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前列腺癌小鼠模型差异表达基因的筛选及TRIM59基因功能的初步研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 文献综述第12-35页
   ·前言第12页
   ·前列腺癌的小鼠模型第12-21页
     ·前列腺癌动物模型种类第12-15页
     ·转基因小鼠模型的分类第15-21页
   ·与前列腺癌的相关基因研究进展第21-24页
     ·癌基因第21-22页
     ·抑癌基因第22-24页
   ·基因芯片技术第24-29页
     ·基因芯片技术原理及步骤第24-26页
     ·基因芯片在肿瘤研究中的应用第26-29页
   ·生物信息学与新基因功能的预测第29-35页
     ·新基因及其功能的预测第29-31页
     ·蛋白质结构与功能预测及方法第31-35页
第二章 小鼠前列腺癌差异表达基因的筛选第35-52页
   ·材料第35-36页
     ·试验样品第35页
     ·主要试剂第35页
     ·基因芯片第35页
     ·主要仪器第35-36页
   ·方法第36-41页
     ·总RNA 的提取第36页
     ·总RNA 的纯化第36-37页
     ·基因芯片的操作流程第37页
     ·基因芯片结果的分析第37页
     ·RT-PCR 实验第37-39页
     ·SYBR Green(?) I 实时荧光PCR 检测法第39-41页
   ·结果第41-48页
     ·总RNA 的制备第41-42页
     ·基因芯片的杂交结果第42-43页
     ·上调表达基因数量第43页
     ·上调差异表达基因分析第43-46页
     ·相关候选基因的RT-PCR 检测第46页
     ·相关候选基因的实时荧光定量法检测第46-48页
   ·讨论第48-51页
     ·KIMAP 前列腺癌小鼠模型第48-49页
     ·利用基因芯片技术进行差异表达基因检测第49页
     ·芯片结果的验证第49-50页
     ·差异表达基因第50-51页
   ·小结第51-52页
第三章 小鼠TRIM59 基因的克隆及生物信息学分析第52-66页
   ·材料第52-53页
     ·载体和菌株第52页
     ·组织样品第52页
     ·主要试剂第52页
     ·主要溶液配制第52-53页
     ·主要仪器第53页
   ·方法第53-57页
     ·总RNA 的提取第53-54页
     ·引物设计与合成第54页
     ·RT-PCR第54-55页
     ·PCR 产物的回收第55页
     ·连接第55页
     ·转化第55-56页
     ·菌落PCR第56-57页
     ·阳性克隆cDNA 片断测序及序列分析第57页
   ·结果与分析第57-63页
     ·组织中总RNA 的提取及检测第57-58页
     ·小鼠TRIM59 基因编码区的克隆第58页
     ·小鼠TRIM59 基因的生物信息学分析第58-63页
   ·讨论第63-65页
     ·小鼠TRIM59 编码区的克隆及物种间相似比对第63页
     ·关于TRIM59 基因的功能分析第63-64页
     ·生物信息学分析第64-65页
   ·小结第65-66页
第四章 小鼠TRIM59 基因的原核表达第66-77页
   ·材料第66-67页
     ·载体及宿主菌第66页
     ·cDNA 模板第66页
     ·主要试剂第66页
     ·主要仪器第66-67页
   ·方法第67-71页
     ·引物设计第67页
     ·克隆载体的构建第67-68页
     ·原核表达载体的构建第68-69页
     ·重组蛋白的诱导表达与纯化第69-70页
     ·表达产物的SDS-PAGE 分析第70-71页
   ·结果第71-74页
     ·pMD18-TRIM59 克隆载体的构建第71页
     ·pGEX-2T-TRIM59 原核表达载体的构建第71-72页
     ·pGEX-2T-TRIM59 质粒的表达目的蛋白的诱导表达与纯化第72-73页
     ·Western Blotting 检测第73-74页
   ·讨论第74-76页
     ·表达系统的选择与TRIM59 抗原序列的确定第74-75页
     ·TRIM59 重组蛋白的表达与纯化第75-76页
   ·小结第76-77页
第五章 TRIM59 兔抗鼠多克隆抗体的制备第77-89页
   ·材料第77-78页
     ·实验动物第77页
     ·抗原蛋白第77页
     ·质粒及细胞株第77页
     ·主要试剂第77-78页
     ·实验仪器第78页
   ·方法第78-81页
     ·抗原乳化第78页
     ·动物接种第78页
     ·抗血清的收集第78-79页
     ·抗血清的纯化第79页
     ·抗体稀释效价的测定(间接法ELISA)第79页
     ·细胞的复苏第79页
     ·细胞传代培养第79-80页
     ·细胞转染第80页
     ·Western Blotting 检测抗体第80-81页
     ·免疫荧光第81页
     ·免疫组织化学染色第81页
   ·结果第81-86页
     ·多克隆抗体的效价鉴定第81-82页
     ·多克隆抗体的Western blotting 检测第82-85页
     ·TRIM59 在NIH3T3 细胞中的定位第85页
     ·TRIM59 在前列腺癌组织中的表达第85-86页
   ·讨论第86-88页
     ·多克隆抗体的制备第86-87页
     ·多克隆抗体的鉴定第87页
     ·TRIM59 定位于NIH3T3 细胞胞浆中第87-88页
     ·TRIM59 在前列腺癌组织中的表达第88页
   ·小结第88-89页
第六章 TRIM59 的RING 结构域功能研究第89-101页
   ·材料第89-90页
     ·质粒和细胞第89页
     ·主要试剂第89-90页
     ·实验仪器第90页
   ·方法第90-94页
     ·引物设计第90页
     ·pEBG-TRIM59 点突变载体构建第90-91页
     ·细胞的复苏第91页
     ·细胞传代培养第91页
     ·细胞转染第91-92页
     ·真核表达的GST 融合蛋白的纯化第92页
     ·细胞总蛋白的定量第92页
     ·Western Blot 检测第92-93页
     ·GST pull-down 实验第93页
     ·体外泛素化修饰实验第93页
     ·免疫沉淀实验第93页
     ·体内泛素化修饰实验第93-94页
   ·结果第94-99页
     ·pEBG-TRIM59 点突变载体的构建第94页
     ·GST 融合蛋白在细胞293T 中的表达第94-95页
     ·TRIM59 蛋白的体外泛素化修饰第95-96页
     ·TRIM59 只能和特定的泛素结合酶E2 共同催化泛素化反应第96-97页
     ·TRIM59 的RING 结构域具有泛素E3 连接酶活性第97-98页
     ·TRIM59 蛋白的体内泛素化修饰第98-99页
   ·讨论第99-100页
     ·蛋白质泛素化第99页
     ·TRIM59 的泛素连接酶E3 活性第99页
     ·RING 结构是TRIM59 具有泛素连接酶E3 活性主要功能区第99-100页
     ·TRIM59 的C13A 点突变引入第100页
   ·小结第100-101页
第七章 结论第101-103页
   ·主要结论第101-102页
   ·本研究的创新点第102页
   ·进一步研究内容第102-103页
参考文献第103-114页
缩略词第114-115页
致谢第115-116页
个人简介第116页

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