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分子动力学模拟研究脂肪酶的催化机理

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 绪论第11-23页
   ·脂肪酶第11-16页
     ·脂肪酶简介第11页
     ·脂肪酶的应用第11-12页
     ·脂肪酶的结构和催化机制第12-13页
     ·南极假丝酵母脂肪酶第13-16页
   ·非水相酶学第16-17页
   ·脂肪酶的热稳定性第17-18页
   ·分子动力学模拟第18-21页
   ·分子动力学模拟研究脂肪酶催化机理第21页
   ·本论文的主要思路和研究内容第21-23页
第二章 有机溶剂极性对南极假丝酵母脂肪酶B构象活力的影响第23-41页
   ·前言第23-24页
   ·计算方法第24-27页
     ·总体方法介绍第24-25页
     ·酶的预处理第25页
     ·溶剂模型的参数化第25页
     ·分子动力学模拟第25-26页
     ·QM/MM模拟第26页
     ·溶剂中计算活化能的方法第26-27页
   ·结果和讨论第27-41页
     ·CALB总体构象变化第28-31页
     ·CALB活性部位局部构象的变化第31-34页
     ·CALB活性位点构象的变化第34-37页
     ·溶剂分子对CALB活性位点构象变化的影响第37-39页
     ·结论第39-41页
第三章 分子动力学模拟研究不同浓度的甲醇溶液对脂肪酶的活力构象的影响第41-49页
   ·前言第41页
   ·计算方法第41-42页
     ·CALB初始结构预处理第41-42页
     ·模拟中的溶剂模型第42页
     ·分子动力学模拟过程第42页
   ·结果与讨论第42-49页
     ·总体结构变化第42-44页
     ·二级结构变化第44-45页
     ·活性中心变化第45-47页
     ·活性中心附近溶剂分子变化第47页
     ·结论第47-49页
第四章 分子动力学模拟研究橄榄油(OLIVE OIL)对脂肪酶热稳定性的影响第49-57页
   ·前言第49页
   ·计算方法第49-50页
     ·CRL初始结构预处理第50页
     ·模拟中的olive oil模型第50页
     ·分子动力学模拟过程第50页
   ·结果与讨论第50-57页
     ·总体构象变化分析第51-52页
     ·二级构象变化分析第52-53页
     ·柔性变化分析第53-54页
     ·CRL与olive oil结合构象分析第54-55页
     ·结论第55-57页
第五章 结论第57-59页
参考文献第59-63页
附录 模拟软件第63-65页
致谢第65-66页
研究成果及发表的学术论文第66-68页
作者和导师简介第68-69页
北京化工大学硕士研究生学位论文答辩委员会决议书第69-70页

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