| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-44页 |
| 第一节 线粒体脂肪酸β-氧化概述 | 第15-22页 |
| ·脂肪酸的活化 | 第16-17页 |
| ·脂酰CoA的转移 | 第17-18页 |
| ·线粒体β-氧化循环 | 第18-19页 |
| ·线粒体脂肪酸β-氧化的生理意义 | 第19-20页 |
| ·线粒体脂肪酸β-氧化紊乱导致的相关疾病 | 第20页 |
| ·线虫线粒体β-氧化的结构生物学研究的意义 | 第20-22页 |
| 第二节 极长链脂酰CoA脱氢酶 | 第22-36页 |
| ·脂酰CoA脱氢酶家族 | 第22-23页 |
| ·短链和中链脂酰CoA脱氢酶 | 第23-26页 |
| ·短链和中链脂酰CoA脱氢酶的生化性质及功能 | 第23-24页 |
| ·短链和中链脂酰CoA脱氢酶的结构 | 第24-26页 |
| ·长链脂酰CoA脱氢酶 | 第26-30页 |
| ·长链脂酰CoA脱氢酶的生化特性及功能 | 第26-27页 |
| ·长链脂酰CoA脱氢酶在脂酰CoA脱氢酶家族中的特殊性 | 第27-30页 |
| ·极长链脂酰CoA脱氢酶 | 第30-33页 |
| ·极长链脂酰CoA脱氢酶的生化性质及功能 | 第30页 |
| ·ACAD-9简介 | 第30-31页 |
| ·极长链脂酰CoA脱氢酶的三维结构 | 第31-33页 |
| ·过氧化物酶体的脂酰CoA氧化酶简介 | 第33-35页 |
| ·脂酰CoA氧化酶与脂酰CoA脱氢酶的功能差别 | 第33-34页 |
| ·脂酰CoA氧化酶与脂酰CoA脱氢酶的结构差别 | 第34-35页 |
| ·线虫线粒体极长链脂酰CoA脱氢酶的结构生物学研究的意义 | 第35-36页 |
| 第三节 烯脂酰CoA水合酶 | 第36-40页 |
| ·烯脂酰CoA水合酶的功能 | 第36-37页 |
| ·烯脂酰CoA水合酶的结构 | 第37-39页 |
| ·线虫线粒体烯脂酰CoA水合酶的结构生物学研究的意义 | 第39-40页 |
| 第四节 硫解酶 | 第40-43页 |
| ·硫解酶的功能 | 第40页 |
| ·硫解酶的结构 | 第40-42页 |
| ·线虫线粒体硫解酶的结构生物学研究的意义 | 第42-43页 |
| 第五节 本章小结 | 第43-44页 |
| 第二章 蛋白质晶体生长和相位问题 | 第44-56页 |
| 第一节 蛋白质晶体生长的原理与方法 | 第45-49页 |
| ·蛋白质晶体生长原理 | 第45-47页 |
| ·蛋白质晶体生长方法 | 第47-49页 |
| ·批量结晶法 | 第47页 |
| ·液液扩散法 | 第47页 |
| ·透析法 | 第47页 |
| ·气相扩散法 | 第47-49页 |
| 第二节 蛋白质晶体学的中心问题——相位问题 | 第49-56页 |
| ·分子置换法(Molecular Replacement) | 第50-52页 |
| ·反常散射法(Anomalous Scattering) | 第52-56页 |
| 第三章 线虫线粒体极长链脂酰CoA脱氢酶的结构生物学研究 | 第56-91页 |
| 第一节 实验方法 | 第57-61页 |
| ·cVLCAD的基因克隆和重组蛋白序列分析 | 第57-58页 |
| ·cVLCAD的表达与纯化 | 第58-59页 |
| ·偶联多角度静态光散射的体积排阻凝胶层析实验(size exclusionchromatography with multiple multi-angle light scattering detection,SEC-MALS) | 第59页 |
| ·cVLCAD晶体生长条件的筛选与优化 | 第59页 |
| ·cVLCAD晶体衍射数据的收集及处理 | 第59-61页 |
| 第二节 实验结果 | 第61-75页 |
| ·cVLCAD的序列特点与相关性质 | 第61页 |
| ·cVLCAD的表达纯化 | 第61-65页 |
