| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-27页 |
| ·国内外肉牛业的现状及发展趋势 | 第13-14页 |
| ·本研究中主要牛品种简介 | 第14-16页 |
| ·南阳牛 | 第14页 |
| ·郏县红牛 | 第14-15页 |
| ·秦川牛 | 第15页 |
| ·中国荷斯坦牛 | 第15-16页 |
| ·分子育种与遗传标记 | 第16-19页 |
| ·分子育种 | 第16-17页 |
| ·DNA 分子标记 | 第17页 |
| ·SNP 标记技术及其发展 | 第17-19页 |
| ·候选基因的研究进展 | 第19-27页 |
| ·LHX4 基因研究进展 | 第19-22页 |
| ·脂肪酶成熟因子 1 基因研究进展 | 第22-27页 |
| 第二章 材料与方法 | 第27-38页 |
| ·试验材料 | 第27-30页 |
| ·试验动物样本来源 | 第27页 |
| ·试验数据的收集 | 第27页 |
| ·试验主要试剂 | 第27-28页 |
| ·溶液与缓冲液 | 第28-29页 |
| ·仪器设备 | 第29-30页 |
| ·试验方法 | 第30-35页 |
| ·血样的采集 | 第30页 |
| ·牛全血基因组DNA 的提取 | 第30页 |
| ·PCR 反应所用引物的设计 | 第30-31页 |
| ·DNA 质量的检测、纯化及浓度计算 | 第31-33页 |
| ·扩增产物的PCR-RFLP 分析 | 第33-34页 |
| ·图像分析 | 第34页 |
| ·扩增产物的PCR-SSCP 分析 | 第34-35页 |
| ·测序 | 第35页 |
| ·牛LMF1、LHX4 基因生物信息学分析 | 第35页 |
| ·资料的统计与分析 | 第35-38页 |
| ·基因频率和基因型频率的计算 | 第35-36页 |
| ·基因频率和基因型频率的差异显著性检验(χ~2 独立性检验) | 第36页 |
| ·位点遗传纯合度(Ho)、杂合度(He)和有效等位基因数(Ne) | 第36页 |
| ·多态信息含量(PIC) | 第36页 |
| ·相关分析统计模型 | 第36-38页 |
| 第三章 候选基因遗传变异检测 | 第38-48页 |
| ·牛基因组DNA 样品的检测 | 第38页 |
| ·LHX4 基因SNP 检测 | 第38-40页 |
| ·PCR 扩增产物琼脂糖凝胶检测 | 第38-39页 |
| ·PCR-SSCP 检测及测序 | 第39-40页 |
| ·LHX4 基因E6 基因座的PCR-RFLP 检测 | 第40页 |
| ·LMF1 基因SNP 检测 | 第40-48页 |
| ·PCR 扩增产物琼脂糖凝胶检测 | 第40-42页 |
| ·PCR-SSCP 检测及测序 | 第42-45页 |
| ·LMF1 基因不同基因座的PCR-RFLP 检测 | 第45-48页 |
| 第四章 候选基因多态基因座的群体遗传学分析 | 第48-57页 |
| ·LHX4 基因群体遗传结构分析 | 第48-51页 |
| ·LHX4 基因E3 基因座 | 第48-49页 |
| ·LHX4 基因E6 基因座 | 第49-50页 |
| ·LHX4 基因E6 HaeⅢ基因座 | 第50-51页 |
| ·LMF1 基因群体遗传结构分析 | 第51-57页 |
| ·LMF1 基因E4 Ava? 基因座 | 第51-52页 |
| ·LMF1 基因E9-83 Ava? 基因座 | 第52-53页 |
| ·LMF1 基因E9-93 Ava? 基因座 | 第53-54页 |
| ·LMF1 基因E2、E3、E6H、E8A 基因座 | 第54-55页 |
| ·LMF1 基因E4、E6 基因座 | 第55-57页 |
| 第五章 候选基因多态性与南阳牛、秦川牛和郏县红牛生长性状相关分析 | 第57-76页 |
| ·南阳牛群体内各基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第57-69页 |
| ·南阳牛群体内LHX4 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第57-60页 |
| ·南阳牛群体内LMF1 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第60-69页 |
| ·秦川牛群体内各基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第69-72页 |
| ·秦川牛群体内LHX4 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第69-71页 |
| ·秦川牛群体内LMF1 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第71-72页 |
| ·郏县红牛群体内基因多态性与生长性状的相关分析 | 第72-76页 |
| ·郏县红牛群体内LHX4 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第72-74页 |
| ·郏县红牛群体内LMF1 基因多态基因座与生长性状的相关分析 | 第74-76页 |
| 第六章 LMF1、LHX4 基因的生物信息学分析 | 第76-80页 |
| ·牛LMF1 蛋白一级结构特征分析 | 第76页 |
| ·牛LMF1 基因的密码子分析 | 第76-77页 |
| ·牛LMF1 蛋白的Tmpred-跨膜结构分析 | 第77页 |
| ·牛LMF1 蛋白的功能域预测 | 第77-78页 |
| ·牛LHX4 基因的密码子分析 | 第78-79页 |
| ·牛LHX4 蛋白的功能域预测 | 第79-80页 |
| 第七章 讨论与结论 | 第80-86页 |
| ·讨论 | 第80-83页 |
| ·LHX4 基因多态性及其与生长性状相关分析 | 第80-82页 |
| ·LMF1 基因多态性及其与生长性状相关分析 | 第82-83页 |
| ·结论 | 第83-84页 |
| ·本研究创新点 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 作者简介 | 第92页 |
