·主要试剂 | 第15-16页 |
| ·主要仪器 | 第16页 |
| ·培养基和溶液 | 第16-17页 |
| 2 .2 实验方法 | 第17-23页 |
| ·样品采集及前处理 | 第17-18页 |
| ·细菌基因组总DNA 提取 | 第18-19页 |
| ·总 DNA 提取结果检测 | 第19页 |
| ·16SrDNA PCR 产物扩增及纯化 | 第19-20页 |
| ·克隆载体连接 | 第20-21页 |
| ·菌落 PCR 法验证阳性克隆 | 第21页 |
| ·细菌16S rRNA 基因数据的分析处理和构建系统发育树 | 第21-22页 |
| ·样本间细菌群落相似性 | 第22-23页 |
| 第三章 结果 | 第23-43页 |
| ·海藻场沉积物细菌群落的初步研究 | 第23-26页 |
| ·沉积物总 DNA 的提取及纯化 | 第23页 |
| ·细菌16SrDNA 测序 | 第23页 |
| ·系统进化分析 | 第23-26页 |
| ·海藻场及贻贝场表底层水样细菌群落结构异同 | 第26-36页 |
| ·水体样本DNA 的提取 | 第26页 |
| ·细菌16SrDNA 片段的 PCR 扩增 | 第26-27页 |
| ·16S rRNA 基因片段克隆文库分析 | 第27页 |
| ·样品中细菌群落组成 | 第27-29页 |
| ·样本中各细菌属组成 | 第29-31页 |
| ·样本间群落相似系数 | 第31页 |
| ·系统发育树分析 | 第31-36页 |
| ·海藻生长旺盛期海藻场细菌群落结构 | 第36-43页 |
| ·细菌 DNA 的提取及扩增 | 第36页 |
| ·样品中细菌群落结构 | 第36-37页 |
| ·样本中各细菌属组成 | 第37-39页 |
| ·系统发育树分析 | 第39-43页 |
| 第四章 讨论 | 第43-49页 |
| ·DNA 提取与扩增 | 第43页 |
| ·细菌群落结构及功能分析 | 第43-47页 |
| ·沉积物细菌群落结构 | 第43-44页 |
| ·水体样本细菌群落结构 | 第44-47页 |
| ·海藻场与贻贝场微生物类群的垂直分布和地理差异 | 第47页 |
| ·海藻场内细菌群落结构的季节及地理差异 | 第47-49页 |
| 第五章 结论 | 第49-50页 |
| 第六章 参考文献 | 第50-55页 |
| 致谢 | 第55页 |