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南海西部海域沉积物细菌多样性的初步研究

摘要第1-9页
Abstract第9-10页
第一章 绪论第10-25页
   ·海洋细菌研究概况第10-11页
   ·海洋细菌的活性及其群落结构与功能第11-12页
   ·微生物群落结构分析方法的发展第12-15页
     ·传统微生物纯培养技术的局限性第12-13页
     ·微生物培养技术的改进策略第13-15页
   ·微生物分子生态学涉及的主要研究方法第15-19页
     ·标记核酸探针杂交技术第15-16页
     ·基于PCR技术的研究方法第16-18页
     ·微生物基因组中特异DNA片段的序列分析第18页
     ·DNA扩增片段电泳检测技术第18-19页
     ·环境基因组DNA提取方法第19页
   ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术及其应用 #1O第19-23页
     ·DGGE基本原理及其在微生物群落结构分析中的应用第19-21页
     ·DGGE技术在微生物生态学研究中的应用第21-23页
     ·DGGE技术自身存在的不足及实验控制第23页
   ·对南海西部海域沉积物细菌进行研究的意义第23-25页
第二章 材料与方法第25-40页
   ·材料第25-31页
     ·样品采集第25页
     ·菌株和质粒第25-26页
     ·主要试剂第26页
     ·试剂盒和工具酶第26页
     ·引物第26-27页
     ·主要仪器第27-28页
     ·培养基第28-29页
     ·溶液配制第29-31页
     ·分析软件第31页
   ·方法第31-40页
     ·沉积物中细菌的培养和分离纯化第31-32页
     ·液体培养后细菌多样性检测第32-35页
     ·平板培养后细菌鉴定第35页
     ·产物的回收和测序第35-38页
     ·感受态细胞的制备第38-40页
第三章 结果与讨论第40-51页
   ·沉积物中细菌多样性分析第40-41页
   ·沉积物中细菌的鉴定第41-50页
     ·DNA提取、扩增及RFLP分型第41-45页
     ·细菌生理生化实验结果第45-47页
     ·基于16SrDNA序列的同源性分析以及系统发育树的构建第47-50页
   ·结论与展望第50-51页
参考文献第51-57页
附录第57-73页
 附录1 16SrDNA测序结果第57-70页
 附录2 DNA分子量标准第70-71页
 附录3 缩略语对照表第71-72页
 附录4 攻硕期间参加的科研项目第72页
 附录5 攻硕期间发表及待发表论文第72-73页
致谢第73页

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