| ·cVLCAD纯化条件的优化 | 第61-65页 |
| ·cVLCAD蛋白浓度的测定 | 第65页 |
| ·cVLCAD聚合状态的确定 | 第65-66页 |
| ·cVLCAD晶体生长条件的优化 | 第66-67页 |
| ·数据处理 | 第67-71页 |
| ·分子置换法结构解析 | 第71-75页 |
| ·模型的建立 | 第71-72页 |
| ·相位求解 | 第72页 |
| ·结构修正 | 第72-75页 |
| 第三节 分析与讨论 | 第75-90页 |
| ·cVLCAD单体结构描述 | 第75-77页 |
| ·cVLCAD特殊的聚合状态 | 第77-82页 |
| ·底物结合位点与催化功能 | 第82-90页 |
| 第四节 本章小结与展望 | 第90-91页 |
| 第四章 线虫线粒体烯脂酰CoA水合酶的结构生物学研究 | 第91-112页 |
| 第一节 实验方法 | 第92-94页 |
| ·cECH的基因克隆和重组蛋白序列分析 | 第92页 |
| ·母体cECH蛋白的诱导表达与分离纯化 | 第92页 |
| ·偶联多角度静态光散射的体积排阻凝胶层析实验 | 第92页 |
| ·cECH硒代甲硫氨酸蛋白衍生物(Se-cECH)的表达纯化 | 第92-93页 |
| ·结晶条件的摸索 | 第93页 |
| ·数据收集 | 第93-94页 |
| 第二节 实验结果 | 第94-102页 |
| ·重组表达质粒的构建与重组蛋白序列分析 | 第94页 |
| ·cECH与Se-cECH的分离纯化 | 第94-96页 |
| ·cECH蛋白聚合状态的确定 | 第96-97页 |
| ·晶体生长与晶体衍射 | 第97-99页 |
| ·晶体衍射与数据处理 | 第99-102页 |
| 第三节 分析与讨论 | 第102-111页 |
| ·cECH晶体是由三套空间群为P2_1的晶格组成的"三晶" | 第102-103页 |
| ·cECH结构解析 | 第103-107页 |
| ·cECH"三晶"衍射数据的"去三晶"处理 | 第103-105页 |
| ·结构解析与修正 | 第105-107页 |
| ·cECH的三维结构 | 第107-111页 |
| 第四节 本章小结与展望 | 第111-112页 |
| 第五章 线虫线粒体硫解酶的结构生物学研究 | 第112-137页 |
| 第一节 实验方法 | 第113-115页 |
| ·cTHL的基因克隆和重组蛋白序列分析 | 第113页 |
| ·cTHL蛋白的诱导表达与分离纯化 | 第113页 |
| ·偶联多角度静态光散射的体积排阻凝胶层析实验 | 第113页 |
| ·cTHL晶体生长条件的筛选与优化 | 第113-114页 |
| ·晶体衍射与数据收集 | 第114-115页 |
| 第二节 实验结果 | 第115-126页 |
| ·重组表达质粒的构建与重组蛋白序列分析 | 第115页 |
| ·cTHL的分离纯化 | 第115-116页 |
| ·cTHL聚合状态的确定 | 第116页 |
| ·cTHL晶体生长条件的优化 | 第116-119页 |
| ·晶体衍射与数据处理 | 第119-122页 |
| ·结构解析 | 第122-126页 |
| ·模型的建立 | 第122-123页 |
| ·相位求解 | 第123页 |
| ·结构修正 | 第123-126页 |
| 第三节 分析与讨论 | 第126-136页 |
| ·cTHL晶体结构描述 | 第126-127页 |
| ·cTHL底物结合位点 | 第127-130页 |
| ·cTHL四聚体的聚合状态与其功能的关系 | 第130-136页 |
| 第四节 本章小结与展望 | 第136-137页 |
| 第六章 结论 | 第137-139页 |
| 参考文献 | 第139-151页 |
| 附录1 英文缩写 | 第151-153页 |
| 附录2 个人简历 | 第153-154页 |
| 附录3 在学期间发表的学术论文情况 | 第154-155页 |
| 致谢 | 第155-156页 |
